本文關(guān)鍵詞：玉米Δ1-吡咯啉-5-羧酸合成酶基因家族生物信息學(xué)分析

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【摘要】：Δ1-吡咯啉-5-羧酸合成酶(Delta-1-pyrroline-5-carboxylate synthase,P5CS)是脯氨酸代謝途徑的關(guān)鍵酶,對植物抵抗逆境脅迫起至關(guān)重要的作用。為了探索P5CS在玉米對逆境脅迫的響應(yīng),本文對5個(gè)玉米P5CS基因家族蛋白的基本理化性質(zhì)、二級結(jié)構(gòu)預(yù)測、亞細(xì)胞定位、基因結(jié)構(gòu)、進(jìn)化關(guān)系及保守基序等方面進(jìn)行初步生物信息分析。結(jié)果顯示,5個(gè)玉米P5CS蛋白中有3個(gè)偏酸性,1個(gè)顯中性,1個(gè)偏堿性;2個(gè)以無規(guī)則卷曲為主要構(gòu)成元件,3個(gè)P5CS蛋白主要以α白螺旋為主要構(gòu)成元件;不穩(wěn)定指數(shù)分析發(fā)現(xiàn),4個(gè)P5CS蛋白為穩(wěn)定蛋白;疏水性分析表明,所有的P5CS蛋白為親水性蛋白;玉米P5CS家族內(nèi)含子最少含有4個(gè)內(nèi)含子,最多的含有19個(gè)內(nèi)含子;亞細(xì)胞定位分析表明,P5CS均蛋白定位于細(xì)胞基質(zhì);進(jìn)化分析表明,P5CS家族分3個(gè)亞家族。
【作者單位】： 中國熱帶農(nóng)業(yè)科學(xué)院南亞熱帶作物研究所/農(nóng)業(yè)部熱帶果樹生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 玉米 Δ-吡咯啉--羧酸合成酶(PCS) 生物信息 基因家族
【基金】：中央級公益性科研院所基本科研業(yè)務(wù)專項(xiàng)(1630062014010,1630062015017,1630062015003) 海南省自然科學(xué)基金(20153134)
【分類號】：S513
【正文快照】： 脯氨酸作為植物體內(nèi)一種重要的滲透調(diào)節(jié)物質(zhì),主要有滲透調(diào)節(jié)、保護(hù)生物大分子以及參與氮代謝和能量代謝等作用[1]。在植物體內(nèi),脯氨酸的合成是通過谷氨酸途徑和鳥氨酸途徑進(jìn)行的[2]。逆境脅迫下,谷氨酸途徑是合成脯氨酸的主要途徑[3]。Δ1-吡咯啉-5-羧酸合成酶(Delta-1-pyrrol

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2 ;[J];;年期

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1 孫健;徐英凱;劉科;張啟元;匡廷云;;新型磷酰基取代吡咯啉類自由基捕捉劑與活性氧[A];第五屆全國自由基生物學(xué)與自由基醫(yī)學(xué)學(xué)術(shù)討論會(huì)論文摘要匯編[C];2000年

2 楊倩;曹宜菊;邢小寧;董洪明;肖文精;;Lewis酸輔助的關(guān)環(huán)復(fù)分解反應(yīng):光學(xué)純吡咯啉衍生物的簡便合成[A];中國化學(xué)會(huì)第四屆有機(jī)化學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文集（下冊）[C];2005年

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1 劉中秋;吲哚里西啶和吡咯啉啶衍生物的合成[D];江蘇師范大學(xué);2014年

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3 黃林;3-�；�-4-羥基吡咯啉-2-酮類衍生物的合成及生物活性研究[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年

4 李慶彬;3-（1'-烴氧甲酰基甲基亞胺基）乙基-4-羥基吡咯啉-2-酮類衍生物的合成與生物活性研究[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年

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本文編號：939562