本文關(guān)鍵詞：利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序方法研究獺兔毛色相關(guān)基因

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【摘要】：利用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序方法分析了不同毛色(白色和海貍色)獺兔皮膚組織中基因的表達(dá)差異,旨在找到影響獺兔毛色的候選基因。采用Illumina Hi Seq TM2500測(cè)序平臺(tái)對(duì)不同毛色獺兔耳組織中所有m RNA進(jìn)行高通量測(cè)序,所得序列經(jīng)質(zhì)控、組裝后比對(duì)到GO、COG、SWISS-PROT數(shù)據(jù)庫(kù)中注釋,并進(jìn)行差異表達(dá)基因聚類分析和KEGG通路分析。結(jié)果表明:測(cè)序共獲得Unigene 275 625個(gè),差異表達(dá)基因12 408個(gè),其中上調(diào)表達(dá)基因4 904個(gè),下調(diào)表達(dá)基因7 504個(gè)。KEGG通路分析發(fā)現(xiàn),這些差異基因顯著地富集在13個(gè)代謝通路中,并在細(xì)胞色素代謝通路(metabolism of xenobiotics by cytochrome P450)中有8個(gè)差異表達(dá)的基因,其中CP2F1和CP2BB屬于細(xì)胞色素P450家族成員,而GSTA4與黑素細(xì)胞分化有關(guān),可能在獺兔毛色中發(fā)揮作用。
【作者單位】： 山西省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所;
【關(guān)鍵詞】： 轉(zhuǎn)錄組測(cè)序 獺兔 毛色 差異表達(dá) GO和KEGG通路分析
【基金】：國(guó)家兔產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系項(xiàng)目(CARS-44-B-6) 山西省農(nóng)科院博士基金項(xiàng)目(YBSJJ1401)
【分類號(hào)】：S829.1
【正文快照】： 獺兔,學(xué)名力克斯兔(Rex rabbit),是世界著名的皮用兔品種,因其皮毛具有“短、平、密、細(xì)、美、牢”等特點(diǎn),制作的服飾色彩斑斕、輕柔飄逸而受到人們的喜愛。獺兔毛色眾多,已發(fā)展出海貍色、藍(lán)色、青紫藍(lán)、紅色等二十多種色型,九十多種顏色[1]。中國(guó)是養(yǎng)兔大國(guó),年產(chǎn)獺兔皮張和出

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 邢少辰,林秀峰;分離基因的有效手段-mRNA差異顯示技術(shù)[J];吉林農(nóng)業(yè)科學(xué);2004年02期

2 杜娟,林戈,盧光t;人胚胎干細(xì)胞和分化細(xì)胞差別基因的篩選[J];遺傳學(xué)報(bào);2004年09期

3 張冉;林浴霜;;不同品種雞MSTN基因表達(dá)差異的研究[J];中國(guó)家禽;2012年06期

4 唐婷;柳峰松;任國(guó)棟;;謝氏寬漠王β-actin基因cDNA克隆、序列分析及表達(dá)量檢測(cè)[J];昆蟲學(xué)報(bào);2008年11期

5 何蕾;薛仁宇;曹廣力;胡小龍;貢成良;;基于RNA-Seq技術(shù)分析家蠶卵巢培養(yǎng)細(xì)胞(BmN)高表達(dá)基因[J];蠶業(yè)科學(xué);2014年03期

6 楊紅蘭;張道遠(yuǎn);劉燕;馬瑞;張?jiān)?;齒肋赤蘚乙醛脫氫酶基因ALDH21的克隆與表達(dá)分析[J];基因組學(xué)與應(yīng)用生物學(xué);2010年01期

7 周鑫;柴保國(guó);趙衛(wèi)東;鄭振宇;;小鼠早期胚胎發(fā)育過程中胚胎發(fā)育相關(guān)功能基因mRNA的表達(dá)[J];河南農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2010年06期

8 王金玲;單雪松;楊雨江;王雪麗;;北京鴨/番鴨雜交體系肝臟組織基因表達(dá)差異的研究[J];家畜生態(tài)學(xué)報(bào);2009年01期

9 單雪松;崔慶媛;李克鵬;王雪麗;楊雨江;;北京鴨×番鴨雜種優(yōu)勢(shì)相關(guān)基因表達(dá)差異研究[J];南京農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);2010年01期

10 崔慶媛;單雪松;李克鵬;梁國(guó)鵬;;北京鴨/番鴨雜交體系肌肉組織基因表達(dá)差異的研究[J];黑龍江畜牧獸醫(yī);2010年05期

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前6條

1 張文俊;江華;趙耀忠;朱曉海;劉安堂;;皮膚惡性黑色素瘤與良性痣基因表達(dá)差異的研究[A];第四屆華東六省一市整形外科學(xué)術(shù)會(huì)議暨2007年浙江省整形、美容學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2007年

2 楊勁松;鄭新民;陳詩書;;誘導(dǎo)PTPα表達(dá)24小時(shí)NIH3T3細(xì)胞基因表達(dá)差異的研究[A];中國(guó)生物化學(xué)與分子生物學(xué)會(huì)第八屆會(huì)員代表大會(huì)暨全國(guó)學(xué)術(shù)會(huì)議論文摘要集[C];2001年

