新疆油雞H9N2亞型禽流感病毒分離株HA和NA基因的克隆及進(jìn)化生物信息分析
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【摘要】:為了從分子水平上掌握新疆油雞H9亞型禽流感病毒的遺傳進(jìn)化情況,本研究采用RT-PCR技術(shù)克隆并測(cè)序分離毒株的HA和NA基因,并對(duì)其分子特征及全基因序列進(jìn)行遺傳進(jìn)化分析。結(jié)果顯示,新疆油雞分離株的HA和NA基因均屬于歐亞分支中的A/CK/BJ/94譜系,HA基因與A/CK/BJ/94在核苷酸和氨基酸水平的同源性依次為90.2%和91.9%,NA基因與A/CK/BJ/94在核苷酸和氨基酸水平的同源性依次為89.3%和90%。分離毒株HA基因的裂解位點(diǎn)為-PSRSSR/G-,符合低致病性AIV的序列特征,HA基因具有人樣受體結(jié)合的特征(Leu~(234))。HA基因在313位發(fā)生突變,比同一譜系的BJ/1/94多1個(gè)糖基化位點(diǎn),NA基因在44位發(fā)生突變,比同一譜系的BJ/1/94在該位點(diǎn)多1個(gè)糖基化位點(diǎn),NA基因在3個(gè)紅細(xì)胞吸附區(qū)域發(fā)生多處突變。試驗(yàn)結(jié)果為從分子水平上研究H9N2亞型禽流感病毒跨種傳播的機(jī)制提供了理論依據(jù)。
【作者單位】: 塔里木大學(xué);新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團(tuán)塔里木畜牧科技重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;阿克蘇地區(qū)動(dòng)物疫病控制診斷中心;
【關(guān)鍵詞】: HN亞型 油雞 HA基因 分子特征 遺傳進(jìn)化分析
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金資助項(xiàng)目(31160513) 塔里木大學(xué)預(yù)防獸醫(yī)重點(diǎn)學(xué)科資助項(xiàng)目
【分類(lèi)號(hào)】:S852.65
【正文快照】: *Corresponding author,E-mail:wjyn-w@126.com禽流感(avian influenza,AI)是由A型流感病毒(avian influenza virus,AIV)引起的病毒性傳染病,血凝素(hemagglutinin,HA)和神經(jīng)氨酸酶(neuramini-dase,NA)這2種蛋白的變異導(dǎo)致流感病毒存在諸多血清亞型。自Homme等[1]1966年從威斯
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