本文關(guān)鍵詞：鼠傷寒沙門菌嬰幼兒分離株耐藥基因及毒力基因研究

  更多相關(guān)文章： 腹瀉 嬰幼兒 鼠傷寒沙門菌 耐藥基因 毒力基因 全基因組測(cè)序 食源性致病菌

【摘要】：目的基于全基因組測(cè)序結(jié)果,分析鼠傷寒沙門菌耐藥表型和耐藥基因的關(guān)系,研究其耐藥發(fā)生機(jī)制和毒力因子。方法利用美國(guó)臨床和實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)委員會(huì)(CLSI)推薦的微量肉湯稀釋法對(duì)5歲以下腹瀉患兒糞便中分離的321株鼠傷寒沙門菌開展藥物敏感性試驗(yàn),從中選擇不同耐藥表型的3株鼠傷寒沙門菌(S1:敏感;S2:TET耐藥;S3:ESBLs陽(yáng)性,10重耐藥)進(jìn)行全基因組測(cè)序,通過與抗生素抗性基因數(shù)據(jù)庫(kù)(ARDB)和病原毒力因子數(shù)據(jù)庫(kù)(VFDB)比對(duì)以及美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心(NCBI)核酸數(shù)據(jù)庫(kù)人工檢索,對(duì)耐藥基因和毒力基因進(jìn)行注釋。結(jié)果 321株鼠傷寒沙門菌對(duì)IPM和MEM均敏感,對(duì)TET和AMP的耐藥率最高,分別為84.4%(271/321)和83.8%(269/321),206株菌株顯示為耐3類以上抗生素(64.2%,206/321),11株CIP-CTX耐藥株均為ESBLs陽(yáng)性(3.4%,11/321);全基因組測(cè)序結(jié)果顯示,S1、S2和S3的全基因組大小依次為4 876 427、4 970 690、5 133 380 bp,預(yù)測(cè)編碼基因數(shù)分別為4 825、4 936和5 082個(gè),GC含量依次為52.18%、52.14%、51.87%;對(duì)S1、S2和S3基因組中18、20和32個(gè)耐藥基因進(jìn)行注釋,除共有基因外,S2主要攜帶tet A和sul2基因,S3主要攜帶sul1/2/3、tetB、AAC(3)-IV、AAC(6')-I、ANT(2″)-I、ANT(3″)-I、aph A1、bla_(CTX-M-14)、bla_(OXA-1)、catB3、cml_e1和cml_e3基因。與陽(yáng)性鼠傷寒沙門菌株LT2的gyr A基因進(jìn)行序列比對(duì)發(fā)現(xiàn),S3 gyr A基因第87位密碼子由GAC突變?yōu)锳AC(Asp87→Asn);分別注釋S1、S2和S3基因組的130、129和120個(gè)毒力基因,發(fā)現(xiàn)主要以三型分泌系統(tǒng)和粘附因子為主。結(jié)論 5歲以下腹瀉患兒糞便樣品中鼠傷寒沙門菌耐藥現(xiàn)象嚴(yán)重;全基因組測(cè)序分析發(fā)現(xiàn)耐藥基因與耐藥表型一致,且存在多種毒力因子;為后續(xù)開展耐藥基因傳播機(jī)制和菌株致病性研究,評(píng)估其對(duì)人群的健康風(fēng)險(xiǎn),防控鼠傷寒沙門菌感染提供技術(shù)支持。
【作者單位】： 國(guó)家食品安全風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估中心衛(wèi)生部食品安全風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;上海市疾病預(yù)防控制中心;
【關(guān)鍵詞】： 腹瀉 嬰幼兒 鼠傷寒沙門菌 耐藥基因 毒力基因 全基因組測(cè)序 食源性致病菌
【基金】：北京市自然基金項(xiàng)目(5141002) 2016高層次人才隊(duì)伍建設(shè)項(xiàng)目(2016人才-3-14)
【分類號(hào)】：R446.5;R440
【正文快照】： 鼠傷寒沙門菌(Salmonella typhimurium)屬于非傷寒沙門菌屬,Kauffmann-White-Le Minor Scheme已公布的2 610余種沙門菌血清型中[1-2],鼠傷寒沙門菌是最常見的腸道沙門菌血清型之一,其導(dǎo)致的食源性疾病已成為全球重要公共衛(wèi)生問題[3]。1988—2000年國(guó)際上發(fā)生的4 093起微生物食

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 何毓琮,陳申義;嬰幼兒鼠傷寒沙門菌感染——附40例臨床分析[J];重慶醫(yī)藥;1992年01期

