近年來,Lnc RNA(長非編碼RNA)已被證明與許多嚴(yán)重種危害人類健康的嚴(yán)重疾病的發(fā)生和發(fā)展密切相關(guān)。然而,由于傳統(tǒng)生物實驗具有實驗的高成本和高耗時等原因,大多數(shù)Lnc RNA與疾病的關(guān)聯(lián)尚未被發(fā)現(xiàn)。因此,建立有效且合理的計算模型來預(yù)測Lnc RNA和疾病之間的潛在關(guān)聯(lián)是非常緊迫和必要的。在生物信息學(xué)中,利用有效的預(yù)測模型來揭示疾病與Lnc RNA之間的潛在關(guān)聯(lián)已經(jīng)成為近些年的一個研究熱點,并被很多研究人員所高度關(guān)注。本文先介紹了研究方向的背景知識和國內(nèi)外研究現(xiàn)狀,之后提出了兩種基于隨機(jī)游走的模型來預(yù)測Lnc RNA-疾病的潛在關(guān)聯(lián)關(guān)系,具體內(nèi)容如下:(1)首先,我們從數(shù)據(jù)庫中得到了已知的Lnc RNA-疾病關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)并進(jìn)行預(yù)處理。(2)隨后,我們提出了一種新的基于局部隨機(jī)游走的預(yù)測模型LRWHLDA用于推斷人類與疾病之間的潛在聯(lián)系。在LRWHLDA中,我們首先通過整合疾病-疾病,Lnc RNA-Lnc RNA與已知的Lnc RNA-疾病這三種關(guān)聯(lián)建立了一個新的異構(gòu)網(wǎng)絡(luò),該異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)包含了兩類節(jié)點和三類鏈接,該異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)的設(shè)置使得LRWHLDA可以在缺乏已知的Lnc RNA-疾病關(guān)聯(lián)的情況下...

【文章頁數(shù)】：62 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
abstract
第1章 緒論
    1.1 課題的研究背景和研究意義
    1.2 疾病與Lnc RNA關(guān)聯(lián)研究的國內(nèi)外現(xiàn)狀
        1.2.1 疾病相關(guān)的關(guān)聯(lián)因子預(yù)測問題的簡要介紹
        1.2.2 疾病相關(guān)Lnc RNA的預(yù)測問題研究現(xiàn)狀
    1.3 本文的主要研究工作
    1.4 本文的主體結(jié)構(gòu)
第2章 基于異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)預(yù)測潛在Lnc RNA-疾病的基礎(chǔ)
    2.1 引言
    2.2 Lnc RNA與疾病相關(guān)性數(shù)據(jù)資源的收集和預(yù)處理
        2.2.1 Lnc RNA相關(guān)數(shù)據(jù)資源介紹
        2.2.2 疾病相關(guān)數(shù)據(jù)資源介紹
        2.2.3 已知疾病-Lnc RNA關(guān)聯(lián)數(shù)據(jù)庫資源的預(yù)處理
    2.3 利用網(wǎng)絡(luò)中鏈接的拓?fù)涮匦杂嬎愎?jié)點相似度的常用方法
    2.4 小結(jié)
第3章 基于局部隨機(jī)游走的潛在Lnc RNA與人類疾病的關(guān)聯(lián)預(yù)測模型研究
    3.1 引言
    3.2 數(shù)據(jù)庫資源的預(yù)處理
    3.3 Lnc RNA與人類疾病的異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)建
        3.3.1 人類疾病之間的同類相似性
        3.3.2 Lnc RNA與 Lnc RNA的同類網(wǎng)絡(luò)節(jié)點相似性
        3.3.3 用于局部性游走的異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)的建立
    3.4 隨機(jī)游走過程
    3.5 模型性能評估
    3.6 對比實驗
    3.7 實際案例分析
    3.8 小結(jié)
第4章 用于預(yù)測Lnc RNA-疾病關(guān)聯(lián)的目標(biāo)收斂集游走模型
    4.1 引言
    4.2 數(shù)據(jù)庫資源的預(yù)處理
    4.3 整合的疾病相似性和整合的Lnc RNA相似性
    4.4 計算模型TCSRWRLD的構(gòu)造
        4.4.1 異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)的構(gòu)造
        4.4.2 TCS(目標(biāo)收斂集)的建立
        4.4.3 在Lnc RNA-疾病異構(gòu)網(wǎng)絡(luò)上的隨機(jī)游走
    4.5 預(yù)測結(jié)果的交叉驗證
    4.6 對比實驗
    4.7 案例分析
    4.8 小結(jié)
第5章 工作總結(jié)與展望
    5.1 本文工作總結(jié)
    5.2 本文展望
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄 A 在學(xué)期間發(fā)表的學(xué)術(shù)論文與研究成果



本文編號：4035644