近年來,伴隨著知識工程的持續(xù)發(fā)展,研究發(fā)現(xiàn)基于語義網(wǎng)的數(shù)據(jù)集規(guī)模呈指數(shù)級增長,尤其是在這些大規(guī)模的語義數(shù)據(jù)集中相當(dāng)大一部分是生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)集。這些生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)集中蘊涵了豐富的語義信息,是面向生物醫(yī)學(xué)領(lǐng)域進行深入數(shù)據(jù)分析的重要基礎(chǔ)。但這些數(shù)據(jù)集側(cè)重點不同,數(shù)據(jù)格式、標(biāo)準(zhǔn)不統(tǒng)一,需要進行有效的知識融合和組織表示。因此如何將這些生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)集中的知識以統(tǒng)一的標(biāo)準(zhǔn)組織存儲、挖掘知識并加以分析利用是我們研究的方向和主題。目前,肺癌不管是在國內(nèi)還是國外都有極高的發(fā)病率及致死率,同時肺癌及心血管疾病一直是寧夏地區(qū)的醫(yī)療重點研究方向。本文以肺癌的藥物治療為視角,從多個生物醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)集中獲取與肺癌相關(guān)的基因,蛋白質(zhì),藥物,代謝通路等信息,通過有效的數(shù)據(jù)融合方法建立語義豐富的肺癌醫(yī)學(xué)知識網(wǎng)絡(luò),并在此基礎(chǔ)上探索發(fā)現(xiàn)語義網(wǎng)絡(luò)中的重要結(jié)點、計算結(jié)點的相似度、進行聚類分析,為疾病治療的研究發(fā)展提供新的解決方案。本文首先介紹了近年來網(wǎng)絡(luò)生物學(xué)的研究現(xiàn)狀,介紹了非結(jié)構(gòu)化語義數(shù)據(jù)的存儲現(xiàn)狀,總結(jié)了近年來關(guān)于網(wǎng)絡(luò)鏈接分析方法的算法和研究現(xiàn)狀以及其存在的問題等;接下來以醫(yī)學(xué)領(lǐng)域中的肺癌RDF大數(shù)據(jù)為研究對象,探索在分布式系統(tǒng)下... 

【文章來源】：寧夏大學(xué)寧夏回族自治區(qū) 211工程院校

【文章頁數(shù)】：49 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

圖２－１肺癌藥物治療通路ＲＤＦ示例??

第二章相關(guān)理論與技術(shù)??許用戶瀏覽它，還可以設(shè)置各種規(guī)則或視圖，以便使用者從不同的角度對數(shù)據(jù)進行分析。界??面如圖２－２所示：??＞：．?？？上？?？ｇ？Ｋｉ３?？９Ｓ?■?ｍ＾ｓｎｓ?；?：Ｍ５？ａｗｒ．?；?？ｕ＊Ｂｉ?ｍｍ?－?ｍ?：?ｓｗｋ?：．?＊ｓｅ？？ｘ??ｉｒ?ｖｔｗｒ?ｖ％ｒｒ?＼＇￣ｒ：－＜：?Ｔｒ．？＾？?？?；ｒ?？?＇？？ｉｉ＾ｉｓａ：?ｉｖｒ??Ｃ－－?＞?＠Ｓｒ?Ｈ０ＯＺｊ?ｊ?Ｌｅａｍ?ａｂｏｕｔ?Ｎｅｏ４ｊ?Ｊｕｍｐ?ｉｎｔｏ?ｃｏｄｅ??．＇＇ｔ＇：：?■．－?＊?＾?ＡｎＶｖ７．?？？ａｓ＆?ｖｅｕ?ａｔ＊?Ｃｙｐ＾?＇ｉｗｔｆ－?ｖｔｒ，??？－■ｊ?）?Ｃａ－ｒ？？，，－？？＇＞＜？ｒ？??＼ｒ—ｒｚ?ｎｗｅｗ＇ｌａｊｒｙ＊?Ｍ？－ｔ?］?ＲＸＵＳＫＳｏｃｒ??、＞Ｗ：，．心先聲，ｆｋ％?辦：?Ｚ＾ｙｗｒ＾，??＇?＇?Ｍｗｉ?ｄ＜ｉ?ｏｍｑＫ?ｄｏ?ｖｏｉ??：）ｔｉｔｏｉ；－??ｆｌｌ＾８３ＢＳ３ＳＥＢｉ?ＳＳＥＳ＾ＳＥＳ＾＾ＳＢ！??＇：：－，ｌＬ＇?Ｍｏｎｉｔｏｒ?ｔｈｅ?ｓｙｓｔｅｍ??Ｋｔｊ?ｆｉｒＫＳ－??？＊＊＊＊％?￡＞？？??ｌ?Ｈ＾Ｎ?Ｉ?Ｃｉｄｍ?ａｃｓｘｎ??圖２－２Ｎｅｏ４ｊ界面展示??２．５小結(jié)??本章介紹了圖的定義和一些基礎(chǔ)理論；概述了?ＲＤＦ圖模型的定義并通過一個肺癌數(shù)據(jù)??三元組的示例詳細(xì)解釋了?ＲＤＦ三元組；接著介紹了本文所涉及的三種網(wǎng)絡(luò)鏈接分析方法的??理論知識

