本文關鍵詞：水稻生物鐘相關基因的表達特征鑒定及其功能預測分析

  更多相關文章： 水稻 生物鐘 共表達分析 應激反應 代謝過程

【摘要】：水稻作為我國重要農作物,其營養(yǎng)生長和生殖發(fā)育過程都受到嚴格的生物鐘的控制,因此,生物鐘基因的表達變化也是決定水稻產量和種子質量的主要決定因素之一。為了更全面系統(tǒng)的了解生物鐘基因在水稻生長和發(fā)育過程中的功能,本研究采用生物信息學共表達方法,篩選和鑒定水稻和擬南芥中生物鐘基因,并對比分析了這些生物鐘基因在單雙子葉模式植物中的可能功能。從水稻表達譜公共數(shù)據(jù)庫中篩選與生物鐘基因表達密切相關732個基因,并對篩選出的水稻生物鐘相關基因進行表達特性、節(jié)律性、生物功能預測及其與擬南芥的對比分析,結果表明水稻和擬南芥的生物鐘基因可能都具有在生物鐘核心振蕩器部分功能相對保守的特點。功能預測分析也還表明水稻生物鐘基因參與了8類生物學過程,尤其在應激反應和代謝過程的方面具有明顯富集性,從而間接佐證了水稻對于外界環(huán)境的響應及其代謝過程具有嚴格時間調控的分子機理。
【作者單位】： 上海交通大學生命科學技術學院;
【關鍵詞】： 水稻 生物鐘 共表達分析 應激反應 代謝過程
【基金】：國家自然科學基金項目(31370026,31570312和31500297)資助
【分類號】：S511
【正文快照】： 生物鐘,也稱晝夜節(jié)律鐘(circadian clock),是生物適應環(huán)境周期性變化的一種普遍存在的內在機制,從低等的細菌到真核的真菌、植物、動物以及人類都存在這種調控系統(tǒng)(Li et al.,2013;Reddy and Rey,2014;Dibner and Schibler,2015)。生物鐘可以在分子、生化、細胞、生理及行為等

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 葛磊,譚克輝,種康,許智宏;水稻花發(fā)育基因調控的研究進展[J];科學通報;2001年09期

2 李斌;水稻基因上演“三國演義”[J];科技信息;2001年12期

3 ;國際水稻大會在京召開 江澤民出席開幕式并講話[J];農業(yè)機械;2002年10期

4 庾晉;白杉;;水稻市場面臨的四大困惑[J];農村科技開發(fā);2002年12期

5 ;水稻基因組測序動態(tài)資訊[J];中國種業(yè);2002年01期

6 ;水稻基因研究取得新成果[J];吉林水利;2002年06期

7 海燕;我國科學家率先繪制出水稻基因圖譜[J];山東農業(yè);2002年05期

8 胡詠武,譚軍,鐘蘭;用生物信息技術初步分析雜交水稻的抗病基因[J];溫州醫(yī)學院學報;2002年05期

9 趙曉梅;我國科學家完成水稻基因 第四號染色體的精確測序[J];中國稻米;2003年01期

10 王子齊;全球水稻科學家的世紀盛會——北京國際水稻大會側記[J];福建稻麥科技;2003年01期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 趙基洪;;水稻與菰屬間性狀轉移研究[A];新世紀 新機遇 新挑戰(zhàn)——知識創(chuàng)新和高新技術產業(yè)發(fā)展（下冊）[C];2001年

2 張國良;陳文軍;戴其根;許軻;霍中洋;張洪程;;水稻耐1，2，4-三氯苯脅迫基因型的篩選[A];中國作物學會栽培專業(yè)委員會換屆暨學術研討會論文集[C];2007年

3 裴忠有;;水稻T—DNA插入群體的建立及突變體篩選[A];2008中國作物學會學術年會論文摘要集[C];2008年

4 張桂權;丁效華;曾瑞珍;張澤民;李文濤;陳兆貴;劉冠明;何風華;AkshayTulukdar;劉芳;席章營;黃朝鋒;朱文銀;易懋升;秦利軍;施軍瓊;趙芳明;馮明姬;單澤林;陳嵐;郭曉琴;JaiChandRana;;水稻功能基因組學材料平臺的建立[A];中國的遺傳學研究——中國遺傳學會第七次代表大會暨學術討論會論文摘要匯編[C];2003年

