本文關(guān)鍵詞：小麥UROS基因的可變剪接

  更多相關(guān)文章： 小麥 返白系 尿卟啉原Ⅲ合成酶 可變剪接 標(biāo)準(zhǔn)剪接與非標(biāo)準(zhǔn)剪接

【摘要】：可變剪接是一種重要的基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制,對(duì)植物的發(fā)育、生理、代謝、信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)以及外界逆境的響應(yīng)等多個(gè)過程都有調(diào)控。為進(jìn)一步探討小麥基因的可變剪接機(jī)制以及深入研究小麥UROS基因的功能,以返白系、矮變1號(hào)和中國(guó)春三個(gè)普通六倍體小麥品種為材料,克隆了尿卟啉原Ⅲ合成酶基因(UROS)的gDNA和cDNA序列,并利用生物信息學(xué)技術(shù)研究了小麥葉片中UROS基因的可變剪接方式。結(jié)果表明,根據(jù)在線小麥基因組數(shù)據(jù)庫(kù),將克隆到的UROS基因組DNA序列分別定位在4BL和4DL兩個(gè)基因位點(diǎn),命名為UROS-4B和UROS-4D。從三個(gè)品種中克隆得到大約50個(gè)不同的UROS基因cDNA序列,通過在線預(yù)測(cè)和與基因組序列比對(duì),發(fā)現(xiàn)UROS基因存在可變剪接,并鑒定出兩個(gè)UROS基因位點(diǎn)各有一個(gè)標(biāo)準(zhǔn)剪接轉(zhuǎn)錄本和兩個(gè)非標(biāo)準(zhǔn)剪接轉(zhuǎn)錄本。可變剪接方式以內(nèi)含子保留為主,還有可變的供體剪接位點(diǎn)和可變的受體剪接位點(diǎn),品種間的剪接方式不完全相同。由不同轉(zhuǎn)錄本預(yù)測(cè)編碼的多肽氨基酸序列也存在差異,兩個(gè)基因位點(diǎn)選取的六個(gè)轉(zhuǎn)錄本所編碼的多肽有12個(gè)氨基酸位點(diǎn)的變異。
【作者單位】： 西北農(nóng)林科技大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;旱區(qū)作物逆境生物學(xué)研究國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 小麥 返白系 尿卟啉原Ⅲ合成酶 可變剪接 標(biāo)準(zhǔn)剪接與非標(biāo)準(zhǔn)剪接
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(30971769,31371541)
【分類號(hào)】：S512.1
【正文快照】： rieties showed diverse splicing types.In addition,the predicated amino acid sequence of these tran-scripts were dissimilar,twelve variant amino acid sites were identified from six polypeptides encodedby six clones from different transcripts,respectively.

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前8條

1 羅艷;王瑛;;茄子SmU2AF~(65)基因的可變剪接[J];遺傳;2008年11期

2 盛潔;貢成良;薛仁宇;謝敏;張曉榮;李艷梅;曹廣力;;家蠶vasa樣基因表達(dá)的可變剪接[J];蠶業(yè)科學(xué);2009年02期

3 邱莫寒;俞寧;;RNA的可變剪接[J];畜牧與飼料科學(xué);2010年05期

4 黃艷群;陳文;李寧;鄧學(xué)梅;康相濤;;雞Lmbr1基因一種異常可變剪接的克隆和表達(dá)分析[J];畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào);2010年05期

5 黃正洋;陳陽(yáng);李欣鈺;甄霆;張揚(yáng);徐琪;段修軍;趙文明;陳國(guó)宏;;鴨TLR4基因可變剪接體的克隆、鑒定及組織表達(dá)分析[J];畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào);2013年05期

6 楊秀芹;翟春媛;李海濤;劉娣;;豬TLR4基因可變剪接體的鑒定[J];畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào);2011年08期

7 薛高旭;曹廣力;張鵬杰;張瑤瑤;薛仁宇;貢成良;;家蠶卵巢腫瘤基因Bmotu及其可變剪接[J];蠶業(yè)科學(xué);2011年04期

8 ;[J];;年期

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前5條

1 張繼業(yè);任長(zhǎng)虹;龐劍會(huì);趙娜;劉虎岐;張成崗;;可變剪接在缺氧應(yīng)答中的調(diào)控作用[A];Proceedings of the 8th Biennial Conference of the Chinese Society for Neuroscience[C];2009年

