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金針菇凝集素基因Fv-mJRL1的生物信息學分析及其共表達

發(fā)布時間:2017-09-16 14:06

  本文關鍵詞:金針菇凝集素基因Fv-mJRL1的生物信息學分析及其共表達


  更多相關文章: jacalin凝集素 子實體形成 潛在轉錄因子 皮爾森相關系數(shù)


【摘要】:Jacalin凝集素(jacalin-related lectins,JRLs)是一類含有一個或多個JRL結構域的蛋白質,參與生物或非生物環(huán)境刺激應答.本研究基于金針菇(Flammulina velutipes)基因組數(shù)據(jù),注釋篩選到其中一個JRL基因Fv-mJRL1,對其基因結構、蛋白質性質進行了生物信息學分析,并利用其上游調控序列進一步預測到該基因潛在的轉錄因子Fv-Mbp1.通過實時熒光定量PCR分析得知,無論是在不同栽培基質培養(yǎng)的金針菇菌絲還是在金針菇各發(fā)育時期的組織中,Fv-mJRL1基因與潛在的轉錄因子基因Fv-Mbp1之間都存在極強的共表達規(guī)律.生物信息學及實時熒光定量PCR分析為篩選挖掘基因潛在的轉錄因子提供便利,后期仍需利用下游分子實驗進行更為精確的驗證.
【作者單位】: 福建農(nóng)林大學生命科學學院菌物研究中心;
【關鍵詞】jacalin凝集素 子實體形成 潛在轉錄因子 皮爾森相關系數(shù)
【基金】:國家重點基礎研究發(fā)展計劃(973計劃)(2014CB138302)
【分類號】:S646.15
【正文快照】: 金針菇營養(yǎng)豐富且味道鮮美,具有很高的食用和藥用價值,是我國和東南亞地區(qū)重要的商業(yè)性栽培食用菌.金針菇屬低溫結實性食用菌,菌絲生長適宜溫度為20~23℃,原基形成適宜溫度為3~18℃[1].菌絲營養(yǎng)生長結束之后,需要低溫處理刺激原基形成,但這種低溫刺激影響金針菇結實的分子機理

本文編號:863480

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