鵝掌楸DHHC型鋅指蛋白家族基因的克隆及表達(dá)分析
發(fā)布時(shí)間:2017-09-07 01:27
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【摘要】:棕櫚;揎検且环N最普遍且唯一可逆的翻譯后脂質(zhì)修飾方式,賦予蛋白質(zhì)多樣化的生理功能。DHHC(Asp-His-His-Cys)蛋白家族是一類與棕櫚酰化修飾相關(guān)的蛋白,多數(shù)DHHC蛋白家族成員具有蛋白質(zhì);D(zhuǎn)移酶(protein S-acyltransferase,PAT)活性。該研究以鵝掌楸葉芽為材料,采用RT-PCR和RACE技術(shù),克隆獲得了3個(gè)鵝掌楸DHHC蛋白家族基因c DNA全長(zhǎng),命名為L(zhǎng)c PAT7、Lc PAT22、Lc PAT23。序列分析結(jié)果表明:Lc PAT7、Lc PAT22、Lc PAT23基因全長(zhǎng)分別為1 933、2 592、2 217 bp,各包含1 332、1 839、1 662 bp的開放閱讀框(Open Reading Frame,ORF),編碼433、612、533個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)蛋白分子量分別為40.04、67.3、60.57 k Da,理論等電點(diǎn)為9.15、9.03、7.29。3個(gè)基因編碼的蛋白均有4個(gè)跨膜區(qū),并且都在跨膜域(transmembrane domain,TM)TM2和TM3之間存在一個(gè)DHHC蛋白家族典型的DHHC-CRD結(jié)構(gòu)域。同源性分析表明:鵝掌楸Lc PAT7、Lc PAT22、Lc PAT23編碼的氨基酸序列與其他植物中預(yù)測(cè)的PAT具有較高的相似性。利用熒光定量PCR技術(shù)檢測(cè)3個(gè)基因在鵝掌楸不同組織中的表達(dá)特性,發(fā)現(xiàn)3個(gè)基因在不同組織中均有表達(dá),但表達(dá)量具有明顯區(qū)別。同一家族基因表達(dá)模式的變化表明其功能非冗余。該研究結(jié)果將為鵝掌楸生長(zhǎng)發(fā)育與形態(tài)建成,以及逆境響應(yīng)信號(hào)傳導(dǎo)等相關(guān)基因的調(diào)控研究提供了參考。
【作者單位】: 南京林業(yè)大學(xué)林木遺傳與生物技術(shù)省部共建教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】: 鵝掌楸 棕櫚;揎 蛋白質(zhì);D(zhuǎn)移酶 DHHC蛋白家族 表達(dá)分析
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金(31470660,31170621) 江蘇省高校優(yōu)勢(shì)學(xué)科~~
【分類號(hào)】:Q943.2;S792.21
【正文快照】: 67.3 and 60.57 k Da,respectively.The predicted isoelectric points are 9.15,9.03 and 7.29,respectively.All the threeproteins contained four putative transmembrane(TM)domain structures,and contained a typically DHHC-CRD domainbetween TM2 and TM3 as most kn
【相似文獻(xiàn)】
中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 向靜;擬南芥DHHC型鋅指蛋白基因At5g04270分離鑒定與功能生化分析[D];湖南大學(xué);2011年
,本文編號(hào):806613
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