通過對比分析現(xiàn)有數(shù)據(jù)集的內(nèi)容和權(quán)威性，我們在互聯(lián)網(wǎng)中選擇了以下５個生物醫(yī)學(xué)數(shù)??據(jù)庫：ＣｈＥＭＢＬ、ＫＥＧＧ、ＤｒｕｇＢａｎｋ、ＵｎｉＰｏｒｔ和ＰｕｂＭｅｄ獲取本文所需的肺癌相關(guān)信息。??圖３－１說明了這些數(shù)據(jù)集之間的關(guān)聯(lián)關(guān)系。在這些數(shù)據(jù)集中，每個數(shù)據(jù)記錄都有自己的ＩＤ，??通過分析發(fā)現(xiàn)，這些ＩＤ在五個數(shù)據(jù)集中相互包含，具有相互引用關(guān)系，可以作為分析數(shù)據(jù)??集關(guān)聯(lián)的重要途徑。其中ＫＥＧＧ數(shù)據(jù)集中的基因與ＵｎｉＰｒｏｔ數(shù)據(jù)集里的蛋白質(zhì)具有編碼關(guān)系，??它們之間通過ＵｎｉＰｒｏｔ?ＩＤ連接；ＣｈＥＭＢＬ數(shù)據(jù)集為化合物信息，它與ＵｎｉＰｒｏｔ數(shù)據(jù)集中肺癌??蛋白信息通過ＣｈＥＭＢＬ?ＩＤ連接；從ＤｒｕｇＢａｎｋ數(shù)據(jù)集提取的有關(guān)治療肺癌的藥物與ＵｎｉＰｒｏｔ??數(shù)據(jù)集的蛋白質(zhì)具有作用關(guān)系，通過ＵｎｉＰｒｏｔ?ＩＤ連接。??Ｉ?ＫＥＧＧ?Ｎ．??Ｖ?Ｄｉｓｅａｓｅ?＾?????、、１一’，?、、??／?ＫＥＧＧ?Ｓ，?Ｔ?／?ＫＥＧ６?）??ＣＨ＆ＭＢＬ１ＤＵｎｉＰｒｏｔｌＤ??ｆ?ＣＨＥＭＢＬ?Ｗ——Ａ：ＨＥＭＢＵＤ３？＝Ｗ?Ｕｎ．ｐｒｏｔ?）??Ｊ?ＵｎｉＰｒｏｔｉＤ?ＰＭＩＤ??＼??ＣＨＥＭＢＬＩＤ／?ＰＭ，Ｄ??ＵｎｉＰｒｏｔｌＰ＾ｊｋＡ??（ＤｒｕｇＢａｎｋ?ｆ?ＰｕｂＭｅｄ?）??Ｖ?ｙ??圖３－１肺癌醫(yī)學(xué)數(shù)據(jù)集之間的關(guān)聯(lián)關(guān)系??ＣｈＥＭＢＬ［５７］由歐洲分子生物學(xué)實驗室（ＥＭＢＬ）的歐洲生物信息學(xué)研宄所（ＥＢＩ）維護

【參考文獻】：
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碩士論文
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本文編號：3031008