本文關(guān)鍵詞：基于轉(zhuǎn)錄組的蔥蠅表皮蛋白基因家族的鑒定及在非滯育和冬滯育條件下的表達(dá)分析

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【摘要】：【目的】昆蟲表皮蛋白在昆蟲的生長發(fā)育、抑制水分蒸發(fā)和抵御其他外界不良環(huán)境等方面起到重要的作用。通過轉(zhuǎn)錄組水平上蔥蠅Delia antiqua表皮蛋白基因家族的鑒定及部分基因在非滯育和冬滯育條件下的表達(dá)規(guī)律分析,為進(jìn)一步研究蔥蠅表皮蛋白在滯育期的抗逆功能奠定基礎(chǔ)。【方法】基于轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),通過生物信息學(xué)方法對蔥蠅表皮蛋白基因進(jìn)行鑒定分析,系統(tǒng)進(jìn)化和保守結(jié)構(gòu)域分析并采用實(shí)時熒光定量PCR法比較分析了12個基因在蔥蠅非滯育和冬滯育不同發(fā)育時期的表達(dá)變化。【結(jié)果】在蔥蠅中鑒定出81個表皮蛋白基因,分別屬于RR(71個基因)、CPAP(5個基因)和CPLC(5個基因)亞家族,其編碼的蛋白質(zhì)含有92~495個氨基酸,分子量約為8.692~52.2 k D,等電點(diǎn)為3.90~9.93。亞細(xì)胞定位預(yù)測結(jié)果顯示67個全長表皮蛋白均為外分泌型。12個蔥蠅表皮基因在非滯育和冬滯育過程中有明顯不同的表達(dá)規(guī)律。【結(jié)論】蔥蠅表皮蛋白基因RR-2型的保守基序中發(fā)生了基因突變,引起關(guān)鍵氨基酸的替換,這可能暗示它們在非滯育和滯育不同條件下,不同發(fā)育階段中蛹皮結(jié)構(gòu)重建和某些器官的發(fā)生方面發(fā)揮不同作用。該研究結(jié)果為進(jìn)一步闡明蔥蠅滯育蛹皮結(jié)構(gòu)及抗逆功能的研究提供了重要理論基礎(chǔ)。
【作者單位】： 重慶師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院昆蟲與分子生物學(xué)研究所;
【關(guān)鍵詞】： 蔥蠅 表皮蛋白 基因家族 滯育 生物信息學(xué) 表達(dá)分析
【基金】：“兩江學(xué)者”計(jì)劃專項(xiàng)經(jīng)費(fèi) 聯(lián)合國IAEA項(xiàng)目(18268/R0) 國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31372265)
【分類號】：S433
【正文快照】： 蔥蠅Delia antiqua(雙翅目:花蠅科)是廣泛分布于北半球溫帶地區(qū)的重要地下害蟲,對百合科蔬菜的產(chǎn)量影響很大(滕學(xué)強(qiáng)和何振昌,1989)。蔥蠅的生活史要經(jīng)歷卵、幼蟲、蛹和成蟲4個發(fā)育時期,幼蟲階段經(jīng)歷3個齡期,分別為1齡幼蟲、2齡幼蟲和3齡幼蟲(陳斌等,2010)。研究表明,蔥蠅通過

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3 李秉，

本文編號：961860