3 孟金萍;劉云波;張以河;孫淑華;王艷蓉;呂鳳柱;楊旭;;鉛暴露U251細(xì)胞基因表達(dá)譜改變及基因通路分析[A];實(shí)驗(yàn)動(dòng)物與藥理學(xué)、毒理學(xué)研究學(xué)術(shù)交流會(huì)論文匯編[C];2009年

4 劉丹慧;陳少松;羅崇林;肖雪媛;何大澄;;一個(gè)在肺癌中缺失的基因的篩選與初步研究[A];中國(guó)細(xì)胞生物學(xué)學(xué)會(huì)2005年學(xué)術(shù)大會(huì)、青年學(xué)術(shù)研討會(huì)論文摘要集[C];2005年

5 賓曉農(nóng);譚敏;呂嘉春;蔣義國(guó);陳家X;;基因芯片篩選BPDE轉(zhuǎn)化16HBE相關(guān)基因的研究[A];第五屆廣東省環(huán)境誘變劑學(xué)會(huì)暨第三屆廣東省預(yù)防醫(yī)學(xué)會(huì)衛(wèi)生毒理專業(yè)委員會(huì)學(xué)術(shù)交流會(huì)論文集[C];2006年

6 霍曉芳;張俊武;;紅系分化相關(guān)基因的鑒別與功能研究[A];中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)七屆一次青年研討會(huì)暨上海高校模式生物E——研究院第一屆模式生物學(xué)術(shù)研討會(huì)論文匯編[C];2005年

中國(guó)重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前4條

1 吳一福;第四軍醫(yī)大學(xué)發(fā)現(xiàn)抑癌新基因[N];中國(guó)醫(yī)藥報(bào);2008年

2 柯尊洪;基因技術(shù)在中藥研究中的作用[N];中國(guó)中醫(yī)藥報(bào);2002年

3 王興 閆智勇 郝曉鋒;借助基因技術(shù)發(fā)展現(xiàn)代中藥[N];中國(guó)醫(yī)藥報(bào);2003年

4 本報(bào)記者 吳紅月;醫(yī)院病理科借助基因檢測(cè)延伸新服務(wù)[N];科技日?qǐng)?bào);2014年

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 李倩;轉(zhuǎn)Nramp1基因克隆牛的研制[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2015年

2 朱明庫(kù);番茄SlNAC4和SlDEAD31基因在果實(shí)成熟及非生物脅迫響應(yīng)中的功能研究[D];重慶大學(xué);2015年

3 陳鵬程;人類分子相互作用在線資源及多物種的基因集功能關(guān)聯(lián)分析工具的建立[D];浙江大學(xué);2015年

4 孫占斌;粉紅螺旋聚孢霉67-1菌寄生相關(guān)基因的篩選與功能研究[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2015年

5 韓洪強(qiáng);控制茄子果型相關(guān)性狀關(guān)鍵基因的克隆及功能研究[D];上海交通大學(xué);2014年

6 王X;牦�；蚪M遺傳變異圖譜和高原適應(yīng)的轉(zhuǎn)錄組研究[D];蘭州大學(xué);2015年

7 吳全金;‘白雞冠’茶樹響應(yīng)光調(diào)控的基因差異及理化特征分析[D];福建農(nóng)林大學(xué);2015年

8 王春麗;AML1/ETO陽性白血病APP基因的臨床意義、生物學(xué)功能及其作用機(jī)制研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2015年

9 李鑫;小鼠腭裂相關(guān)基因的克隆、篩選及功能的研究[D];中國(guó)人民解放軍第四軍醫(yī)大學(xué);2003年

10 孫各琴;幽門螺桿菌可塑區(qū)JHP947基因功能的初步研究[D];福建醫(yī)科大學(xué);2008年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 湯常永;梨‘中矮1號(hào)’矮生基因的篩選及PcAHS克隆與表達(dá)分析[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2015年

2 王慶峰;膠質(zhì)類芽孢桿菌胞外多糖調(diào)節(jié)及相關(guān)基因的轉(zhuǎn)錄分析[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2015年

3 冬方;鯽魚耐鹽堿基因的篩選及驗(yàn)證[D];上海海洋大學(xué);2015年

4 王洋;多氯聯(lián)苯代謝過程中紅球菌應(yīng)激反應(yīng)相關(guān)基因的研究[D];山西大學(xué);2015年

5 陳明明;基于基因本體術(shù)語相似性的通路功能網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建和分析[D];哈爾濱工業(yè)大學(xué);2015年

6 唐奇;CRYAB基因在HCC中的表達(dá)、臨床預(yù)后分析及抗凋亡功能研究[D];南京醫(yī)科大學(xué);2007年

7 楊波波;不同腫瘤基因表達(dá)分析中內(nèi)參基因的選擇和研究[D];西北大學(xué);2014年

8 陳海英;HP450基因的克隆及其重組逆轉(zhuǎn)錄病毒載體pLXSN-HP450的構(gòu)建和鑒定[D];廣西醫(yī)科大學(xué);2006年

9 郭建軍;轉(zhuǎn)反義TrxS基因小麥種子發(fā)育過程中基因表達(dá)差異分析[D];河南農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年

10 梁正翠;鴨的色素相關(guān)基因ASIP和AGRP的研究[D];揚(yáng)州大學(xué);2010年

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本文編號(hào)：925401