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基于16S rRNA和RubisCO基因?qū)κ人崃驐U菌的系統(tǒng)發(fā)育及多樣性

發(fā)布時(shí)間:2017-09-12 10:33

  本文關(guān)鍵詞:基于16S rRNA和RubisCO基因?qū)κ人崃驐U菌的系統(tǒng)發(fā)育及多樣性


  更多相關(guān)文章: Acidithiobacillus spp. S rRNA基因 RubisCO基因 系統(tǒng)發(fā)育 遺傳多樣性


【摘要】:【目的】明確不同地理來源的Acidithiobacillus spp.種群是否表現(xiàn)出顯著的地域性和異域物種形成;為了解微生物譜系地理、多樣性維持機(jī)制和微生物分子地理學(xué)提供基礎(chǔ)數(shù)據(jù)!痉椒ā坎捎16S r RNA基因、核酮糖-1,5-二磷酸羧化酶/加氧酶(Rubis CO)功能基因序列同源性分析構(gòu)建相應(yīng)的系統(tǒng)發(fā)育樹,分析Acidithiobacillus spp.種群的遺傳多樣性!窘Y(jié)果】從3個(gè)不同的地域分離到35株菌聚為5大類群,其中菌株YNTR4-15可能是鐵氧化細(xì)菌(Leptspirillum ferrooxidans),菌株HBDY3-3被鑒定為另一鐵氧化細(xì)菌(Leptospirillum ferrodiazotrophum);有4株可能是Acidithiobacillus ferrivorans;6株是Acidithiobacillus ferridurans,其余菌株均被鑒定為Acidithiobacilus ferrooxidan。對(duì)26株代表性菌株的Rubis CO I型cbb L基因和II型cbb M基因的分析,發(fā)現(xiàn)19株菌具有雙拷貝cbb L基因,分別為cbb L1和cbb L2基因;7株菌只檢測(cè)到了cbb L1。cbb L1和cbb L2基因都有3個(gè)序列型;而cbb M基因是單拷貝。Rubis CO基因的密碼子偏愛性不強(qiáng)!窘Y(jié)論】分離自3個(gè)地域的菌株16S r RNA/Rubis CO基因存在序列差異,Acidithiobacillus spp.種群存在顯著的遺傳多樣性。嗜酸硫桿菌分離菌株基于16S r RNA基因的系統(tǒng)發(fā)育樹和Rubis CO基因的發(fā)育樹不一致。
【作者單位】: 石河子大學(xué)食品學(xué)院;石河子大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】Acidithiobacillus spp. S rRNA基因 RubisCO基因 系統(tǒng)發(fā)育 遺傳多樣性
【基金】:國(guó)家自然基金(31260001,C010101)~~
【分類號(hào)】:Q933
【正文快照】: 嗜酸硫桿菌(Acidithiobacillus)是一類極其重要的極端微生物,能在極酸(p H1-3)、高濃度重金屬環(huán)境中生長(zhǎng)繁殖[1]。硫桿菌屬的細(xì)菌是革蘭氏陰性,桿狀,化能無機(jī)自養(yǎng)生物型,通過氧化亞鐵、硫和部分硫化物獲得能量[1 3],在地球表面的酸礦廢水、酸性污泥等含硫環(huán)境中分布廣泛。到

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本文編號(hào):836710

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