最小一乘估計(jì)在多重檢驗(yàn)中的應(yīng)用——基于乳腺癌微陣列數(shù)據(jù)
發(fā)布時(shí)間:2020-02-27 07:30
【摘要】:運(yùn)用多重檢驗(yàn)方法對(duì)高維數(shù)據(jù)進(jìn)行推斷統(tǒng)計(jì)分析.首先將最小一乘估計(jì)算法應(yīng)用在多重檢驗(yàn)分析中,構(gòu)造出新的估計(jì)真實(shí)零假設(shè)個(gè)數(shù)的方法.其次對(duì)最小一乘與最小二乘方法估計(jì)真實(shí)零假設(shè)個(gè)數(shù)的準(zhǔn)確性進(jìn)行模擬比較分析,模擬結(jié)果表明前者較后者估算結(jié)果更準(zhǔn)確.最后,將上述估計(jì)方法應(yīng)用于乳腺癌微陣列數(shù)據(jù)的分析中尋找有表達(dá)差異的基因.檢驗(yàn)結(jié)果共找到118個(gè)差異基因,其中85個(gè)基因在生物學(xué)上是有效基因,實(shí)證表明該方法具有一定的實(shí)用性.
【圖文】:
180逡逑數(shù)學(xué)的實(shí)踐與認(rèn)識(shí)逡逑47卷逡逑邐表1在m=1000時(shí),第一次模擬各組的統(tǒng)計(jì)分析表邐逡逑m0邋的真值邐900邐910邐920邐930邐940邐950邐960邐970邐980邐990逡逑m0邋估計(jì)最小一乘估計(jì)邋932.邋90邋939.邋17邋945.37邋952.71邋959.06邋966.26邋973.邋40980.25邋986.邋44邋993.46逡逑值的均值最小二乘估計(jì)邋949.39邋952.98邋956.75邋961.53邋965.邋81邋970.邋96邋976.34邋981.92邋987.邋46邋993.57逡逑表2在m=5000時(shí),第二次模擬各組的統(tǒng)計(jì)分析表邐逡逑m0邋的真值邐4500邐4550邐4600邐4650邐4700邐4750邐4800邐4850邐4900邐4950逡逑m0邋估計(jì)最小一乘估計(jì)邋4645.59邋4680.35邋4716.49邋4752.30邋4788.33邋4825.38邋4862.04邋4898.44邋4933.87邋4968.87逡逑值的均值最小二乘估計(jì)邋4748.61邋4767.11邋4787.62邋4808.86邋4831.60邋4856.28邋4882.20邋4909.89邋4938.85邋4969.90逡逑最小一乘估計(jì)、最小二乘估計(jì)下的m0與其真值的比較邐最小一乘估計(jì)、最小二乘估計(jì)下的mO與其真值的比較逡逑123456789邐10邐1邐23456789邐10逡逑組次邐組*逡逑圖1第一次模擬(m=邋1000)邐圖2第二次模擬(m=5000)逡逑為了更進(jìn)一步地比較這兩種不同方法的準(zhǔn)確性,采用樣本不需要滿足正態(tài)假設(shè)和方差齊逡逑次性假設(shè)的Krwsfcd邋-邐秩和檢
劉金元,等:最小一乘估計(jì)在多重檢驗(yàn)中的應(yīng)用一 ̄?基于乳腺癌微陣列數(shù)據(jù)逡逑181逡逑21期逡逑準(zhǔn)確一些.逡逑不同估計(jì)方法下的mO值邐不同估計(jì)方法下的mO值逡逑12邐12逡逑estimate¥g邐estimateSg逡逑1-最小一乘估2-扢。慷涔溃椋欤姡保托∫欢涔溃椋戾澹澹玻敌∪綩Ti|逡逑圖3第一次模擬的第一組(m=1000,邋m0=900)邋圖4第二次模擬的第一組(m=5000,邋m0邋=4500)逡逑5多重檢驗(yàn)在基因微陣列數(shù)據(jù)中的應(yīng)用逡逑近年來,隨著高新科技的迅猛發(fā)展,越來越多的領(lǐng)域?qū)τ跀?shù)據(jù)處理的要求也越來越高,多逡逑重檢驗(yàn)已成為一種有效解決大規(guī)模統(tǒng)計(jì)推斷問題的新方法,其應(yīng)用范圍非常廣泛,尤其是在逡逑生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,基因組研究中提出了一種新技術(shù)一基因微陣列技術(shù),又稱為DNA微陣列逡逑技術(shù),是指在固體表面(玻璃片或尼龍膜)上固定數(shù)以萬計(jì)的人工合成的寡核苷酸片段或者逡逑DNA克隆片段,用熒光或者基因組DNA探針與之進(jìn)行雜交,從而同時(shí)快速檢測(cè)多個(gè)基因的逡逑表達(dá)水平的一項(xiàng)新技術(shù).這項(xiàng)技術(shù)的應(yīng)用之一就是檢測(cè)兩個(gè)不同條件下的基因表達(dá)是否存在逡逑差異,并從中識(shí)別出與條件相關(guān)的特異基因.逡逑5.1乳腺癌基因數(shù)據(jù)來源逡逑Hedenfalk邋et邋al(2001)公開發(fā)布了一個(gè)關(guān)于乳腺癌患者的基因表達(dá)數(shù)據(jù).在這組數(shù)據(jù)中,逡逑記錄了不同類型乳腺癌患者的基因表達(dá)水平;其中,共有兩種突變類型,分別為BRCA1型和逡逑BRCA2型.該資料提供了邋22例乳腺癌患者的3226個(gè)基因表達(dá)數(shù)據(jù),,這22例患者分為四組:逡逑第一組7例,為BRCA1突變類型;第二組8例,為BRCA2突變類型;第三組6例,為零星逡逑類型(家族遺傳史不清楚的患者
