發(fā)布時(shí)間：2017-09-25 12:29

  本文關(guān)鍵詞：宮頸鱗狀細(xì)胞癌組織中miRNA差異性表達(dá)及其靶基因作為診斷標(biāo)志物的意義

  更多相關(guān)文章： 宮頸鱗狀細(xì)胞癌 微小RNA 腫瘤標(biāo)志物

【摘要】：目的:采用生物信息學(xué)方法研究宮頸鱗狀細(xì)胞癌(CESC)組織中差異性表達(dá)的miRNA并預(yù)測(cè)其靶基因,以期找到影響CESC發(fā)生發(fā)展及可用于腫瘤標(biāo)志物的miRNA。方法:癌癥基因組圖譜(TCGA)數(shù)據(jù)庫(kù)中下載3例CESC組織及3例配對(duì)正常組織,用統(tǒng)計(jì)學(xué)方法對(duì)差異性表達(dá)的基因及miRNA進(jìn)行篩選,通過(guò)靶基因預(yù)測(cè)網(wǎng)站對(duì)差異性表達(dá)的miRNA進(jìn)行靶基因預(yù)測(cè),運(yùn)用KEGG數(shù)據(jù)庫(kù)分析靶基因參與的腫瘤相關(guān)信號(hào)通路。結(jié)果:與同源正常組織比較,CESC組織有18個(gè)miRNA和1 180個(gè)基因有差異性表達(dá)(P0.05),其中有15個(gè)miRNA和411個(gè)基因上調(diào),3個(gè)miRNA和770個(gè)基因下調(diào),采用靶基因預(yù)測(cè)網(wǎng)站有7個(gè)miRNA與預(yù)測(cè)到的靶基因呈負(fù)向調(diào)控關(guān)系,6個(gè)上調(diào)miRNA的靶基因下調(diào),1個(gè)下調(diào)miRNA的靶基因上調(diào),靶基因集中在Wnt、MAPK、P53和cAMP等腫瘤相關(guān)信號(hào)通路。結(jié)論:差異性表達(dá)的miRNA包括hsa-miR-27a、hsa-miR-148b、hsa-miR-185、hsa-miR-200a、hsa-miR-200b、hsa-miR-221和hsa-mir-133b,差異性表達(dá)的miRNA及其靶基因在CESC的發(fā)生發(fā)展過(guò)程中起重要作用,有可能成為診斷CESC的腫瘤標(biāo)志物。
【作者單位】： 吉林大學(xué)公共衛(wèi)生學(xué)院衛(wèi)生部放射生物學(xué)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 宮頸鱗狀細(xì)胞癌 微小RNA 腫瘤標(biāo)志物
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金資助課題(31370837) 吉林省衛(wèi)生計(jì)生委基金資助課題(20142036) 吉林省科技廳科研基金資助課題(201205010)
【分類號(hào)】：R737.33
【正文快照】： 生物信息學(xué)是將分子生物學(xué)與信息處理技術(shù)結(jié)合,以計(jì)算機(jī)為工具對(duì)生物信息進(jìn)行儲(chǔ)存、檢索和分析的交叉學(xué)科,其目的是利用各種數(shù)據(jù)庫(kù),分析整理其數(shù)據(jù)的意義而揭示大量復(fù)雜的生物數(shù)據(jù)所賦有的生物學(xué)奧秘。癌癥基因組圖譜(the cancergenome atlas,TCGA)數(shù)據(jù)庫(kù)是由美國(guó)國(guó)家癌癥研究

【二級(jí)參考文獻(xiàn)】

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【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：917403