2 曹友文;杭桂香;;鼠傷寒沙門菌感染95例臨床分析[J];南京醫(yī)學(xué)院學(xué)報(bào);1993年03期

3 徐艷云,毛海洲;醫(yī)院內(nèi)兒童鼠傷寒沙門菌感染14例分析[J];人民軍醫(yī);1996年09期

4 程茜,劉作義;雙歧桿菌對(duì)鼠傷寒沙門菌感染小鼠治療作用的觀察[J];中華傳染病雜志;2000年04期

5 李金柱,劉磊,常建平;鼠傷寒沙門菌感染30例臨床分析[J];中國(guó)綜合臨床;2000年10期

6 李波 ,馮慕仁;鼠傷寒沙門菌感染121例臨床分析[J];中國(guó)煤炭工業(yè)醫(yī)學(xué)雜志;2002年07期

7 余吉仙,岑立沖;小兒鼠傷寒沙門菌感染26例分析[J];浙江預(yù)防醫(yī)學(xué);2003年07期

8 張磊;羅穎;李勇;;市售鴨肉中檢出一株鼠傷寒沙門菌[J];中國(guó)衛(wèi)生檢驗(yàn)雜志;2007年10期

9 劉永生;;小兒鼠傷寒沙門菌感染40例臨床分析[J];中國(guó)中西醫(yī)結(jié)合兒科學(xué);2010年01期

10 何聰;;鼠傷寒沙門菌感染24例臨床分析[J];內(nèi)蒙古中醫(yī)藥;2010年21期

中國(guó)重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前3條

1 潘若男;魏旭蘭;羅明;何曉清;侯惠珍;周剛;謝一俊;;我國(guó)部分省市區(qū)鼠傷寒沙門菌的質(zhì)粒譜分型及其分布[A];面向21世紀(jì)的科技進(jìn)步與社會(huì)經(jīng)濟(jì)發(fā)展（下冊(cè)）[C];1999年

2 駱艷婷;梁景濤;陳愛貞;廖華樂;何秀榕;;鼠傷寒沙門菌分子分型與多重耐藥研究及應(yīng)用探討[A];新發(fā)傳染病防治熱點(diǎn)研討會(huì)論文集[C];2014年

3 蘭和魁;陳麗珊;任大明;;減毒鼠傷寒沙門菌介導(dǎo)的Epo在鼠體內(nèi)長(zhǎng)期表達(dá)的實(shí)驗(yàn)研究[A];中華醫(yī)學(xué)會(huì)第十四次全國(guó)兒科學(xué)術(shù)會(huì)議論文匯編[C];2006年

中國(guó)博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前1條

1 胡桂秋;AIM2在鼠傷寒沙門菌感染中的作用及機(jī)制研究[D];吉林大學(xué);2016年

中國(guó)碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

1 孫亮亮;鼠傷寒沙門菌L型的體外膽汁誘導(dǎo)及豬膽囊鼠傷寒沙門菌L型的檢測(cè)研究[D];貴陽(yáng)醫(yī)學(xué)院;2015年

2 任潔;鼠傷寒沙門菌pat/cobB缺失株的構(gòu)建及其應(yīng)對(duì)酸壓力的研究[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

3 何云;基于核酸適體和金納米粒子信號(hào)放大策略的電化學(xué)傳感器對(duì)鼠傷寒沙門菌的快速檢測(cè)[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2015年

4 李文華;豬肉中一株鼠傷寒沙門菌的分離鑒定及其生物學(xué)特性分析[D];揚(yáng)州大學(xué);2015年

5 雷倩倩;RCAN1抑制鼠傷寒沙門菌腸道感染引起的宿主炎性反應(yīng)[D];吉林大學(xué);2016年

6 黃燕惠;廣東省鼠傷寒沙門菌的分子流行病學(xué)研究[D];南方醫(yī)科大學(xué);2014年

7 陳晶;社區(qū)獲得性腹瀉病原菌耐藥性及鼠傷寒沙門菌對(duì)喹諾酮類藥物耐藥機(jī)制的研究[D];華中科技大學(xué);2006年

8 李廣波;巨噬細(xì)胞過氧化物酶體與鼠傷寒沙門菌相互作用的初步分析[D];第二軍醫(yī)大學(xué);2011年

9 葛闖;一、流動(dòng)注射化學(xué)發(fā)光法快速測(cè)定血漿鹽酸阿霉素 二、電化學(xué)傳感器對(duì)鼠傷寒沙門菌的高靈敏性檢測(cè)[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2014年

10 吳春雪;鼠傷寒沙門菌spvB、spvC基因缺陷變異株的構(gòu)建及其生物學(xué)特性研究[D];南昌大學(xué);2014年

，

本文編號(hào)：768442