本文編號(hào):2583221
【圖文】:
180逡逑數(shù)學(xué)的實(shí)踐與認(rèn)識(shí)逡逑47卷逡逑邐表1在m=1000時(shí),第一次模擬各組的統(tǒng)計(jì)分析表邐逡逑m0邋的真值邐900邐910邐920邐930邐940邐950邐960邐970邐980邐990逡逑m0邋估計(jì)最小一乘估計(jì)邋932.邋90邋939.邋17邋945.37邋952.71邋959.06邋966.26邋973.邋40980.25邋986.邋44邋993.46逡逑值的均值最小二乘估計(jì)邋949.39邋952.98邋956.75邋961.53邋965.邋81邋970.邋96邋976.34邋981.92邋987.邋46邋993.57逡逑表2在m=5000時(shí),第二次模擬各組的統(tǒng)計(jì)分析表邐逡逑m0邋的真值邐4500邐4550邐4600邐4650邐4700邐4750邐4800邐4850邐4900邐4950逡逑m0邋估計(jì)最小一乘估計(jì)邋4645.59邋4680.35邋4716.49邋4752.30邋4788.33邋4825.38邋4862.04邋4898.44邋4933.87邋4968.87逡逑值的均值最小二乘估計(jì)邋4748.61邋4767.11邋4787.62邋4808.86邋4831.60邋4856.28邋4882.20邋4909.89邋4938.85邋4969.90逡逑最小一乘估計(jì)、最小二乘估計(jì)下的m0與其真值的比較邐最小一乘估計(jì)、最小二乘估計(jì)下的mO與其真值的比較逡逑123456789邐10邐1邐23456789邐10逡逑組次邐組*逡逑圖1第一次模擬(m=邋1000)邐圖2第二次模擬(m=5000)逡逑為了更進(jìn)一步地比較這兩種不同方法的準(zhǔn)確性,采用樣本不需要滿足正態(tài)假設(shè)和方差齊逡逑次性假設(shè)的Krwsfcd邋-邐秩和檢
劉金元,等:最小一乘估計(jì)在多重檢驗(yàn)中的應(yīng)用一 ̄?基于乳腺癌微陣列數(shù)據(jù)逡逑181逡逑21期逡逑準(zhǔn)確一些.逡逑不同估計(jì)方法下的mO值邐不同估計(jì)方法下的mO值逡逑12邐12逡逑estimate¥g邐estimateSg逡逑1-最小一乘估2-扢。慷涔溃椋欤姡保托∫欢涔溃椋戾澹澹玻敌∪綩Ti|逡逑圖3第一次模擬的第一組(m=1000,邋m0=900)邋圖4第二次模擬的第一組(m=5000,邋m0邋=4500)逡逑5多重檢驗(yàn)在基因微陣列數(shù)據(jù)中的應(yīng)用逡逑近年來,隨著高新科技的迅猛發(fā)展,越來越多的領(lǐng)域?qū)τ跀?shù)據(jù)處理的要求也越來越高,多逡逑重檢驗(yàn)已成為一種有效解決大規(guī)模統(tǒng)計(jì)推斷問題的新方法,其應(yīng)用范圍非常廣泛,尤其是在逡逑生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域,基因組研究中提出了一種新技術(shù)一基因微陣列技術(shù),又稱為DNA微陣列逡逑技術(shù),是指在固體表面(玻璃片或尼龍膜)上固定數(shù)以萬計(jì)的人工合成的寡核苷酸片段或者逡逑DNA克隆片段,用熒光或者基因組DNA探針與之進(jìn)行雜交,從而同時(shí)快速檢測(cè)多個(gè)基因的逡逑表達(dá)水平的一項(xiàng)新技術(shù).這項(xiàng)技術(shù)的應(yīng)用之一就是檢測(cè)兩個(gè)不同條件下的基因表達(dá)是否存在逡逑差異,并從中識(shí)別出與條件相關(guān)的特異基因.逡逑5.1乳腺癌基因數(shù)據(jù)來源逡逑Hedenfalk邋et邋al(2001)公開發(fā)布了一個(gè)關(guān)于乳腺癌患者的基因表達(dá)數(shù)據(jù).在這組數(shù)據(jù)中,逡逑記錄了不同類型乳腺癌患者的基因表達(dá)水平;其中,共有兩種突變類型,分別為BRCA1型和逡逑BRCA2型.該資料提供了邋22例乳腺癌患者的3226個(gè)基因表達(dá)數(shù)據(jù),,這22例患者分為四組:逡逑第一組7例,為BRCA1突變類型;第二組8例,為BRCA2突變類型;第三組6例,為零星逡逑類型(家族遺傳史不清楚的患者
【相似文獻(xiàn)】
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1 陳昊;多重檢驗(yàn)技術(shù)及其在微陣列數(shù)據(jù)分析中的應(yīng)用[D];華東交通大學(xué);2016年
本文編號(hào):2583221
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