本文關(guān)鍵詞：卵巢癌多藥耐藥相關(guān)基因的生物信息學(xué)分析

  更多相關(guān)文章： 卵巢癌 多藥耐藥 基因 生物信息學(xué)分析 篩選與挖掘

【摘要】：目的篩選與挖掘卵巢癌多藥耐藥相關(guān)基因及其生物信息。方法基于GSE41499、GSE33482、GSE15372和GSE28739等4套來源不同的卵巢癌化療耐藥與敏感基因芯片表達譜數(shù)據(jù)集,綜合運用差異基因表達分析、基因通路富集分析和文本挖掘等生物信息學(xué)方法預(yù)測卵巢癌多藥耐藥相關(guān)基因及通路。結(jié)果 MAPK信號通路、泛素介導(dǎo)的蛋白質(zhì)水解、軸突導(dǎo)向、焦點粘連、神經(jīng)營養(yǎng)素信號通路、癌癥通路、腎細胞癌、檸檬酸循環(huán)、類萜骨干生物合成、錯配修復(fù)和亨廷頓氏舞蹈病等11條基因通路是出現(xiàn)頻率相對較高的顯著性上調(diào)通路(P0.05),甘油脂、戊醣酸途徑、果糖和甘露糖代謝、谷胱甘肽代謝、蛋白酶體、p53信號通路和溶酶體等7條基因通路是出現(xiàn)頻率相對較高的顯著性下調(diào)通路(P0.05);進一步的文本挖掘發(fā)現(xiàn),ACO1、BDNF、CXCR4、HMGCR和NRP1等5個上調(diào)表達基因(P0.05)和CDKN2C、FAS和SKP2等3個下調(diào)表達基因(P0.05)可能與卵巢癌多藥耐藥形成相關(guān)。結(jié)論卵巢癌多藥耐藥機制的形成可能涉及到多種不同的通路和基因,其中ACO1、BDNF、CXCR4、HMGCR、NRP1、CDKN2C、FAS和SKP2等基因可能在其中發(fā)揮著關(guān)鍵作用,后續(xù)研究將對其進行實驗和臨床雙重驗證。
【作者單位】： 廣西醫(yī)科大學(xué)附屬腫瘤醫(yī)院婦瘤科;廣西醫(yī)科大學(xué)醫(yī)學(xué)實驗中心生物信息學(xué)教研室;
【關(guān)鍵詞】： 卵巢癌 多藥耐藥 基因 生物信息學(xué)分析 篩選與挖掘
【基金】：國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃(863計劃)(2012AA02A507) 廣西自然科學(xué)基金(桂財教2014-118號) 廣西科學(xué)研究與技術(shù)開發(fā)計劃課題(桂科攻14124004-1-24)
【分類號】：R737.31
【正文快照】： 多藥耐藥形成相關(guān)。結(jié)論卵巢癌多藥耐藥機制的形成可能涉及到多種不同的通路和基因,其中ACO1、BDNF、CXCR4、HMGCR、NRP1、CDKN2C、FAS和SKP2等基因可能在其中發(fā)揮著關(guān)鍵作用,后續(xù)研究將對其進行實驗和臨床雙重驗證。0引言化療是卵巢癌重要的治療手段。盡管卵巢癌患者對化療的

【相似文獻】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 譚從娥;王米渠;馮文哲;徐全壹;;生物信息學(xué)分析寒證海量數(shù)據(jù)的探索[J];中華中醫(yī)藥學(xué)刊;2008年12期

2 程勇前;成軍;劉妍;王琳;徐東平;鐘彥偉;曲建慧;趙平;;鈣離子調(diào)節(jié)親環(huán)素配體及其不同剪接體的克隆及生物信息學(xué)分析[J];醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報;2008年05期

3 楊向東,王仁,劉俊文,唐蔚青,李紅霞,王抒;一個新的人突觸相關(guān)蛋白基因的生物信息學(xué)分析[J];中國動脈硬化雜志;2004年01期

4 張艷宇,馬平,陸一鳴,呂麗萍,姜升陽,周錫鵬,孫樹漢,許金波;尖吻蝮蛇類凝血酶基因的克隆及生物信息學(xué)分析[J];中國實驗血液學(xué)雜志;2005年04期

5 張孝勇;崔光彬;杜滂;馬克軍;王亞蓉;韓葦;顏真;張英起;魏經(jīng)國;;兔大電導(dǎo)鈣敏感性鉀離子通道β亞基的克隆及生物信息學(xué)分析[J];第四軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報;2007年09期

6 蔡群芳;鄔強;閆玉蘭;呂剛;;歐猥迭宮絳蟲谷胱甘肽轉(zhuǎn)移酶1基因序列與功能的生物信息學(xué)分析[J];海南醫(yī)學(xué)院學(xué)報;2013年05期

7 魏鎖成;鞏轉(zhuǎn)娣;韋敏;;雄兔垂體GnRHR的序列測定與生物信息學(xué)分析[J];中國實驗動物學(xué)報;2011年01期

8 尹積榮;楊凱;白玉興;王邦康;;牙齒發(fā)育相關(guān)基因Osr2的生物信息學(xué)分析[J];現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進展;2011年14期

9 周金華;朱濤;李紅雨;徐鋼;王世宣;周劍鋒;盧運萍;馬丁;;基于WEB頁面的生物信息學(xué)分析平臺的構(gòu)建及其應(yīng)用[J];中國現(xiàn)代醫(yī)學(xué)雜志;2006年17期

