本文關(guān)鍵詞：粗山羊草JAZ基因家族的全基因組鑒定與分析

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【摘要】：為了挖掘可用于小麥茉莉酸調(diào)控通路及其穗部或花器官發(fā)育研究的候選基因,基于已發(fā)布的粗山羊草全基因組數(shù)據(jù),利用生物信息學(xué)分析方法鑒定了粗山羊草JAZ基因家族,并從染色體分布、基因及蛋白結(jié)構(gòu)、啟動(dòng)子順式作用元件、系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系和基因表達(dá)模式等方面對(duì)該基因家族的特征進(jìn)行了比較分析。結(jié)果表明,本研究共鑒定到9個(gè)粗山羊JAZ基因,命名為AetJAZ1-AetJAZ9。染色體定位結(jié)果顯示,9個(gè)粗山羊草JAZ基因分別定位在2D、5D、6D和7D染色體上,其中在7D染色體上分布最多。進(jìn)化分析表明,粗山羊草JAZ蛋白與短柄草JAZ蛋白親緣關(guān)系最近,且9個(gè)粗山羊草JAZ蛋白被分別聚類到了S5、S12、S13、S16和S20五個(gè)亞族中,其中S20亞族有五個(gè)粗山羊草JAZ蛋白。啟動(dòng)子分析表明,9個(gè)粗山羊草JAZ基因啟動(dòng)子順式作用元件種類和數(shù)量存在差異,推測(cè)其各自的功能也存在差異。表達(dá)譜分析表明,粗山羊草JAZ基因在粗山羊草不同組織間存在不同的表達(dá)特性,且不存在組成型表達(dá)基因,其中,AetJAZ1和AetJAZ2表現(xiàn)出明顯的組織特異性,分別只在穗部、雌蕊和雄蕊中特異表達(dá)。
【作者單位】： 北京市農(nóng)林科學(xué)院雜交小麥工程技術(shù)研究中心;雜交小麥分子遺傳北京市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;首都師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;北京農(nóng)學(xué)院植物科學(xué)技術(shù)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 粗山羊草 JAZ 轉(zhuǎn)錄抑制因子 基因家族 花器官
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31171172) 國(guó)家高技術(shù)研究與發(fā)展計(jì)劃(863計(jì)劃)項(xiàng)目(2011AA10A106) 北京市科技計(jì)劃項(xiàng)目(Z141100002314018) 北京市農(nóng)林科學(xué)院科技創(chuàng)新能力建設(shè)專項(xiàng)(KJCX20140405;KJCX20140106) 北京市自然科學(xué)基金項(xiàng)目(5131001) 國(guó)家科技支撐計(jì)劃項(xiàng)目(2013BAD04B01;2014BAD01B09) 北京市農(nóng)林科學(xué)院國(guó)際合作項(xiàng)目(GJHZ2014-7;GJHZ2015-5)
【分類號(hào)】：S512.1
【正文快照】： JAZ(Jasmonate-ZIM-domain)基因編碼SCFCOI1受體復(fù)合物的靶蛋白,是植物中特有的基因,僅見于苔蘚植物、裸子植物和被子植物[1]。JAZ基因家族編碼蛋白屬于TIFY轉(zhuǎn)錄因子超家族,是植物中特有的一類轉(zhuǎn)錄因子,含有TIFY(又稱ZIM)和Jas(又稱CCT_2)功能結(jié)構(gòu)域[2-3]。TIFY功能結(jié)構(gòu)域位于

【共引文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前4條

1 何鑫;吳紹華;鄧順楠;陳月異;田維敏;;橡膠樹HbJAZ3突變體蛋白的原核表達(dá)及純化[J];熱帶作物學(xué)報(bào);2013年10期

2 莫忠蓁;黃章科;周玉萍;黃小玲;田長(zhǎng)恩;;擬南芥IQM1涉及主根生長(zhǎng)對(duì)茉莉酸甲酯的反應(yīng)[J];生物技術(shù)通訊;2015年03期

3 段龍飛;慕小倩;李文燕;;茉莉酸信號(hào)途徑中轉(zhuǎn)錄抑制因子JAZ蛋白家族的分子進(jìn)化分析[J];植物學(xué)報(bào);2013年06期

4 敖濤;廖曉佳;徐偉;劉愛忠;;蓖麻GATA基因家族的鑒定和特征分析[J];植物分類與資源學(xué)報(bào);2015年04期

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條

1 于娟;擬南芥JAZ7基因參與黑暗誘導(dǎo)葉片衰老的分子機(jī)制研究以及玉米轉(zhuǎn)錄組學(xué)數(shù)據(jù)整合分析平臺(tái)的初步構(gòu)建[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

2 白有煌;植物中編碼基因TIFY家族和非編碼基因IncRNA的生物信息學(xué)研究[D];浙江大學(xué);2014年

3 李生平;水稻生長(zhǎng)發(fā)育多效基因DDF1與鋅指基因ZOS11-11的功能與表達(dá)分析[D];福建農(nóng)林大學(xué);2011年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前7條

1 段龍飛;茉莉酸信號(hào)途徑上關(guān)鍵基因家族COI/JAZ/MYC分子進(jìn)化分析[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2013年

2 何鑫;巴西橡膠樹JAZ和MYC家族幾個(gè)成員基因表達(dá)和產(chǎn)量相關(guān)性的研究[D];海南大學(xué);2013年

3 孫程;玉米TIFY家族ZmJAZ14基因的功能驗(yàn)證[D];中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2013年

4 周明;玉米TIFY/JAZ蛋白全基因組分析[D];四川農(nóng)業(yè)大學(xué);2013年

5 李肖琴;蘋果醛脫氫酶（ALDH）和TIFY基因家族的鑒定、系統(tǒng)進(jìn)化及表達(dá)分析[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2014年

6 李智奕;國(guó)內(nèi)不同煙草品種的煙葉轉(zhuǎn)錄組分析[D];河南農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

7 高佳佳;巴西橡膠樹幾個(gè)與橡膠合成相關(guān)基因的物理定位研究[D];海南大學(xué);2014年

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 ;艾美加推出新型外觀設(shè)計(jì)的JAZ（r）2GB外接驅(qū)動(dòng)器[N];大眾科技報(bào);2000年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 晉鑫鑫;SmJAZ3基因的克隆及JAZ調(diào)控丹參次生代謝的功能研究[D];陜西師范大學(xué);2015年

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本文編號(hào)：812055