2 周春燕;張朵;張曉;富顯果;廖娟;蘭風(fēng)華;;人eIF2B4基因一個(gè)新型可變剪接產(chǎn)物及其鑒定[A];中國(guó)的遺傳學(xué)研究——遺傳學(xué)進(jìn)步推動(dòng)中國(guó)西部經(jīng)濟(jì)與社會(huì)發(fā)展——2011年中國(guó)遺傳學(xué)會(huì)大會(huì)論文摘要匯編[C];2011年

3 肖銳;孫濤;吳同彬;魏然;卓曉宇;付向東;張翼;;大規(guī)模RNA干擾篩選具有可變剪接調(diào)控蛋白[A];湖北省暨武漢市生物化學(xué)與分子生物學(xué)學(xué)會(huì)第八屆第十七次學(xué)術(shù)年會(huì)論文匯編[C];2007年

4 富顯果;廖娟;郭小燕;嚴(yán)愛貞;張朵;鄭德柱;蘭風(fēng)華;;FMR1基因的可變剪接及其意義[A];第九屆全國(guó)遺傳病診斷與產(chǎn)前診斷學(xué)術(shù)交流會(huì)暨產(chǎn)前診斷和醫(yī)學(xué)遺傳學(xué)新技術(shù)研討會(huì)論文集[C];2014年

5 黃正洋;陳陽(yáng);李欣鈺;甄霆;張揚(yáng);徐琪;趙文明;陳國(guó)宏;;鴨TLR4基因可變剪接體的克隆、鑒定及組織表達(dá)分析[A];中國(guó)畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)家禽學(xué)分會(huì)第九次代表會(huì)議暨第十六次全國(guó)家禽學(xué)術(shù)討論會(huì)論文集[C];2013年

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 富顯果;FMR1基因的可變剪接及其意義[D];福建醫(yī)科大學(xué);2014年

2 諸葛堅(jiān);細(xì)胞色素P450 2D6和2C18的可變剪接研究[D];浙江大學(xué);2003年

3 呂俊杰;采用智能方法的可變剪接調(diào)控機(jī)制與相關(guān)疾病研究[D];哈爾濱工程大學(xué);2012年

4 武鵬;肝臟不同類型細(xì)胞基因表達(dá)及可變剪接的研究[D];中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2014年

5 劉舒云;小鼠基因sidt2的可變剪接研究及功能初步探討[D];中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2008年

6 徐佳熹;基于比較基因組學(xué)和mRNA高通量測(cè)序的可變剪接外顯子進(jìn)化研究[D];復(fù)旦大學(xué);2011年

7 詹雷雷;RNA互斥可變剪接的進(jìn)化和調(diào)控機(jī)制的研究[D];浙江大學(xué);2011年

8 杭興宜;利用外顯子芯片研究缺血/缺氧損傷相關(guān)的剪接調(diào)控機(jī)制[D];中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2009年

9 李稚鋒;真核基因剪接機(jī)制相關(guān)特征研究[D];國(guó)防科學(xué)技術(shù)大學(xué);2006年

10 李國(guó)麗;果蠅Dscam和Tep2基因互斥可變剪接機(jī)制的研究[D];浙江大學(xué);2013年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 胡興;基于最優(yōu)搜索的基因可變剪接的預(yù)測(cè)[D];電子科技大學(xué);2008年

2 章天驕;基因組可變剪接特征分析與預(yù)測(cè)[D];哈爾濱工業(yè)大學(xué);2011年

3 曹新茹;家蠅鐵蛋白基因的克隆、表達(dá)及功能分析[D];河北大學(xué);2015年

4 戴嵐芝;果蠅CG30427 mRNA前體3'端互斥可變剪接的調(diào)控機(jī)制研究[D];浙江大學(xué);2015年

5 劉陽(yáng);擬南芥形態(tài)和生理進(jìn)化的比較研究[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

6 張珊珊;基于RNA-Seq數(shù)據(jù)的小鼠神經(jīng)發(fā)育中可變剪接的研究[D];南京航空航天大學(xué);2015年

7 張曉娜;中國(guó)人群組織特異性可變剪接體的鑒定[D];上海交通大學(xué);2008年

8 李佩堯;血管內(nèi)皮細(xì)胞中缺氧相關(guān)基因的可變剪接研究[D];中國(guó)人民解放軍軍事醫(yī)學(xué)科學(xué)院;2008年

9 胡競(jìng);基于博弈論的可變剪接預(yù)測(cè)算法研究[D];福建農(nóng)林大學(xué);2013年

10 李敏;內(nèi)含子保留型可變剪接預(yù)測(cè)及可變剪接與蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)多樣性分析[D];內(nèi)蒙古科技大學(xué);2015年

，

本文編號(hào)：883197