板栗丙酮酸磷酸雙激酶基因的克隆與序列分析
本文關鍵詞:板栗丙酮酸磷酸雙激酶基因的克隆與序列分析
【摘要】:為探索板栗PPDK基因功能以及花粉直感效應分子機理,以板栗果實為材料,根據(jù)已登錄的擬南芥、桃樹、巨桉等多種其他植物物種的PPDK基因序列的保守區(qū),設計特異性引物。利用RT-PCR技術克隆出板栗PPDK基因的編碼區(qū),并進行序列分析。結(jié)果表明,該基因長為3 293bp,包含一個完整的ORF,長2 676bp,編碼892個氨基酸,分子量為97.89KDa。所編碼的氨基酸序列與已知植物來源的若干PPDK基因相比,同源性大多在85%以上,證明所克隆的目的片段為PPDK基因,并將該序列登錄到GenBank,登錄號為KU234550。在PPDK基因所編碼的氨基酸序列中發(fā)現(xiàn)了一個磷酸烯醇式丙酮酸利用酶磷酸化位點標記,一個拉鏈結(jié)構(gòu)和多個磷酸化位點。同時推測出多肽鏈中有規(guī)則重復的構(gòu)象,并同源建模PPDK蛋白整條肽鏈的三維空間結(jié)構(gòu)。試驗認為PPDK基因可能通過影響板栗光合作用進而使板栗在果實大小、淀粉含量等方面表現(xiàn)出明顯的花粉直感效應。
【作者單位】: 西南林業(yè)大學林學院;
【關鍵詞】: 板栗 PPDK 序列分析
【基金】:國家自然科學基金(30860231) 云南省教育廳科學研究基金(2013y125)
【分類號】:S664.2
【正文快照】: 板栗(Castanea mollissima)為殼斗科栗屬植物,是一種經(jīng)濟價值極高的樹種,也是我國特有的優(yōu)良堅果類果樹[1]。板栗在我國的栽培歷史悠久,栽培面積廣泛,達22個省(自治區(qū)、直轄市)以上,產(chǎn)量居世界第1位[2]。但根據(jù)我國板栗生產(chǎn)現(xiàn)狀來看,單位面積產(chǎn)量低仍是板栗生產(chǎn)的主要問題[3]
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,本文編號:905456
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