本文關鍵詞：CCL5、CCR5和MIF基因多態(tài)性與結核病易感性研究

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【摘要】：目的探討趨化因子5(CCL5)、趨化因子受體5(CCR5)和巨噬細胞遷徙抑制因子(MIF)基因多態(tài)性與中國漢族人群結核病(tuberculosis,TB)易感性的關系。方法本研究采用病例對照研究方法,選取2014年2月至2015年4月首都醫(yī)科大學附屬北京胸科醫(yī)院收治的428例結核病患者作為病例組;選取387名健康志愿者作為對照組。采集研究對象靜脈血,使用競爭性等位基因特異性PCR方法(Kompetitive Allele Specific PCR,KASP)檢測其CCL5啟動子區(qū)rs2280788和rs2107538基因型,CCR5啟動子區(qū)rs1799987,MIF rs2070767。使用R語言計算各基因位點Hardy-Weinberg平衡評估樣本群體代表性,計算病例組和對照組的基因型及等位基因頻率,并對其分布情況進行比較,分析各基因多態(tài)性與TB患病的相關性。應用Haploview4.2軟件構建CCL5基因單倍型,構建形成基因雙倍體,并分析其與結核病易感性相關性。使用多因子降維法分析各基因位點之間交互作用及l(fā)ogistic回歸。結果CCL5啟動子區(qū)rs2280788基因位點CC、CG、GG基因型及等位基因C、G的頻次和頻率病例組分別為:77%(330/428)、22%(94/428)、1%(4/428)和88%(754/856)、12%(102/856);對照組分別為:76%(295/387)、22%(87/387)、1%(5/387)和87%(677/774)、13%(97/774),兩組之間基因型分布和等位基因分布差異均無統(tǒng)計學意義(χ2值分別為0.28和0.0923,P值均0.05)。CCL5啟動子區(qū)rs2107538基因位點CC、CT、TT基因型及等位基因C、T的頻次和頻率病例組分別為:42%(178/428)、46%(196/428)、13%(54/428)和64%(552/856)、36%(304/856);對照組分別為:36%(139/387)、51%(197/387)、13%(51/387)和61%(475/774)、39%(299/774),兩組之間基因型分布和等位基因分布差異均無統(tǒng)計學意義(χ2值分別為2.831和1.5627,P值均0.05)。CCR5啟動子區(qū)rs1799987基因AA、AG、GG基因型及等位基因A、G的頻次和頻率病例組分別為:18%(77/428)、57%(245/428)、25%(106/428)和47%(399/856)、53%(457/856);對照組分別為:16%(67/387)、51%(197/387)、33%(128/387)和41%(321/774)、59%(453/774),兩組之間基因型分布和等位基因分布差異均有統(tǒng)計學意義(χ2值分別為6.8545和4.1475,P值均0.05)。攜帶該位點基因型GG和等位基因G可降低TB患病風險[OR(95%CI)值分別為:0.68(0.50~0.91)、0.78(0.64~0.94)]。MIF的rs2070767基因位點CC、CT、TT基因型及等位基因C、T的頻次和頻率病例組分別為:38%(162/428)、50%(216/428)、12%(50/428)和63%(540/856)、37%(316/856);對照組分別為:42%(162/387)、47%(180/387)、12%(50/387)和65%(504/774)、35%(270/774),兩組之間基因型分布和等位基因分布差異均無統(tǒng)計學意義(χ2值分別為1.477和0.6434,P值均0.05)。對CCL5基因構建的單倍型及雙倍體分析,發(fā)現(xiàn)由rs2280788和rs2107538位點構成的G-C單倍型與結核病易感性顯著相關(OR=4.13,95%CI:1.35-16.85),CG-CC組成的雙倍型與結核病易感性顯著相關(OR=12.07,95%CI:1.8-513.99)。分析各基因位點之間MDR交互作用,rs1799987位點有統(tǒng)計學意義。logistic回歸模型中發(fā)現(xiàn)rs1799987及AA相對于AG更易患病,而GG相較于AG也更易患病。結論在本研究中未發(fā)現(xiàn)CCL5啟動子區(qū)rs2280788、rs2107538和MIF啟動子區(qū)rs2070767基因多態(tài)性與結核病患病相關。攜帶CCR5啟動子區(qū)rs1799987基因位點基因型GG和等位基因G可降低TB患病風險。CCL5基因rs2280788和rs2107538多態(tài)性位點構建的單倍型G-C可能是結核病發(fā)病的危險因素,構建形成的雙倍體CG-CC是結核病發(fā)病的危險因素。MDR交互作用和logistic回歸分析均發(fā)現(xiàn)rs1799987與結核病發(fā)病相關。
【關鍵詞】：趨化因子類 多態(tài)性 單核苷酸 結核病 疾病易感性
【學位授予單位】：北京市結核病胸部腫瘤研究所
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：R52
【目錄】：

• 中英文縮略詞對照表5-7
• 中文摘要7-9
• 英文摘要9-11
• 前言11-16
• 材料與方法16-26
• 結果26-34
• 討論34-40
• 實驗結論40-41
• 參考文獻41-51
• 文獻綜述 CCR5及配體基因多態(tài)性與結核病易感性研究進展51-66
• 參考文獻59-66
• 攻讀學位期間發(fā)表論文情況66-67
• 致謝67-68
• 個人簡歷68

【參考文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 張建武;邢志偉;李欣;孫志平;孫紅梅;賈建雷;;CCL3和CCL4基因多態(tài)性與肺結核易感性的關系[J];山東醫(yī)藥;2014年40期

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本文編號：871188