10 佘高明;聶Pr;張同園;李聰;劉煒;阮緒芝;;新基因FAM92A1的生物信息學(xué)分析及功能預(yù)測[J];鄖陽醫(yī)學(xué)院學(xué)報;2008年04期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 焦斐;閻萍;梁春年;郭憲;包鵬甲;裴杰;丁學(xué)智;褚敏;吳曉云;劉建;;牛FAS基因的生物信息學(xué)分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會養(yǎng)牛學(xué)分會2011年學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2011年

2 唐愛發(fā);余振東;桂耀庭;郭新;李賢新;周錦堂;朱輝;蔡志明;;SPACA4基因在人和小鼠的表達及其生物信息學(xué)分析[A];遺傳學(xué)進步與人口健康高峰論壇論文集[C];2007年

3 劉惠君;譚宇蓉;劉持;向陽;屈飛;秦曉群;;BRS-3相互作用新基因的生物信息學(xué)分析及功能研究[A];湖南省生理科學(xué)會2008年度學(xué)術(shù)年會論文摘要匯編[C];2008年

4 黃浩;陸啟軒;陳臨溪;楊莉;毛小環(huán);李蘭芳;秦旭平;曹建剛;;APJ受體的生物信息學(xué)分析[A];全國第十二屆生化與分子藥理學(xué)學(xué)術(shù)會議論文集[C];2011年

5 陳大清;吳功慶;李亞男;;淹水脅迫下薏苡根系adh基因的克隆及其生物信息學(xué)分析[A];2005'海峽兩岸植物生理與分子生物學(xué)教學(xué)研討會論文集[C];2005年

6 田琪琳;施定基;賈曉會;王曉燕;黃希文;何培民;;真核藻PEPC的生物信息學(xué)分析[A];中國藻類學(xué)會第八次會員代表大會暨第十六次學(xué)術(shù)討論會論文摘要集[C];2011年

7 陳玲;朱玲玲;史春梅;季晨博;郭錫熔;;miR-146b靶基因預(yù)測和生物信息學(xué)分析[A];2012年江浙滬兒科學(xué)術(shù)年會暨浙江省醫(yī)學(xué)會兒科學(xué)分會學(xué)術(shù)年會、兒內(nèi)科疾病診治新進展國家級學(xué)習(xí)班論文匯編[C];2012年

8 苑贊;趙錦;劉孟軍;;棗花粉過敏原Zizj1基因的克隆與生物信息學(xué)分析[A];第八屆全國干果生產(chǎn)、科研進展學(xué)術(shù)研討會論文集[C];2013年

9 王玲;高蓮;李健;賴松家;;牛FoxO3基因的cDNA克隆及生物信息學(xué)分析[A];第五屆中國畜牧科技論壇論文集[C];2011年

10 李婷;張英杰;劉月琴;李雪梅;李蘭會;;反芻動物INHA基因編碼區(qū)生物信息學(xué)分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會養(yǎng)羊?qū)W分會2014年全國養(yǎng)羊生產(chǎn)與學(xué)術(shù)研討會議論文集[C];2014年

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前5條

1 陳蕾;原始蛋白酶結(jié)構(gòu)功能的生物信息學(xué)分析及化學(xué)基礎(chǔ)[D];山東師范大學(xué);2009年

2 蘇志熙;幾種哺乳動物表達序列標簽（EST）生物信息學(xué)分析[D];浙江大學(xué);2006年

3 趙佳媛;靈長類二氧化碳感知通路相關(guān)基因的進化及生物信息學(xué)分析[D];復(fù)旦大學(xué);2010年

4 張曉娜;枳（Poncirus trifoliata）低溫相關(guān)microRNAs鑒定及ptf-miR396b抗寒功能研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

5 馬永平;含質(zhì)粒人兩歧雙歧桿菌的分離、質(zhì)粒測序和生物信息學(xué)分析[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2005年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 楊蓓;豬TTV1-ORF1和TTV2-ORF1基因的克隆、表達及生物信息學(xué)分析[D];石河子大學(xué);2015年

2 孫萃萍;多房棘球絳蟲HSP20蛋白的生物信息學(xué)分析、重組表達及泡球蚴的體外培養(yǎng)[D];蘭州大學(xué);2015年

3 郭磊磊;基于整合組學(xué)數(shù)據(jù)的胃癌生物信息學(xué)分析[D];鄭州大學(xué);2015年

4 張?zhí)旌?果蠅miRNA-92a進化保守性及其靶基因功能的生物信息學(xué)分析[D];南京師范大學(xué);2015年

5 張璐;蘋果CAX基因家族生物信息學(xué)分析及sMdCAX1基因遺傳轉(zhuǎn)化的研究[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

6 蔣圓圓;梭梭4個14-3-3蛋白基因的克隆及分析[D];新疆農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

7 楊朗;煙草碳酸酐酶基因的克隆及其生物信息學(xué)分析[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2015年

8 曹峰;小鼠胚胎干細胞核心轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的生物信息學(xué)分析[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2008年

9 王翊;CEM15基因的生物信息學(xué)分析[D];電子科技大學(xué);2005年

10 王芳;一個家蠅未知功能基因的克隆及其生物信息學(xué)分析[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

，

本文編號：827797