本文關鍵詞：微小RNA靶基因預測及功能分析方法綜述

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【摘要】：miRNA主要的功能是與靶標miRNA的3′或5′非翻譯區(qū)甚至CDS區(qū)進行不完全不精確的堿基配對,從而抑制信使RNA(miRNA)的翻譯或降解miRNA。然而,目前對大多數(shù)mi RNA的調(diào)節(jié)機制及其結(jié)合的靶基因知之甚少�；谟嬎闵飳W的mi RNA靶基因預測提供了一種有效且經(jīng)濟的分析方法,對目前幾個典型的mi RNA靶基因的生物信息學分析方法進行了系統(tǒng)闡述,詳細論述了mi RNA靶基因的預測方法和靶基因下游的生物信息學分析,包括mi RNA差異篩選、靶基因預測、靶基因富集分析、mi RNA和靶基因相互作用網(wǎng)絡的構(gòu)建、mi RNA與通路的網(wǎng)絡構(gòu)建等,系統(tǒng)論述了mi RNA差異表達的分析方法和步驟,為實驗驗證結(jié)果提供了可靠的參考方法,為開展mi RNA的功能分析和實驗研究提供借鑒。
【作者單位】： 廣東醫(yī)學院中美腫瘤研究所;北方民族大學生物科學與工程學院;天津師范大學生命科學學院;
【關鍵詞】： miRNA 靶基因預測 功能分析
【基金】：寧夏高等學校科學研究資助項目(NGY20140155)
【分類號】：Q78
【正文快照】： 0引言微小RNA(mi RNA)是一類廣泛存在于真核動、植物細胞中的一類平均長度約18~24 nt的內(nèi)源性小分子非編碼RNA,在物種進化中相當保守,其表達具有顯著的組織和時序特異性。截止到2014年6月,Sanger數(shù)據(jù)庫Version 19.0(http://www.mirbase.org/)公布的mi RNA數(shù)目達到了28 654個。

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