本文關(guān)鍵詞：基于模塊距離與多源隨機(jī)游走的藥物重定位研究

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【摘要】：藥物重定位是指發(fā)現(xiàn)已經(jīng)上市藥物的新適應(yīng)癥,它對(duì)于目前新藥研發(fā)難、成本高、周期長(zhǎng)來(lái)說(shuō),無(wú)疑是一個(gè)非常有效的手段。藥物重定位最主要的目的就是利用計(jì)算方法,并綜合基因等生物數(shù)據(jù)去尋找潛在的藥物-疾病相關(guān)性,可以利用文獻(xiàn)挖掘、生物通路富集性分析等一系列手段來(lái)驗(yàn)證預(yù)測(cè)結(jié)果。目前,大多數(shù)藥物重定位方法都是考慮所有的疾病,缺乏針對(duì)性,因而預(yù)測(cè)結(jié)果不夠準(zhǔn)確�；谝陨显�,本文提出了兩個(gè)研究方案:(1)首先,將研究的疾病對(duì)象縮小到只有癌癥類疾病的范圍。然后,基于復(fù)雜網(wǎng)絡(luò)模塊距離計(jì)算方法,預(yù)測(cè)出這些癌癥疾病潛在的相關(guān)藥物。最后,通過(guò)對(duì)預(yù)測(cè)結(jié)果分析發(fā)現(xiàn)整體的預(yù)測(cè)結(jié)果較為可靠,但是其文獻(xiàn)挖掘與功能路徑富集性分析不夠理想,這可能與數(shù)據(jù)的不完整性有很大關(guān)系�；诖�,本文提出了第二個(gè)研究方案。(2)首先,將疾病的研究對(duì)象確定為肝癌。接著,基于多元隨機(jī)游走,計(jì)算與肝癌相關(guān)的基因集與其它藥物相關(guān)基因集之間的相似性。然后,基于該相似性建立藥物-藥物相似性網(wǎng)絡(luò),選擇與已知治療肝癌的藥物直接相連的藥物,并對(duì)它們進(jìn)行打分,分值越高說(shuō)明該藥物越有可能是治療肝癌的潛在藥物。最后,對(duì)分值較高的藥物進(jìn)行分析,發(fā)現(xiàn)無(wú)論是基于文獻(xiàn)挖掘、病毒基因組數(shù)據(jù)庫(kù)(Comparative Toxicogenomics Database,CTD)數(shù)據(jù)庫(kù)驗(yàn)證,還是進(jìn)行功能路徑富集分析,預(yù)測(cè)結(jié)果的準(zhǔn)確性與可靠性都很理想。進(jìn)一步說(shuō)明通過(guò)聚焦于一種疾病,并且利用改進(jìn)后的隨機(jī)游走算法更好地實(shí)現(xiàn)了藥物重定位的目的,反映出針對(duì)性的研究對(duì)象和高效的計(jì)算方法是實(shí)現(xiàn)藥物重定位的關(guān)鍵。
【學(xué)位授予單位】：西安電子科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2015
【分類號(hào)】：O157.5;R96

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條

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本文編號(hào)：1219673