本文關鍵詞：卵巢癌多藥耐藥相關基因的生物信息學分析

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【摘要】：目的篩選與挖掘卵巢癌多藥耐藥相關基因及其生物信息。方法基于GSE41499、GSE33482、GSE15372和GSE28739等4套來源不同的卵巢癌化療耐藥與敏感基因芯片表達譜數(shù)據(jù)集,綜合運用差異基因表達分析、基因通路富集分析和文本挖掘等生物信息學方法預測卵巢癌多藥耐藥相關基因及通路。結果 MAPK信號通路、泛素介導的蛋白質水解、軸突導向、焦點粘連、神經(jīng)營養(yǎng)素信號通路、癌癥通路、腎細胞癌、檸檬酸循環(huán)、類萜骨干生物合成、錯配修復和亨廷頓氏舞蹈病等11條基因通路是出現(xiàn)頻率相對較高的顯著性上調通路(P0.05),甘油脂、戊醣酸途徑、果糖和甘露糖代謝、谷胱甘肽代謝、蛋白酶體、p53信號通路和溶酶體等7條基因通路是出現(xiàn)頻率相對較高的顯著性下調通路(P0.05);進一步的文本挖掘發(fā)現(xiàn),ACO1、BDNF、CXCR4、HMGCR和NRP1等5個上調表達基因(P0.05)和CDKN2C、FAS和SKP2等3個下調表達基因(P0.05)可能與卵巢癌多藥耐藥形成相關。結論卵巢癌多藥耐藥機制的形成可能涉及到多種不同的通路和基因,其中ACO1、BDNF、CXCR4、HMGCR、NRP1、CDKN2C、FAS和SKP2等基因可能在其中發(fā)揮著關鍵作用,后續(xù)研究將對其進行實驗和臨床雙重驗證。
【作者單位】： 廣西醫(yī)科大學附屬腫瘤醫(yī)院婦瘤科;廣西醫(yī)科大學醫(yī)學實驗中心生物信息學教研室;
【關鍵詞】： 卵巢癌 多藥耐藥 基因 生物信息學分析 篩選與挖掘
【基金】：國家高技術研究發(fā)展計劃(863計劃)(2012AA02A507) 廣西自然科學基金(桂財教2014-118號) 廣西科學研究與技術開發(fā)計劃課題(桂科攻14124004-1-24)
【分類號】：R737.31
【正文快照】： 多藥耐藥形成相關。結論卵巢癌多藥耐藥機制的形成可能涉及到多種不同的通路和基因,其中ACO1、BDNF、CXCR4、HMGCR、NRP1、CDKN2C、FAS和SKP2等基因可能在其中發(fā)揮著關鍵作用,后續(xù)研究將對其進行實驗和臨床雙重驗證。0引言化療是卵巢癌重要的治療手段。盡管卵巢癌患者對化療的

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