本文關(guān)鍵詞：水稻泛素結(jié)合酶基因家族的生物信息學與表達分析

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【摘要】：泛素/蛋白酶體系統(tǒng)在植物的生長發(fā)育、形態(tài)建成和抗病反應(yīng)等過程中起著重要的作用。近年的研究表明,某些病原菌能夠模擬寄主植物泛素/蛋白酶體系統(tǒng)組分,從而達到利用該系統(tǒng)為病原菌服務(wù)的目的。泛素結(jié)合酶是泛素化反應(yīng)過程中的第二個酶,對植物泛素/蛋白酶體系統(tǒng)的正常運行不可或缺。已有的研究表明,水稻基因組數(shù)據(jù)庫中存在48個預(yù)測的泛素結(jié)合酶基因。為了初步揭示這些泛素結(jié)合酶基因在植物抗病防御反應(yīng)中的功能,研究其與植物抗病性的關(guān)系。本研究通過生物信息學、RNA-seq和qRT-PCR的方法,分析了水稻泛素結(jié)合酶基因家族的特征及其表達模式。系統(tǒng)進化樹分析表明,48個水稻泛素結(jié)合酶基因可分為3個大組,總共7個亞組。蛋白結(jié)構(gòu)域分析表明,水稻泛素結(jié)合酶基因主要由一個泛素結(jié)合酶催化結(jié)構(gòu)域組成。電子表達譜分析表明,大多數(shù)水稻泛素結(jié)合酶基因能被稻瘟病菌誘導(dǎo)表達。啟動子區(qū)順式作用元件分析表明,4個抗病相關(guān)順式作用元件和1個過敏性反應(yīng)相關(guān)順式作用元件在48個水稻泛素結(jié)合酶基因的啟動子區(qū)有很高的分布。稻瘟病菌接種親和性和非親和性水稻單基因系的RNA-seq結(jié)果表明,處理36h讀取到的水稻泛素結(jié)合酶基因為44個,其中高表達基因數(shù)量超過讀取到的泛素結(jié)合酶基因總數(shù)的50%。qRT-PCR分析結(jié)果表明稻瘟病菌的侵染在親和和非親和組合中都能誘導(dǎo)部分水稻泛素結(jié)合酶基因的表達。在非親和組合中水稻泛素結(jié)合酶基因的表達傾向于受到抑制。
【作者單位】： 福建農(nóng)林大學功能基因組學研究中心;
【關(guān)鍵詞】： 水稻 泛素結(jié)合酶 泛素/蛋白酶體系統(tǒng) 生物信息學 稻瘟病菌 RNA-seq qRT-PCR
【基金】：國家科技支撐計劃資助項目(2013BAD19B03)
【分類號】：S511
【正文快照】： 植物泛素/蛋白酶體系統(tǒng)是細胞內(nèi)蛋白質(zhì)降解基因、花生AhUBC2基因或大豆GmUBC2基因能的主要途徑,在植物的生長發(fā)育、形態(tài)建成和抗病反增強植株的抗旱性[18-20]。在擬南芥中異位表達野生應(yīng)等過程中起著重要的作用[1]。近年的研究又表稻OgUBC基因增強了植株對灰葡萄孢及紫外線明,

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本文編號：788130