菠蘿MADS-box基因AcMADS2的克隆與表達(dá)分析
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【摘要】:采用RT-PCR和RACE方法從菠蘿克隆獲得一個(gè)MADS-box基因,命名為Ac MADS2,Gen Bank登錄號(hào)為KC257409。AcMADS2基因c DNA全長945 bp,ORF為687 bp,編碼一個(gè)含有228個(gè)氨基酸的蛋白。序列分析和系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,AcMADS2具有保守的MADS-box結(jié)構(gòu)域和半保守的K區(qū),與其他植物中的AGL12亞家族MADS-box蛋白具有很高的同源性。生物信息學(xué)分析結(jié)果表明,Ac MADS2是不穩(wěn)定的親水蛋白,不具有跨膜結(jié)構(gòu)和信號(hào)肽。α-螺旋、折疊延伸鏈及無規(guī)則卷曲構(gòu)成了二級結(jié)構(gòu)的主要蛋白框架。在三級結(jié)構(gòu)中MADS-box結(jié)構(gòu)域構(gòu)成了該蛋白核心結(jié)構(gòu),并且作為轉(zhuǎn)錄因子可能定位于細(xì)胞核。實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析表明,Ac MADS2基因在花期根中的表達(dá)量明顯高于同一時(shí)期的小花、莖和葉;干旱和低溫脅迫處理后,Ac MADS2基因在苗期根中的表達(dá)也明顯增強(qiáng)。因此,推測Ac MADS2基因可能參與菠蘿根發(fā)育的調(diào)控以及逆境脅迫反應(yīng)。
【作者單位】: 廣西壯族自治區(qū)亞熱帶作物研究所;海南省農(nóng)業(yè)科學(xué)院;中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院南亞熱帶作物研究所;
【關(guān)鍵詞】: 菠蘿 MADS-box基因 克隆 基因表達(dá)
【基金】:廣西自然科學(xué)基金(2014GXNSFBA118127、2015GXNSFAA139069和2016GXNSFBA380005) 國家自然科學(xué)基金(31260460) 國家公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(xiàng)(201203021) 現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系廣西創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)建設(shè)專項(xiàng)資金(nycytxgxcxtd-04-19-16)~~
【分類號(hào)】:Q943.2;S668.3
【正文快照】: 收稿2016-06-24修定2016-07-27資助廣西自然科學(xué)基金(2014GXNSFBA118127、2015GXNS-FA A 1 3 9 0 6 9和2 0 1 6 G X N S F B A 3 8 0 0 0 5)、國家自然科學(xué)基金(31260460)、國家公益性行業(yè)(農(nóng)業(yè))科研專項(xiàng)(201203021)和現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系廣西創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)建設(shè)專項(xiàng)資金(nycytxgxc
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