本文關(guān)鍵詞：基于生物信息學分析人類線粒體轉(zhuǎn)錄終止因子1基因啟動子

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【摘要】：目的線粒體轉(zhuǎn)錄終止因子1(mitchondrial transcription termination factor 1,MTERF1)編碼蛋白質(zhì)是調(diào)控線粒體基因表達和氧化磷酸化的重要因子。文中旨在分析人類MTERF1基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控序列、轉(zhuǎn)錄因子及其結(jié)合位點。方法采用進化足跡法,利用生物信息學在線軟件對人類MTERF1基因5'端上游的啟動子分布、Cp G島、轉(zhuǎn)錄因子及其結(jié)合位點進行分析。結(jié)果人類MTERF1基因定位于7q21.2,基因全長7845 bp,含有4個外顯子和3個內(nèi)含子�；蛏嫌�5'端2500bp的核苷酸序列至少存在2個啟動子,其中1878-2447 bp之間可能包含核心啟動子。啟動子區(qū)序列中存在1個長為812 bp的Cp G島。人類和小鼠MTERF1同源基因存在26個共同的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點。結(jié)論生物信息學在線軟件能預測人類MTERF1基因啟動子和轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點,提高了針對該基因啟動子的研究效率。
【作者單位】： 大理大學基礎(chǔ)醫(yī)學院/云南省昆蟲生物醫(yī)藥研發(fā)重點實驗室;大理市第一人民醫(yī)院呼吸內(nèi)科;
【關(guān)鍵詞】： 生物信息學 線粒體轉(zhuǎn)錄終止因子 啟動子 Cp G島 轉(zhuǎn)錄因子
【基金】：國家自然科學基金(81560458) 云南省教育廳科學研究基金(2014Z126) 大理大學博士科研啟動基金(BSKY2012018);大理大學大學生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)計劃項目(201402)
【分類號】：Q811.4;R3416
【正文快照】： 0引言線粒體轉(zhuǎn)錄終止因子蛋白家族(mitochondrialtranscription termination factor,MTERF)是一類核基因編碼轉(zhuǎn)運到線粒體,并與線粒體DNA(mitochon-drial DNA,mt DNA)特異性結(jié)合的單體蛋白,在線粒體復制、轉(zhuǎn)錄和翻譯中發(fā)揮調(diào)控作用[1]。目前在脊椎動物中發(fā)現(xiàn)4個MTERF蛋白家族

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 張喜南;;轉(zhuǎn)錄的終止作用和反終止作用[J];河北農(nóng)業(yè)大學學報;1988年04期

2 劉珊珊;李鈺;;哺乳動物細胞線粒體基因的轉(zhuǎn)錄與調(diào)控[J];細胞生物學雜志;2009年06期

3 ;[J];;年期

中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 張翼;轉(zhuǎn)錄終止因子PDE191調(diào)控擬南芥rpoA基因的轉(zhuǎn)錄終止[D];上海師范大學;2013年

2 張曉雷;擬南芥mTERF蛋白PDE191功能的初步研究[D];上海師范大學;2011年

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本文編號：833865