5 王景余;孫海波;李艷萍;鄒美智;;水稻遺傳轉化研究及應用進展[A];中國農業(yè)生物技術學會第三屆會員代表大會暨學術交流會論文摘要集[C];2006年

6 姬生棟;秦廣雍;耿颯;盛有名;薛華政;吳劉成;徐存拴;霍裕平;;離子束介導玉米基因組DNA的水稻后代遺傳性狀研究[A];全國作物生物技術與誘變技術學術研討會論文摘要集[C];2005年

7 李陽生;朱英國;;水稻設計育種[A];中國的遺傳學研究——中國遺傳學會第七次代表大會暨學術討論會論文摘要匯編[C];2003年

8 羅彥長;王守海;;分子標記輔助水稻抗病蟲育種進展[A];現(xiàn)代農業(yè)理論與實踐——安徽現(xiàn)代農業(yè)博士科技論壇論文集[C];2007年

9 沈輝;王宗陽;;水稻OsEBP89基因啟動子的功能分析[A];中國植物生理學會全國學術年會暨成立40周年慶祝大會學術論文摘要匯編[C];2003年

10 陳石燕;王宗陽;;T-DNA介導的promoter trap系統(tǒng)[A];中國植物生理學會第九次全國會議論文摘要匯編[C];2004年

中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 ;日本破譯3.2萬個水稻基因[N];今日信息報;2003年

2 田耕;水稻基因組圖譜帶來希望與困惑[N];大眾科技報;2002年

3 本報記者 徐玲玲;楊煥明：評說水稻“基因大戰(zhàn)”[N];科技日報;2001年

4 本報駐美國記者 王如君;水稻基因研究里程碑（科技大觀）[N];人民日報;2002年

5 楊健、蔣建科;水稻基因“天書”被打開[N];人民日報;2005年

6 通訊員 婁沂春 記者 馬瑛瑛;浙大成功開發(fā)大容量水稻基因芯片[N];浙江日報;2001年

7 記者　韓曉玲、通訊員　王景剛;水稻基因研究獲突破性進展 將全面提升我國水稻國際競爭力[N];湖北日報;2006年

8 鄧肯;永久保護世界水稻資源協(xié)議簽訂[N];科技日報;2007年

9 徐瑞哲;滬蘇皖育出“軟糯”水稻新品種[N];農民日報;2006年

10 劉新萍;高個水稻具有玉米特性[N];江蘇科技報;2007年

中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 張韜;水稻GAGA Element的預測與分析[D];電子科技大學;2008年

2 李冠義;兩種水稻病毒脅迫下水稻的生物信息學研究[D];福建農林大學;2009年

3 倪建平;我國水稻知識產權現(xiàn)狀與發(fā)展方向研究[D];中國農業(yè)科學院;2010年

4 陳裕坤;苯丙氨酸解氨酶基因遺傳轉化水稻的研究[D];福建農林大學;2011年

5 胡國成;適合于水稻的激發(fā)標簽載體的優(yōu)化和水稻激發(fā)標簽突變體庫的構建[D];浙江大學;2002年

6 梁淑家;水稻正向控制系統(tǒng)獲得抗性的調節(jié)基因的功能鑒定[D];廣西大學;2002年

7 全東興;吉林省主栽水稻品種組織培養(yǎng)體系的優(yōu)化及抗除草劑基因轉化研究[D];東北農業(yè)大學;2002年

8 謝建平;湖北省水稻新品種選育與應用現(xiàn)狀分析[D];華中農業(yè)大學;2004年

9 丁建;水稻突變體庫的構建和旁鄰序列分析[D];四川農業(yè)大學;2003年

10 張晶;幾丁質酶基因及核糖體失活蛋白基因對水稻的遺傳轉化[D];東北農業(yè)大學;2003年

，

本文編號：995307