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大豆疫霉PsMPK1沉默突變體的基因表達譜分析

發(fā)布時間:2017-09-10 21:23

  本文關(guān)鍵詞:大豆疫霉PsMPK1沉默突變體的基因表達譜分析


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【摘要】:[目的]促有絲分裂原蛋白激酶(MAPK)是真核生物細胞信號轉(zhuǎn)導途徑中的關(guān)鍵蛋白激酶,對植物病原菌的生長發(fā)育與侵染致病具有重要作用。我們前期發(fā)現(xiàn)1個MAPK基因Ps MPK1參與調(diào)控大豆疫霉的細胞壁完整性、菌絲生長、游動孢子形成,以及對大豆的致病性等生物學性狀。本文旨在進一步探究Ps MPK1如何調(diào)控大豆疫霉的上述性狀。[方法]利用數(shù)字基因表達譜技術(shù)對大豆疫霉Ps MPK1沉默突變體在游動孢子囊階段的基因表達情況進行分析。[結(jié)果]樣品間基因表達水平的整體相關(guān)性分析和實時定量PCR結(jié)果表明:數(shù)據(jù)具有較高的可靠性。與野生型菌株相比,Ps MPK1沉默突變體中分別有1 451個顯著下調(diào)和981個顯著上調(diào)的基因,占所有被檢測基因的23%。與之相比,被檢測的細胞壁相關(guān)基因和分泌蛋白編碼基因中,顯著差異表達的基因比例更高(分別占37%和28%),且大部分基因為下調(diào)表達(分別占87%和78%)。顯著下調(diào)表達的分泌蛋白編碼基因中,37個基因可能與侵染過程相關(guān),主要編碼Rx LR、NLP和CRN等家族的效應分子,CBEL蛋白,富含半胱氨酸蛋白,氧化還原相關(guān)蛋白以及水解酶等。[結(jié)論]首次通過轉(zhuǎn)錄組學方法揭示了特定的功能基因Ps MPK1沉默后大豆疫霉基因組的轉(zhuǎn)錄變化,鑒定了可能與Ps MPK1信號途徑相關(guān)的基因和基因家族,為進一步研究大豆疫霉中MAPK的調(diào)控網(wǎng)絡奠定了基礎。
【作者單位】: 南京農(nóng)業(yè)大學植物保護學院;
【關(guān)鍵詞】大豆疫霉 促有絲分裂原蛋白激酶 細胞壁 致病性 效應分子 轉(zhuǎn)錄
【基金】:中央高;究蒲袠I(yè)務費專項資金項目(KJQN201507) 國家自然科學基金項目(31401688) 江蘇省自然科學基金項目(BK20140698) 國家國際科技合作專項資助(2013DFG32030)
【分類號】:S435.651
【正文快照】: 促有絲分裂原蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)是真核生物細胞信號轉(zhuǎn)導途徑中的關(guān)鍵蛋白激酶,對植物病原菌的生長發(fā)育與侵染過程具有重要作用[1]。我們經(jīng)過前期研究發(fā)現(xiàn),MAPK基因Ps MPK1參與調(diào)控大豆疫霉的細胞壁完整性、菌絲生長、游動孢子形成,以及對大豆的

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