miR164a及其靶基因PeNAC1相互作用研究
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更多相關(guān)文章: miRa Ptc-MIRa Pe NAC 靶標(biāo)基因 毛果楊
【摘要】:miRNA參與了生物體重要的基因表達調(diào)控過程,其中miR164通過對標(biāo)靶NAC(NAM/ATAF/CUC)基因家族的精細調(diào)控,在植物激素信號傳導(dǎo)、生長發(fā)育以及脅迫應(yīng)答中起著重要作用。為了驗證楊樹中miR164a和其預(yù)測靶基因Pe NAC1間是否也存在這一相互作用,筆者采用PCR技術(shù)克隆了毛果楊(Populus trichocarpa)miR164a的前體序列Ptc-MIR164a,并通過RNA fold(http://rna.tbi.univie.ac.at/)在線軟件對其進行了miRNA二級結(jié)構(gòu)分析。結(jié)果表明:該序列能形成典型的二級莖環(huán)結(jié)構(gòu),預(yù)示其在細胞內(nèi)能被加工為成熟的miR164a。進一步借鑒動物細胞miRNA研究中熒光素酶報告基因法,利用高效的楊樹原生質(zhì)體瞬時表達體系,驗證了PtcMIR164a對其預(yù)測靶基因Pe NAC1的標(biāo)靶作用;同時,也建立了一種比較簡單、直觀的植物miRNA靶標(biāo)基因的鑒定方法。
【作者單位】: 南方現(xiàn)代林業(yè)協(xié)同創(chuàng)新中心南京林業(yè)大學(xué)林學(xué)院江蘇省農(nóng)業(yè)種質(zhì)資源保護與利用平臺楊樹種質(zhì)資源圃;
【關(guān)鍵詞】: miRa Ptc-MIRa Pe NAC 靶標(biāo)基因 毛果楊
【基金】:國家林業(yè)公益性行業(yè)科研專項青年項目(20134111) 國家自然科學(xué)基金青年項目(31200507) 江蘇高校優(yōu)勢學(xué)科建設(shè)工程資助項目(PAPD)
【分類號】:Q943.2
【正文快照】: 自2002年報道植物中也存在miRNA以來[1],越來越多的miRNA家族被發(fā)現(xiàn),并給出功能闡明。miRNA可以在轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后、翻譯等不同層次上對其靶基因進行精細調(diào)控,在生物體內(nèi)處于基因表達調(diào)控的中心位置。目前,miRNA在植物生長發(fā)育和防御反應(yīng)等方面的作用和機制已成為植物表觀遺傳學(xué)
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,本文編號:954089
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