基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)分析康艾注射液抗腫瘤作用機(jī)制
發(fā)布時(shí)間:2025-02-06 18:30
目的:運(yùn)用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法分析康艾注射液抗腫瘤的作用機(jī)制。方法:利用中藥系統(tǒng)藥理學(xué)技術(shù)平臺(tái)(TCMSP)篩選康艾注射液的組成中藥的有效成分及對(duì)應(yīng)靶蛋白。利用Cytoscape 3.6.1構(gòu)建康艾注射液有效化合物-靶蛋白網(wǎng)絡(luò)并進(jìn)行網(wǎng)絡(luò)拓?fù)鋵W(xué)分析。借助STRING在線數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行蛋白互作(PPI)網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建并進(jìn)行分析。通過(guò)生物學(xué)信息注釋數(shù)據(jù)庫(kù)(DAVID)對(duì)靶點(diǎn)進(jìn)行生物過(guò)程(Gene Ontology Biological Process,GO-BP)富集分析及基因組百科全書(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes,KEGG)通路分析。結(jié)果:共獲得83個(gè)候選化合物,包含了黃酮類、人參皂苷、苦參堿等有效組分;240個(gè)靶點(diǎn),關(guān)鍵靶點(diǎn)是COX1、COX2、HSP90、TP53、AKT1、JUN等;生物過(guò)程條目共250條,涉及轉(zhuǎn)錄翻譯、細(xì)胞信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)、細(xì)胞增殖與凋亡過(guò)程、免疫反應(yīng)、血管生成等生物過(guò)程;KEGG信號(hào)通路共127條,其中癌癥通路、PI3K-Akt信號(hào)通路、淋巴瘤病毒感染、癌癥中的蛋白聚糖、MAPK信號(hào)通路、TNF信號(hào)通路、前列腺癌、鈣離子信號(hào)通路、癌癥的...
【文章頁(yè)數(shù)】:9 頁(yè)
【部分圖文】:
本文編號(hào):4030726
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圖1 化合物-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)圖
為了更好地探討康艾注射液的作用機(jī)制,將240個(gè)人類靶點(diǎn)蛋白輸入String數(shù)據(jù)庫(kù),并設(shè)置置信度大于0.9,剔除獨(dú)立于網(wǎng)絡(luò)以外的靶點(diǎn),獲得PPI網(wǎng)絡(luò)(見圖2)。該網(wǎng)絡(luò)共有225個(gè)節(jié)點(diǎn),3984條相互作用關(guān)系,平均度值為35.4。利用Cytohubba插件中的Degree算法篩選出....
圖2 康艾注射液相關(guān)靶點(diǎn)的PPI網(wǎng)絡(luò)圖
表2化合物-靶點(diǎn)網(wǎng)絡(luò)關(guān)鍵節(jié)點(diǎn)及其拓?fù)鋵W(xué)特征節(jié)點(diǎn)名稱節(jié)點(diǎn)類型度值介值中心度節(jié)點(diǎn)名稱節(jié)點(diǎn)類型度值介值中心度M98化合物1490.56079226NCOA2靶點(diǎn)210.03812878M422化合物610.11721417PRKACA靶點(diǎn)....
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