【摘要】：研究發(fā)現(xiàn),通過(guò)全基因組關(guān)聯(lián)分析,找出與疾病相關(guān)的位點(diǎn)或基因,對(duì)于人們防治遺傳病,具有重要意義.首先,考慮固定效應(yīng)(SNP位點(diǎn))和隨機(jī)效應(yīng)(人群中的群體結(jié)構(gòu)和親緣關(guān)系),建立了混合線性模型,并且利用基于FDR標(biāo)準(zhǔn)的BH法對(duì)多重檢驗(yàn)的P值進(jìn)行校正,找出最有可能的致病位點(diǎn).其次,利用Fisher的P值組合方法,將基因所包含的所有SNP位點(diǎn)組合,找出與疾病最可能相關(guān)的基因.由于遺傳疾病可能與基因所包含的位點(diǎn)的子集關(guān)聯(lián),我們參考已有的ARTP模型,對(duì)模型進(jìn)行了改進(jìn).最后,建立多表型聯(lián)合模型MultiPhen找出與10個(gè)性狀有關(guān)聯(lián)的位點(diǎn).
[Abstract]:It is found that it is of great significance to find out the loci or genes related to disease through the whole genome association analysis for the prevention and treatment of genetic diseases. Firstly, considering the fixed effect (SNP locus) and random effect (population structure and kinship), a mixed linear model is established, and the P value of multiple test is corrected by BH method based on FDR standard. Identify the most likely disease-causing sites. Secondly, using the P value combination method of Fisher, all the SNP loci contained in the gene were combined to identify the genes most likely to be related to the disease. As genetic diseases may be associated with a subset of the loci contained in the gene, we have improved the model with reference to the existing ARTP model. Finally, the multiple phenotypic association model MultiPhen was established to identify the loci associated with 10 traits.
【作者單位】： 華中農(nóng)業(yè)大學(xué)信息學(xué)院;華中農(nóng)業(yè)大學(xué)經(jīng)濟(jì)管理學(xué)院;華中農(nóng)業(yè)大學(xué)資源與環(huán)境學(xué)院;
【分類號(hào)】：O212.1

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本文編號(hào)：2234245