大豆GmST1基因的生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2017-09-17 07:04
本文關(guān)鍵詞:大豆GmST1基因的生物信息學(xué)分析
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【摘要】:磺基轉(zhuǎn)移酶(sulfotransferase,SULT)基因是一個(gè)基因超家族。對(duì)大豆磺基轉(zhuǎn)移酶基因GmST1(Glyma.13G191400)進(jìn)行基于生物信息學(xué)的基因結(jié)構(gòu)分析與功能預(yù)測(cè),結(jié)果表明:GmST1(Williams82)基因序列全長(zhǎng)1 439 bp,CDS區(qū)長(zhǎng)1 035 bp,編碼344個(gè)氨基酸。通過序列比對(duì),分析出在感病Williams 82和抗病品種東農(nóng)93-046中,GmST1序列存在著非同義SNP,導(dǎo)致氨基酸改變。利用Plant CARE分析啟動(dòng)子元件,發(fā)現(xiàn)在基因啟動(dòng)子序列中含有多個(gè)與光誘導(dǎo)、生長(zhǎng)素、水楊酸、干旱等相關(guān)的元件。在BAR數(shù)據(jù)庫中分析了GmST1的擬南芥同源基因在不同逆境脅迫條件下基因表達(dá)情況,表明該基因表達(dá)具有組織表達(dá)特異性,參與鹽脅迫、干旱脅迫和抗病等相關(guān)反應(yīng)。
【作者單位】: 東北農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)學(xué)院/大豆生物學(xué)教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/東北農(nóng)業(yè)大學(xué)農(nóng)業(yè)部東北大豆生物學(xué)與遺傳育種重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】: 大豆 GmST 磺基轉(zhuǎn)移酶 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分析 功能預(yù)測(cè)
【基金】:國(guó)家現(xiàn)代農(nóng)業(yè)產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CARS-04-PS04) 國(guó)家自然科學(xué)基金(31301339) 黑龍江省教育廳科學(xué)技術(shù)研究項(xiàng)目(12541049) 黑龍江省普通高等學(xué)校新世紀(jì)優(yōu)秀人才培養(yǎng)計(jì)劃(1253-NCET-005)
【分類號(hào)】:S565.1
【正文快照】: SULT是一個(gè)基因超家族,家族成員包括酚磺基轉(zhuǎn)移酶、雌激素磺基轉(zhuǎn)移酶、羥基類固醇磺基轉(zhuǎn)移酶以及脫水表雄甾酮磺基轉(zhuǎn)移酶等[1-2]。它參與機(jī)體內(nèi)的Ⅱ相代謝,催化多種內(nèi)源性和外源性復(fù)合物進(jìn)行硫酸化代謝,有解毒作用[3];腔D(zhuǎn)移酶在人類、動(dòng)植物及微生物中均有發(fā)現(xiàn)[4]。其中,,
本文編號(hào):867941
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