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基于cDNA-SCoT差異顯示的甘蔗應(yīng)答水分脅迫基因表達(dá)譜分析(英文)

發(fā)布時(shí)間:2017-09-02 01:43

  本文關(guān)鍵詞:基于cDNA-SCoT差異顯示的甘蔗應(yīng)答水分脅迫基因表達(dá)譜分析(英文)


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【摘要】:【目的】研究甘蔗應(yīng)答水分脅迫差異基因表達(dá),進(jìn)一步探究甘蔗應(yīng)答水分脅迫的分子機(jī)制,為開(kāi)展甘蔗抗旱綜合性遺傳改良研究提供科學(xué)依據(jù)!痉椒ā窟x用GT11為材料,分別構(gòu)建對(duì)照、干旱、復(fù)水3個(gè)處理總RNA混合池,使用cDNA-SCoT差異顯示構(gòu)建GT11伸長(zhǎng)期應(yīng)答水分脅迫的基因表達(dá)譜,篩選、分離TDFs進(jìn)行測(cè)序,在NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行BLAST同源性檢索,根據(jù)同源基因推測(cè)基因功能!窘Y(jié)果】通過(guò)42條SCoT引物篩選得到180個(gè)TDFs,有100個(gè)TDFs與NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)中已錄入的基因具有較高的相似性,根據(jù)同源基因功能可分為14類:新陳代謝相關(guān)基因(11個(gè))、能量代謝相關(guān)基因(12個(gè))、運(yùn)輸途徑相關(guān)基因(5個(gè))、通信及信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)相關(guān)基因(6個(gè))、細(xì)胞循環(huán)及DNA加工相關(guān)基因(3個(gè))、轉(zhuǎn)錄調(diào)控因子相關(guān)基因(3個(gè))、蛋白質(zhì)合成相關(guān)基因(17個(gè))、蛋白質(zhì)加工相關(guān)基因(1個(gè))、結(jié)合功能蛋白相關(guān)基因(7個(gè))、環(huán)境互作相關(guān)基因(3個(gè))、轉(zhuǎn)座子、毒性及質(zhì)粒蛋白相關(guān)基因(5個(gè))、細(xì)胞成分生物合成相關(guān)基因(1個(gè))、防御相關(guān)基因(4個(gè))和未知功能蛋白基因(22個(gè))!窘Y(jié)論】甘蔗應(yīng)答水分脅迫調(diào)節(jié)途徑具有多樣性、復(fù)雜性、協(xié)調(diào)性和網(wǎng)絡(luò)性;應(yīng)用cDNA-SCoT差異顯示篩選獲得水分脅迫相關(guān)TDFs,可為進(jìn)一步研究甘蔗應(yīng)答水分調(diào)控途徑的分子機(jī)理提供重要信息。
【作者單位】: 廣西農(nóng)業(yè)科學(xué)院甘蔗研究所/農(nóng)業(yè)部廣西甘蔗生物技術(shù)與遺傳改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室/廣西甘蔗遺傳改良重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;廣西作物遺傳改良生物技術(shù)重點(diǎn)開(kāi)放實(shí)驗(yàn)室;廣西大學(xué)/廣西亞熱帶生物資源保護(hù)和利用重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】甘蔗 cDNA-SCoT 水分脅迫 復(fù)水 基因表達(dá)譜
【基金】:National Natural Science Foundation of China(31400281) Guangxi Natural Science Foundation(2014GXNSFAA118128) Basic Special Fund of Guangxi Academy of Agricultural Sciences(2015JZ11,2015JM24)
【分類號(hào)】:S566.1
【正文快照】: 0Introduction 【Research significance】0ver 80/0of sugarcane in China are planted in dry sloping fields without iirigating conditions,and yearly seasonal drought has become the main constraint factor on sugarcane production and sugar industry safety i

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

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3 記者 張曄 通訊員 周偉;我學(xué)者發(fā)現(xiàn)多基因表達(dá)譜[N];科技日?qǐng)?bào);2014年

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中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

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中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

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本文編號(hào):775672

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