發(fā)布時(shí)間：2017-09-12 00:07

  本文關(guān)鍵詞：基于生物信息學(xué)分析人類線粒體轉(zhuǎn)錄終止因子1基因啟動(dòng)子

  更多相關(guān)文章： 生物信息學(xué) 線粒體轉(zhuǎn)錄終止因子 啟動(dòng)子 Cp G島 轉(zhuǎn)錄因子

【摘要】：目的線粒體轉(zhuǎn)錄終止因子1(mitchondrial transcription termination factor 1,MTERF1)編碼蛋白質(zhì)是調(diào)控線粒體基因表達(dá)和氧化磷酸化的重要因子。文中旨在分析人類MTERF1基因的轉(zhuǎn)錄調(diào)控序列、轉(zhuǎn)錄因子及其結(jié)合位點(diǎn)。方法采用進(jìn)化足跡法,利用生物信息學(xué)在線軟件對(duì)人類MTERF1基因5'端上游的啟動(dòng)子分布、Cp G島、轉(zhuǎn)錄因子及其結(jié)合位點(diǎn)進(jìn)行分析。結(jié)果人類MTERF1基因定位于7q21.2,基因全長(zhǎng)7845 bp,含有4個(gè)外顯子和3個(gè)內(nèi)含子�；蛏嫌�5'端2500bp的核苷酸序列至少存在2個(gè)啟動(dòng)子,其中1878-2447 bp之間可能包含核心啟動(dòng)子。啟動(dòng)子區(qū)序列中存在1個(gè)長(zhǎng)為812 bp的Cp G島。人類和小鼠MTERF1同源基因存在26個(gè)共同的轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn)。結(jié)論生物信息學(xué)在線軟件能預(yù)測(cè)人類MTERF1基因啟動(dòng)子和轉(zhuǎn)錄因子結(jié)合位點(diǎn),提高了針對(duì)該基因啟動(dòng)子的研究效率。
【作者單位】： 大理大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院/云南省昆蟲(chóng)生物醫(yī)藥研發(fā)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;大理市第一人民醫(yī)院呼吸內(nèi)科;
【關(guān)鍵詞】： 生物信息學(xué) 線粒體轉(zhuǎn)錄終止因子 啟動(dòng)子 Cp G島 轉(zhuǎn)錄因子
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(81560458) 云南省教育廳科學(xué)研究基金(2014Z126) 大理大學(xué)博士科研啟動(dòng)基金(BSKY2012018);大理大學(xué)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)計(jì)劃項(xiàng)目(201402)
【分類號(hào)】：Q811.4;R3416
【正文快照】： 0引言線粒體轉(zhuǎn)錄終止因子蛋白家族(mitochondrialtranscription termination factor,MTERF)是一類核基因編碼轉(zhuǎn)運(yùn)到線粒體,并與線粒體DNA(mitochon-drial DNA,mt DNA)特異性結(jié)合的單體蛋白,在線粒體復(fù)制、轉(zhuǎn)錄和翻譯中發(fā)揮調(diào)控作用[1]。目前在脊椎動(dòng)物中發(fā)現(xiàn)4個(gè)MTERF蛋白家族

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條

1 張喜南;;轉(zhuǎn)錄的終止作用和反終止作用[J];河北農(nóng)業(yè)大學(xué)學(xué)報(bào);1988年04期

2 劉珊珊;李鈺;;哺乳動(dòng)物細(xì)胞線粒體基因的轉(zhuǎn)錄與調(diào)控[J];細(xì)胞生物學(xué)雜志;2009年06期

3 ;[J];;年期

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

1 張翼;轉(zhuǎn)錄終止因子PDE191調(diào)控?cái)M南芥rpoA基因的轉(zhuǎn)錄終止[D];上海師范大學(xué);2013年

2 張曉雷;擬南芥mTERF蛋白PDE191功能的初步研究[D];上海師范大學(xué);2011年

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本文編號(hào)：833865