本文關(guān)鍵詞：群體遺傳學(xué)模擬軟件應(yīng)用現(xiàn)狀

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【摘要】：隨著下一代測(cè)序技術(shù)的不斷進(jìn)步與測(cè)序價(jià)格的不斷下降,越來越多物種的全基因組信息被公開。作為研究群體遺傳變異模式工具之一的模擬軟件必然將發(fā)揮越來越重要的作用。依據(jù)時(shí)間推演方向的不同,模擬軟件可以分為依時(shí)間向前和向后推演,二者各有所長(zhǎng),功能上互相補(bǔ)充,分別適合于不同的模擬需求。這些軟件在研究進(jìn)化動(dòng)力的影響、估計(jì)進(jìn)化動(dòng)力參數(shù)與驗(yàn)證不同進(jìn)化假設(shè)以及新方法有效性等方面起著重要作用。本文簡(jiǎn)要介紹了群體遺傳學(xué)相關(guān)理論知識(shí),詳細(xì)比較了近10年來發(fā)表的32款模擬軟件,并對(duì)模擬軟件的未來發(fā)展方向給出了建議。
【作者單位】： 中國科學(xué)院計(jì)算生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室中國科學(xué)院-德國馬普學(xué)會(huì)計(jì)算生物學(xué)伙伴研究所;中國科學(xué)院大學(xué);
【關(guān)鍵詞】： 群體遺傳學(xué) 計(jì)算機(jī)模擬 依時(shí)間向前 依時(shí)間向后
【基金】：中國科學(xué)院先導(dǎo)B項(xiàng)目(編號(hào):XDB13040800) 國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(編號(hào):91531306)資助~~
【分類號(hào)】：TP319;Q347
【正文快照】： 隨著下一代測(cè)序技術(shù)的不斷進(jìn)步與測(cè)序價(jià)格的不斷下降,越來越多物種的全基因組信息被公開。作為研究群體遺傳變異模式工具之一的模擬軟件必然將發(fā)揮越來越重要的作用。依據(jù)時(shí)間推演方向的不同,模擬軟件可以分為依時(shí)間向前和向后推演,二者各有所長(zhǎng),功能上互相補(bǔ)充,分別適合于不

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