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基于應(yīng)用運(yùn)行特征的圖數(shù)據(jù)布局與訪問(wèn)優(yōu)化研究

發(fā)布時(shí)間:2020-05-31 09:51
【摘要】:圖是一種很重要的非結(jié)構(gòu)化數(shù)據(jù),可以用于建,F(xiàn)實(shí)世界中的各種問(wèn)題,被廣泛應(yīng)用到交通運(yùn)輸、金融、社交網(wǎng)絡(luò)等重要領(lǐng)域。但由于圖計(jì)算過(guò)程中嚴(yán)重的結(jié)構(gòu)依賴性,導(dǎo)致應(yīng)用執(zhí)行時(shí)內(nèi)存隨機(jī)訪問(wèn)嚴(yán)重,內(nèi)存帶寬成為限制圖計(jì)算系統(tǒng)性能的重要因素。并且不同類型圖算法的內(nèi)存訪問(wèn)特征差異明顯,單一的內(nèi)存圖數(shù)據(jù)組織不足以應(yīng)對(duì)各種圖算法多樣化的內(nèi)存訪問(wèn)需求。針對(duì)上述問(wèn)題,分析了常見(jiàn)圖算法的動(dòng)態(tài)運(yùn)行特征和內(nèi)存數(shù)據(jù)訪問(wèn)特點(diǎn),將圖算法分為遍歷式和迭代式兩類,研究不同運(yùn)行特征下的高效的圖數(shù)據(jù)組織策略。對(duì)于遍歷式圖算法,通過(guò)分析其運(yùn)行過(guò)程,發(fā)現(xiàn)同一個(gè)頂點(diǎn)和不同鄰居節(jié)點(diǎn)之間存在關(guān)聯(lián)度的大小差異,對(duì)鄰居節(jié)點(diǎn)的訪問(wèn)順序是影響算法運(yùn)行過(guò)程中緩存命中率的重要因素;诖颂岢隽嘶陉P(guān)聯(lián)度的圖頂點(diǎn)重映射算法GDL-VC,并采用滑動(dòng)窗口模型SW實(shí)現(xiàn)了內(nèi)存圖數(shù)據(jù)的合理布局。該布局結(jié)果能夠體現(xiàn)出圖的結(jié)構(gòu)特性,使相關(guān)聯(lián)的頂點(diǎn)ID分布呈現(xiàn)局部有序,減少圖算法運(yùn)行過(guò)程中的內(nèi)存隨機(jī)訪問(wèn)。對(duì)于迭代式圖算法,通過(guò)分析其算法收斂特性,發(fā)現(xiàn)圖結(jié)構(gòu)中“超級(jí)頂點(diǎn)”長(zhǎng)時(shí)間不能達(dá)到收斂狀態(tài)而造成了迭代式圖應(yīng)用的長(zhǎng)尾現(xiàn)象。針對(duì)于此,提出了基于影響力的圖頂點(diǎn)重映射算法GDL-DR,該布局算法根據(jù)頂點(diǎn)的影響力(頂點(diǎn)度)完成圖數(shù)據(jù)的布局。這樣在圖算法迭代后期,活躍頂點(diǎn)集執(zhí)行狀態(tài)更新時(shí),與之相關(guān)聯(lián)的鄰居節(jié)點(diǎn)緊湊分布,可以減少內(nèi)存隨機(jī)訪問(wèn),使頂點(diǎn)更快的達(dá)到收斂狀態(tài),縮短應(yīng)用執(zhí)行時(shí)間。測(cè)試結(jié)果表明:GDL-VC布局算法能夠給遍歷式圖應(yīng)用(連通分量、單源點(diǎn)最短路徑)帶來(lái)25.4%、27.5%的平均內(nèi)存訪問(wèn)效率提升,部分?jǐn)?shù)據(jù)集超過(guò)50%;GDL-DR布局算法能夠給迭代式圖應(yīng)用(網(wǎng)頁(yè)排名、標(biāo)簽傳播)帶來(lái)23.9%、17.1%的平均內(nèi)存訪問(wèn)效率提升,最大提升百分比為42.9%。對(duì)于GraphChi測(cè)試平臺(tái),兩種布局算法帶來(lái)的系統(tǒng)加速比均達(dá)到1.5×以上,部分圖數(shù)據(jù)超過(guò)2×;Cache命中率提高到90%以上。
【圖文】:

曲線,圖應(yīng)用,頂點(diǎn),比例變化


圖 1.4 典型圖應(yīng)用活躍頂點(diǎn)比例變化曲線可以看出,對(duì)于 BFS 遍歷式圖算法,其按照順序?qū)哟伪闅v圖結(jié)構(gòu),前期活例逐漸增大,隨著大多數(shù)頂點(diǎn)都被訪問(wèn),后續(xù)活躍頂點(diǎn)比例下降;但是整個(gè)過(guò)程活躍頂點(diǎn)比例整體上都維持在一個(gè)比較低的水平。而對(duì)于 PageRank 迭法,初始時(shí)由于所有頂點(diǎn)都要執(zhí)行更新,因此活躍頂點(diǎn)比例很高;但是經(jīng)過(guò)

社區(qū)結(jié)構(gòu)


圖 1.6 圖社區(qū)結(jié)構(gòu)在對(duì)圖數(shù)據(jù)重新布局的時(shí)候,如果能夠預(yù)先準(zhǔn)確的檢測(cè)出圖社一個(gè)社區(qū)單獨(dú)執(zhí)行頂點(diǎn)重映射。這樣在分布式環(huán)境下,能夠大大減量,,保持系統(tǒng)復(fù)雜均衡;而在單機(jī)環(huán)境下,亦可以保證內(nèi)存中頂點(diǎn)體上呈現(xiàn)局部有序性。當(dāng)前存在眾多的圖社區(qū)檢測(cè)算法,如 M
【學(xué)位授予單位】:華中科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2018
【分類號(hào)】:TP311.12

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本文編號(hào):2689668

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