本文關(guān)鍵詞：鼠傷寒沙門(mén)菌嬰幼兒分離株耐藥基因及毒力基因研究

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【摘要】：目的基于全基因組測(cè)序結(jié)果,分析鼠傷寒沙門(mén)菌耐藥表型和耐藥基因的關(guān)系,研究其耐藥發(fā)生機(jī)制和毒力因子。方法利用美國(guó)臨床和實(shí)驗(yàn)室標(biāo)準(zhǔn)委員會(huì)(CLSI)推薦的微量肉湯稀釋法對(duì)5歲以下腹瀉患兒糞便中分離的321株鼠傷寒沙門(mén)菌開(kāi)展藥物敏感性試驗(yàn),從中選擇不同耐藥表型的3株鼠傷寒沙門(mén)菌(S1:敏感;S2:TET耐藥;S3:ESBLs陽(yáng)性,10重耐藥)進(jìn)行全基因組測(cè)序,通過(guò)與抗生素抗性基因數(shù)據(jù)庫(kù)(ARDB)和病原毒力因子數(shù)據(jù)庫(kù)(VFDB)比對(duì)以及美國(guó)國(guó)立生物技術(shù)信息中心(NCBI)核酸數(shù)據(jù)庫(kù)人工檢索,對(duì)耐藥基因和毒力基因進(jìn)行注釋。結(jié)果 321株鼠傷寒沙門(mén)菌對(duì)IPM和MEM均敏感,對(duì)TET和AMP的耐藥率最高,分別為84.4%(271/321)和83.8%(269/321),206株菌株顯示為耐3類(lèi)以上抗生素(64.2%,206/321),11株CIP-CTX耐藥株均為ESBLs陽(yáng)性(3.4%,11/321);全基因組測(cè)序結(jié)果顯示,S1、S2和S3的全基因組大小依次為4 876 427、4 970 690、5 133 380 bp,預(yù)測(cè)編碼基因數(shù)分別為4 825、4 936和5 082個(gè),GC含量依次為52.18%、52.14%、51.87%;對(duì)S1、S2和S3基因組中18、20和32個(gè)耐藥基因進(jìn)行注釋,除共有基因外,S2主要攜帶tet A和sul2基因,S3主要攜帶sul1/2/3、tetB、AAC(3)-IV、AAC(6')-I、ANT(2″)-I、ANT(3″)-I、aph A1、bla_(CTX-M-14)、bla_(OXA-1)、catB3、cml_e1和cml_e3基因。與陽(yáng)性鼠傷寒沙門(mén)菌株LT2的gyr A基因進(jìn)行序列比對(duì)發(fā)現(xiàn),S3 gyr A基因第87位密碼子由GAC突變?yōu)锳AC(Asp87→Asn);分別注釋S1、S2和S3基因組的130、129和120個(gè)毒力基因,發(fā)現(xiàn)主要以三型分泌系統(tǒng)和粘附因子為主。結(jié)論 5歲以下腹瀉患兒糞便樣品中鼠傷寒沙門(mén)菌耐藥現(xiàn)象嚴(yán)重;全基因組測(cè)序分析發(fā)現(xiàn)耐藥基因與耐藥表型一致,且存在多種毒力因子;為后續(xù)開(kāi)展耐藥基因傳播機(jī)制和菌株致病性研究,評(píng)估其對(duì)人群的健康風(fēng)險(xiǎn),防控鼠傷寒沙門(mén)菌感染提供技術(shù)支持。
【作者單位】： 國(guó)家食品安全風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估中心衛(wèi)生部食品安全風(fēng)險(xiǎn)評(píng)估重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;上海市疾病預(yù)防控制中心;
【關(guān)鍵詞】： 腹瀉 嬰幼兒 鼠傷寒沙門(mén)菌 耐藥基因 毒力基因 全基因組測(cè)序 食源性致病菌
【基金】：北京市自然基金項(xiàng)目(5141002) 2016高層次人才隊(duì)伍建設(shè)項(xiàng)目(2016人才-3-14)
【分類(lèi)號(hào)】：R446.5;R440
【正文快照】： 鼠傷寒沙門(mén)菌(Salmonella typhimurium)屬于非傷寒沙門(mén)菌屬,Kauffmann-White-Le Minor Scheme已公布的2 610余種沙門(mén)菌血清型中[1-2],鼠傷寒沙門(mén)菌是最常見(jiàn)的腸道沙門(mén)菌血清型之一,其導(dǎo)致的食源性疾病已成為全球重要公共衛(wèi)生問(wèn)題[3]。1988—2000年國(guó)際上發(fā)生的4 093起微生物食

【相似文獻(xiàn)】

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