基于hMeDIP-seq分析肝癌小鼠癌組織中肝癌相關(guān)信號(hào)分子基因的羥甲基化
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【摘要】:本研究通過hMeDIP-Seq技術(shù)和生物信息學(xué)分析,從肝細(xì)胞癌模型小鼠肝癌組織和肝組織基因組羥甲基化的角度研究肝癌相關(guān)信號(hào)通路,以期探討肝癌相關(guān)信號(hào)分子基因的羥甲基化分布及其與基因表達(dá)的關(guān)系。研究結(jié)果表明,肝癌組織中共有52個(gè)具有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的肝癌相關(guān)信號(hào)分子基因發(fā)生了羥(FDR0.05),而肝組織的則沒有出現(xiàn)有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義的相關(guān)羥甲基化信號(hào)分子基因。而且,這些信號(hào)分子基因的羥甲基化位點(diǎn)全部分布在基因表達(dá)的調(diào)控區(qū)域(外顯子外),包括啟動(dòng)子-轉(zhuǎn)錄啟始位點(diǎn)區(qū)、內(nèi)含子區(qū)和基因間區(qū)。由于DNA羥甲基化是激活基因表達(dá)的重要手段,因此,這些區(qū)域的羥甲基化表明這些基因在肝癌組織中處于激活狀態(tài),并得到了RT-q PCR實(shí)驗(yàn)的抽樣證明。由此可見,肝癌組織基因組上發(fā)生的羥甲基化與肝癌相關(guān);它們通過激活大量的信號(hào)分子基因引起肝癌相關(guān)信號(hào)通路的異;罨,從而引起肝癌的發(fā)生或遷移。
【作者單位】: 右江民族醫(yī)學(xué)院;廣西大學(xué)動(dòng)物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: hMeDIP-seq 肝癌 信號(hào)分子基因 DNA羥甲基化
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(No.3120365) 廣西自然科學(xué)基金(No.2015GXNSFAA139219) 2013年度廣西高?茖W(xué)技術(shù)研究項(xiàng)目(桂教科研[2013]7號(hào),No.2013YB185) 右江民族醫(yī)學(xué)院博士科研啟動(dòng)基金項(xiàng)目 廣西大學(xué)博士后啟動(dòng)項(xiàng)目(No.XBZ130082) 廣西自治區(qū)級(jí)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目(桂教高教[2016]41號(hào),No.201610599039和No.201610599051;右醫(yī)院字[2012]23號(hào),No.QJCX201321和No.QJCX201334) 右江民族醫(yī)學(xué)院校級(jí)大學(xué)生創(chuàng)新創(chuàng)業(yè)訓(xùn)練計(jì)劃項(xiàng)目(右醫(yī)教字[2014]5號(hào),No.XJCXB201412,No.XJCXB201420和No.XJCXB201423)共同資助
【分類號(hào)】:R735.7
【正文快照】: Analysis of Hydroxylmethylation of Genes Involved in the Pathways inHepatocellular Carcinoma of Mice Based on h Me DIP-seqLi Genliang1*Xu Yijiao1Lu Shuyu1Huang Xiaomin1Nong Song1Jiang Lihe21 Youjiang Medical University for Nationalities,Baise,533000;2 Co
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,本文編號(hào):817010
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