基于雙層耦合網(wǎng)的表型-基因關(guān)聯(lián)分析與預(yù)測
發(fā)布時間:2021-10-23 20:57
隨著基因組測序完成和基因技術(shù)不斷發(fā)展,使得某些疾病的致病基因逐漸得到確認(rèn)。目前,通過科學(xué)實驗已經(jīng)掌握了一部分疾病的致病原因,但是大部分疾病的致病原因,特別是與基因相關(guān)的疾病的致病原因還不得而知。該文采用與人類同源相似度高達(dá)85%的小鼠數(shù)據(jù)作為研究對象,使用疾病表型數(shù)據(jù)集、致病基因數(shù)據(jù)集和已經(jīng)確認(rèn)的表型-基因關(guān)聯(lián)關(guān)系數(shù)據(jù)集構(gòu)成一個雙層耦合網(wǎng)絡(luò),通過元路徑上隨機(jī)游走的方法進(jìn)行數(shù)據(jù)的分析與挖掘,在已經(jīng)確認(rèn)的表型-基因關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)基礎(chǔ)上預(yù)測未確定的表型-基因關(guān)聯(lián)關(guān)系。經(jīng)驗證比較,該文提出的算法所取得的預(yù)測效果優(yōu)于其他算法。
【文章來源】:電子科技大學(xué)學(xué)報. 2020,49(03)北大核心EICSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
表型關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)示意圖
基因關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)示意圖
表型-基因關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)示意圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]隨機(jī)游走技術(shù)在網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)中的研究進(jìn)展[J]. 李敏,王曉桐,羅慧敏,孟祥茂,王建新. 電子學(xué)報. 2018(08)
[2]基于Katz增強(qiáng)歸納型矩陣補(bǔ)全的基因-疾病關(guān)聯(lián)關(guān)系預(yù)測[J]. 浦建宇,陳蕾,邵楷. 計算機(jī)科學(xué)與探索. 2019(07)
[3]miRNA與疾病關(guān)聯(lián)關(guān)系預(yù)測算法[J]. 郭茂祖,王詩鳴,劉曉燕,田偵. 軟件學(xué)報. 2017(11)
[4]關(guān)注耦合網(wǎng)絡(luò)及其傳播動力學(xué)研究[J]. 唐明,崔愛香,龔凱. 復(fù)雜系統(tǒng)與復(fù)雜性科學(xué). 2011(02)
碩士論文
[1]基于鏈路預(yù)測的長非編碼RNA-疾病關(guān)聯(lián)預(yù)測方法[D]. 鄭經(jīng)龍.西安電子科技大學(xué) 2015
本文編號:3453905
【文章來源】:電子科技大學(xué)學(xué)報. 2020,49(03)北大核心EICSCD
【文章頁數(shù)】:7 頁
【部分圖文】:
表型關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)示意圖
基因關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)示意圖
表型-基因關(guān)聯(lián)網(wǎng)絡(luò)示意圖
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]隨機(jī)游走技術(shù)在網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)中的研究進(jìn)展[J]. 李敏,王曉桐,羅慧敏,孟祥茂,王建新. 電子學(xué)報. 2018(08)
[2]基于Katz增強(qiáng)歸納型矩陣補(bǔ)全的基因-疾病關(guān)聯(lián)關(guān)系預(yù)測[J]. 浦建宇,陳蕾,邵楷. 計算機(jī)科學(xué)與探索. 2019(07)
[3]miRNA與疾病關(guān)聯(lián)關(guān)系預(yù)測算法[J]. 郭茂祖,王詩鳴,劉曉燕,田偵. 軟件學(xué)報. 2017(11)
[4]關(guān)注耦合網(wǎng)絡(luò)及其傳播動力學(xué)研究[J]. 唐明,崔愛香,龔凱. 復(fù)雜系統(tǒng)與復(fù)雜性科學(xué). 2011(02)
碩士論文
[1]基于鏈路預(yù)測的長非編碼RNA-疾病關(guān)聯(lián)預(yù)測方法[D]. 鄭經(jīng)龍.西安電子科技大學(xué) 2015
本文編號:3453905
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/yysx/3453905.html
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