本文關(guān)鍵詞：玉米新型氧甲基轉(zhuǎn)移酶基因的全基因組鑒定、進(jìn)化與表達(dá)研究

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【摘要】：利用生物信息學(xué)分析方法挖掘玉米(Zea mays)不同組織間差異表達(dá)的基因,揭示玉米生長(zhǎng)發(fā)育過(guò)程的分子機(jī)理,本研究從NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中下載獲得玉米自交系Mo17和B73根和芽的轉(zhuǎn)錄組數(shù)據(jù),發(fā)現(xiàn)了5個(gè)在根中高表達(dá)的氧甲基轉(zhuǎn)移酶(O-methyltransferase,OMT)基因,在B73全基因組中鑒定到另外的23個(gè)拷貝。對(duì)玉米的28個(gè)氧甲基轉(zhuǎn)移酶基因的結(jié)構(gòu)、保守模體以及進(jìn)化分析表明,其不同于咖啡酸氧甲基轉(zhuǎn)移酶(caffeic acid O-methyltransferase,COMT)基因和咖啡酰輔酶A氧甲基轉(zhuǎn)移酶(caffeoyl coenzyme A 3-O-methyltransferase,CCo AOMT)基因,是一類新型的氧甲基轉(zhuǎn)移酶基因家族。這類基因家族含有5個(gè)進(jìn)化分支,其中有兩個(gè)進(jìn)化分支分別包含苯并VA嗪類基因7(benzoxazinless 7,Bx7)和Bx10,參與苯并VA嗪類物質(zhì)的生物合成,表明該類基因在玉米的抗病蟲(chóng)反應(yīng)中發(fā)揮著重要作用。染色體結(jié)構(gòu)與進(jìn)化分析表明,這類新型氧甲基轉(zhuǎn)移酶基因家族的擴(kuò)增大多是通過(guò)串聯(lián)重復(fù)和片段復(fù)制來(lái)實(shí)現(xiàn)的。對(duì)這些基因在玉米的巢式關(guān)聯(lián)定位(nested association mapping,NAM)群體親本中的表達(dá)模式分析表明,其表達(dá)模式十分復(fù)雜。該研究結(jié)果為進(jìn)一步了解COMT基因的生物學(xué)功能及其利用提供了理論依據(jù)和參考,并對(duì)研究該基因家族的催化機(jī)制及其表達(dá)調(diào)控模式具有重要的指導(dǎo)意義。
【作者單位】： 浙江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;浙江大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物技術(shù)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 氧甲基轉(zhuǎn)移酶(OMT) 基因復(fù)制 新功能化 苯并VA嗪 玉米
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(No.31171165)
【分類號(hào)】：Q943.2
【正文快照】：

【參考文獻(xiàn)】

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【共引文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 范苗;陳銘;徐建紅;;玉米新型氧甲基轉(zhuǎn)移酶基因的全基因組鑒定、進(jìn)化與表達(dá)研究[J];農(nóng)業(yè)生物技術(shù)學(xué)報(bào);2016年08期

【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 倪志勇;呂萌;馬文靜;陳艷;范玲;;棉花咖啡酰輔酶A-O-甲基轉(zhuǎn)移酶基因的克隆及表達(dá)[J];西北植物學(xué)報(bào);2009年10期

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7 宋銀;王東浩;吳錦斌;周露;王國(guó)棟;王U喼，

本文編號(hào)：919841