水稻干尖線蟲翻譯控制腫瘤蛋白基因的克隆及表達(dá)分析
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【摘要】:根據(jù)轉(zhuǎn)錄組測(cè)序結(jié)果,結(jié)合RT PCR及RACE技術(shù),從水稻干尖線蟲中克隆出翻譯控制腫瘤蛋白(The translationally controlled tumor protein,TCTP)基因Ab TCTP。該基因序列全長(zhǎng)810 bp,開放閱讀框長(zhǎng)度為546 bp,編碼181個(gè)氨基酸,預(yù)測(cè)蛋白相對(duì)分子質(zhì)量為20 930,等電點(diǎn)為4.68;Ab TCTP蛋白屬于穩(wěn)定性蛋白,沒有信號(hào)肽和跨膜區(qū)域,亞細(xì)胞定位于細(xì)胞核中;該蛋白功能區(qū)域的氨基酸序列較為保守,含有TCTP保守結(jié)構(gòu)域,屬于TCTP超家族(TCTP superfamily)。多序列比對(duì)分析結(jié)果表明,Ab TCTP蛋白與秀麗隱桿線蟲TCTP蛋白(XP_003112086.1)的覆蓋度為100%,相似度為78%。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析結(jié)果表明,該蛋白與秀麗隱桿線蟲TCTP蛋白(XP_003112086.1)在同一分支上,親緣關(guān)系較近。原位雜交試驗(yàn)結(jié)果顯示,雜交處理后的線蟲在其食道腺附近顏色加深,TCTP基因主要在水稻干尖線蟲的食道腺附近表達(dá)。利用魚藤酮對(duì)水稻干尖線蟲進(jìn)行藥劑處理試驗(yàn),24 h時(shí)LC50值為2.20μg/m L。實(shí)時(shí)熒光定量PCR結(jié)果顯示,魚藤酮處理12 h和24 h后,TCTP基因的表達(dá)均上調(diào),且處理24 h時(shí)的表達(dá)量大于處理12 h時(shí)的表達(dá)量。推測(cè)該基因參與了水稻干尖線蟲的應(yīng)激反應(yīng)。
【作者單位】: 東北林業(yè)大學(xué)林學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: 水稻干尖線蟲 翻譯控制腫瘤蛋白基因(TCTP) 基因克隆 原位雜交 基因表達(dá)
【基金】:國(guó)家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31570637) 黑龍江省自然科學(xué)基金項(xiàng)目(ZD201404) 中央高;究蒲袠I(yè)務(wù)專項(xiàng)基金項(xiàng)目(2572015AA09;2572015EY02;DL13BA01;2572015CA09)
【分類號(hào)】:S435.111.48
【正文快照】: 翻譯控制腫瘤蛋白(the translationally controlled tumor protein,TCTP)又名P21[1]、P23[2]、HRF[3]和Fortilin[4],是一類廣泛存在于各類真核生物中且在進(jìn)化上高度保守的蛋白[5 10]。因其在鼠腹水瘤細(xì)胞中的表達(dá)量高于在正常細(xì)胞中的表達(dá)量,且在翻譯水平上受到高度調(diào)控,Gros
【相似文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):765692
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