本文關(guān)鍵詞：楊樹磷酸肌醇特異性磷脂酶C基因家族鑒定與分析

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【摘要】：為了對已測序楊樹Populus trichocarpa Torr.Gray中磷酸肌醇特異性磷脂酶C(phosphoinositidespecific phospholipase C,PI-PLC)家族基因進(jìn)行系統(tǒng)分析,利用楊樹基因組數(shù)據(jù)庫,通過生物信息學(xué)手段,鑒定楊樹PI-PLC家族基因的基因結(jié)構(gòu)、染色體定位和編碼蛋白,通過蛋白序列比對進(jìn)行進(jìn)化和分類分析。結(jié)果表明,楊樹中含有7個PI-PLC家族基因,含有8~10個外顯子,分布于楊樹的4條染色體上。MEME和Pfam保守結(jié)構(gòu)域分析顯示,楊樹PI-PLC蛋白均含有4個保守的EF、X、Y和C2結(jié)構(gòu)域。蛋白質(zhì)進(jìn)化樹分析結(jié)果表明PI-PLC可分為2個亞家族。
【作者單位】： 北京市農(nóng)林科學(xué)院北京農(nóng)業(yè)生物技術(shù)研究中心;農(nóng)業(yè)基因資源與生物技術(shù)北京市重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】： 磷酸肌醇特異性磷脂酶C 楊樹 進(jìn)化分析 基因家族
【基金】：國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃(863)項目(2013AA102702) 國家自然科學(xué)基金(31270593) 北京市自然科學(xué)基金(6163028) 北京市農(nóng)林科學(xué)院青年科研基金(QNJJ201416)
【分類號】：S792.11
【正文快照】： 磷酸肌醇特異性磷脂酶C(phosphoinositide-specific phospholipase C,PI-PLC)是一類水解磷脂的酶類,其水解4,5-二磷酸磷脂酰肌醇(PIP2),產(chǎn)生1,4,5-三磷酸肌醇(IP3)和1,2-二酰甘油(DAG)[1]。植物細(xì)胞中,水溶性IP3進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)后在一系列磷酸激酶的作用下可以迅速轉(zhuǎn)化為IP6,促進(jìn)細(xì)

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 安新民,張上隆,徐昌杰;柑桔轉(zhuǎn)化酶基因家族新成員的克隆和序列分析[J];上海交通大學(xué)學(xué)報(農(nóng)業(yè)科學(xué)版);2003年01期

2 牛艷梅;沈文濤;周鵬;;Expansin超級家族的進(jìn)化與命名[J];廣東農(nóng)業(yè)科學(xué);2007年08期

3 魏云虎;張煜s，

本文編號：862050