本文關(guān)鍵詞：融合生物網(wǎng)絡(luò)拓?fù)涮匦缘哪[瘤放療敏感基因信號(hào)識(shí)別方法

  更多相關(guān)文章： 輻射敏感性 組學(xué)數(shù)據(jù) 生物網(wǎng)絡(luò) 輻射敏感基因

【摘要】：腫瘤病人的輻射敏感性預(yù)測(cè)對(duì)于腫瘤的治愈具有重要意義.基于上述原因,文中提出融合生物網(wǎng)絡(luò)拓?fù)涮匦缘哪[瘤放療敏感基因信號(hào)識(shí)別方法.首先基于基因表達(dá)譜和腫瘤樣本SF2存活率之間的Spearman相關(guān)系數(shù),初步估算每個(gè)基因的輻射敏感度.然后根據(jù)目前已知的基因網(wǎng)絡(luò)和蛋白質(zhì)互作網(wǎng)絡(luò)等生物網(wǎng)絡(luò)的拓?fù)湫再|(zhì),利用隨機(jī)行走算法進(jìn)行校正.最后篩選輻射敏感基因,并以此為特征訓(xùn)練腫瘤樣本SVM分類器.實(shí)驗(yàn)表明文中方法比現(xiàn)有常用的線性回歸法和微陣列數(shù)據(jù)顯著性分析法更加有效,識(shí)別的輻射敏感基因有利于臨床腫瘤個(gè)性化放療的施行.
【作者單位】： 中國科學(xué)院合肥智能機(jī)械研究所生物分子信息系統(tǒng)實(shí)驗(yàn)室;武漢大學(xué)測(cè)繪遙感信息工程國家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;安徽建筑大學(xué)數(shù)理學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 輻射敏感性 組學(xué)數(shù)據(jù) 生物網(wǎng)絡(luò) 輻射敏感基因
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.61402010,61374181) 安徽省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(No.1408085MF133)資助~~
【分類號(hào)】：R730.55
【正文快照】： SHI Ming1,2,WANG Hongqiang2,SUN Tingting2,XIE Xinping31(Machine IntelligenceComputational Biology Laboratory,Institute of Intelligent Machines,Chinese Academy of Sciences,Hefei 230031)2(State Key Laboratory of Information Engineering in Surveying,Mappin

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本文編號(hào)：770057