本文關(guān)鍵詞：谷子CO家族基因的全基因組鑒定與分析

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【摘要】：抽穗開花是高等植物從營養(yǎng)生長向生殖生長轉(zhuǎn)變的過程,該過程受到眾多基因的調(diào)控。CONSTANS(CO)是光周期開花途徑中的一個(gè)關(guān)鍵基因,是生物節(jié)律鐘基因和開花基因之間的關(guān)鍵樞紐。利用生物信息學(xué)的方法,從谷子基因組中鑒定了34個(gè)CO基因;與擬南芥CO家族的17個(gè)成員進(jìn)行同源比對(duì),發(fā)現(xiàn)Seita.7G007800與Seita.9G020100相似性最高;在此基礎(chǔ)上,分析了谷子CO基因的啟動(dòng)子,發(fā)現(xiàn)啟動(dòng)子有光響應(yīng)元件Sp1、脫落酸響應(yīng)元件ABRE以及赤霉素響應(yīng)元件P-box等;RNA-Seq轉(zhuǎn)錄組測(cè)序發(fā)現(xiàn),這些CO基因在葉片中表達(dá)量存在顯著差異,其中,Seita.4G192300基因表達(dá)量最高,而Seita.1G304900,Seita.3G080700和Seita.4G001600這3個(gè)基因在葉片中不表達(dá)。這些結(jié)果不僅為深入研究CO基因與抽穗開花的關(guān)系提供依據(jù),而且為后續(xù)谷子抽穗開花途徑的研究奠定理論基礎(chǔ)。
【作者單位】： 山西農(nóng)業(yè)大學(xué)文理學(xué)院;山西農(nóng)業(yè)大學(xué)研究生院;山西農(nóng)業(yè)大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 谷子 全基因組 CONSTANS 光周期途徑 抽穗 開花
【基金】：山西省回國留學(xué)人員科研資助項(xiàng)目(2015-067) 山西省留學(xué)回國人員科技活動(dòng)擇優(yōu)資助項(xiàng)目(2014-11)
【分類號(hào)】：S515
【正文快照】： 谷子(Setaria italica)是禾本科狗尾草屬植物,具有抗旱性強(qiáng)、耐貧瘠等優(yōu)點(diǎn),廣泛種植于干旱和半干旱地區(qū)。2012年,由美國國家能源部所屬的聯(lián)合基因組研究所和中國華大基因分別進(jìn)行的豫谷1號(hào)和張谷的全基因組測(cè)序工作相繼完成,從此谷子功能基因組學(xué)研究進(jìn)入了一個(gè)新的時(shí)代[1-2]

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：763980