本文關(guān)鍵詞：弧菌科質(zhì)粒pJV的全序列測定、基因預(yù)測及其復(fù)制區(qū)的鑒定

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【摘要】：為了從條件致病菌鰻弧菌中提取到天然質(zhì)粒,獲得該質(zhì)粒的全序列,并得到在弧菌中起復(fù)制作用的區(qū)域,試驗采用向上引物和向下引物共9條,雙向測通該質(zhì)粒,經(jīng)拼接得到質(zhì)粒p JV的全序列,利用Glimmer3基因預(yù)測軟件對該質(zhì)�？赡馨蚰Ｐ瓦M行預(yù)測和基因注釋,通過在線工具OriFinder預(yù)測分析該質(zhì)粒的復(fù)制區(qū)域,并將該區(qū)域克隆到T載體中,驗證重組質(zhì)粒在弧菌科菌種中的復(fù)制效果。結(jié)果表明:該質(zhì)粒p JV全長5 982 bp(Gen Bank登錄號為JQ782192),有4個含有核糖體結(jié)合位點的基因(UQY-2、UQY-3、UQY-4、UQY-6);質(zhì)粒p JV的復(fù)制元件是一段長313 bp的序列(含Dna A boxes)。說明經(jīng)過試驗驗證,該片段使T載體具有在維氏氣單胞菌中復(fù)制的能力,即證明該片段為鰻弧菌質(zhì)粒p JV的復(fù)制區(qū),可用于新弧菌科載體的構(gòu)建和疫苗研制等。
【作者單位】： 北京市水產(chǎn)科學(xué)研究所漁業(yè)生物技術(shù)北京市重點實驗室;上海海洋大學(xué);天津科技大學(xué);
【關(guān)鍵詞】： 鰻弧菌 質(zhì)粒 測序 基因預(yù)測 復(fù)制區(qū)
【基金】：北京市自然科學(xué)基金項目(6152006) 北京市觀賞魚產(chǎn)業(yè)創(chuàng)新團隊項目(BAIC03-2016)
【分類號】：S941.4
【正文快照】： 鰻弧菌(Vibrio anguillarum)是革蘭氏陰性菌,屬于弧菌科(Vibrionaceae veron),曾被分在弧菌屬,但是據(jù)Gen Bank的專家意見和常見細菌系統(tǒng)鑒定手冊[1],現(xiàn)被分類在利斯頓氏屬(Listonella)。該菌廣泛分布于海水和淡水中,是養(yǎng)殖及野生魚類中常見的條件致病菌,可引起多種水產(chǎn)養(yǎng)殖動

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1 何蘋萍;黃玉柳;陳秀荔;彭敏;楊春玲;張彬;陳曉漢;葉欣宇;黃國秋;趙永貞;;南寧市售文蛤中弧菌的分離鑒定[J];南方農(nóng)業(yè)學(xué)報;2013年02期

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1 于德華;青島近岸不同環(huán)境中海洋弧菌的檢測及用PCR方法快速檢測病原鰻弧菌[D];中國海洋大學(xué);2003年

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本文編號：820978