小麥西農(nóng)538幾丁質(zhì)酶基因的克
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更多相關(guān)文章: 西農(nóng)538 幾丁質(zhì)酶 原核表達(dá) 組織表達(dá) 功能分析
【摘要】:幾丁質(zhì)酶是植物重要的防衛(wèi)因子之一,與植物的抗病性密切相關(guān)。為了進(jìn)一步擴(kuò)充幾丁質(zhì)酶基因資源,深入了解其在小麥體內(nèi)的表達(dá)特性及其功能,本研究利用通用引物ChiF/ChiR從不同的小麥材料中,克隆得到幾丁質(zhì)酶基因并對(duì)序列進(jìn)行分析,與表達(dá)載體連接在大腸桿菌中進(jìn)行表達(dá),并利用熒光定量PCR (qRT-PCR)技術(shù)分析這些基因在西農(nóng)538小麥根、莖和葉等不同組織中的表達(dá)情況。最后,選取在西農(nóng)538小麥的根、莖和葉組織中表達(dá)量較高的2個(gè)幾丁質(zhì)酶基因進(jìn)一步研究其與條銹病菌的抗性反應(yīng)試驗(yàn)。結(jié)果表明:1.從10份具有不同抗病性的小麥材料中,均能夠克隆得到5條長度約960 bp的幾丁質(zhì)酶基因序列,依次命名為Cht1、Cht2、Cht3、Cht4和Cht5。利用NCBI在線BLAST軟件對(duì)這5條基因序列進(jìn)行同源性比對(duì),結(jié)果搜索到100條具有同源性的核苷酸序列,其中Cht5與來自于中國春的Chi-3基因(序列號(hào)KJ507387)完全一致,進(jìn)而將剩余基因提交至GenBank,獲得登錄號(hào)為KR049247~KR049250。2.對(duì)新擴(kuò)增到的Cht1~Cht4基因序列進(jìn)行分析表明,這些基因均具有完整的開放閱讀框,不含內(nèi)含子,起始密碼子均為ATG,終止密碼子都是TAG。Chtl~Cht4的核苷酸和氨基酸序列之間的相似性分別為96.84%和91.02%。這四條基因編碼的幾丁質(zhì)酶均屬于親水性蛋白,按照不同的分類方法,這些幾丁質(zhì)酶分別屬于Class Ⅰ b類型,同時(shí)也屬于糖苷水解酶第19家族,是胞外分泌蛋白且兼具溶菌酶活性。將獲得的4條氨基酸序列與NCBI中已知來源的不同類型的幾丁質(zhì)酶蛋白序列進(jìn)行比對(duì),并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,聚類結(jié)果顯示,本研究中得到的幾丁質(zhì)酶屬于Class Ⅰ型。3.SDS-PAGE分析表明,這四條基因?qū)?yīng)的重組質(zhì)粒均能夠在表達(dá)菌株TranBL21(DE3)中以包涵體的形式表達(dá)一個(gè)33 kDa左右的特異蛋白,與目標(biāo)蛋白大小一致。4. qRT-PCR分析表明,這5個(gè)幾丁質(zhì)酶基因均能夠在西農(nóng)538的根、莖和葉中組成型表達(dá),但在不同組織中具有較大的表達(dá)差異:葉中表達(dá)量最高,根次之,莖中的表達(dá)量最低;同時(shí),這5種幾丁質(zhì)酶基因在同一組織中的表達(dá)量也具有明顯規(guī)律性:Cht4 Cht2Cht3Cht1Chi-3。說明本研究擴(kuò)增到的幾丁質(zhì)酶基因可能參與了小麥的正常生長發(fā)育過程。5.選取相對(duì)表達(dá)量較高的Cht4基因和Cht2基因進(jìn)一步驗(yàn)證其對(duì)真菌性病害的抗性反應(yīng),結(jié)果表明,這兩個(gè)基因的表達(dá)均可以受到條銹病菌的誘導(dǎo),并且Cht4基因表達(dá)量與Cht2基因相比更早的出現(xiàn)峰值。Cht4基因在高抗材料92R137中的表達(dá)量顯著高于中抗材料西農(nóng)538和感病材料銘賢169,并且均高于同等條件下接ddH20的表達(dá)量;Cht2基因在中抗材料西農(nóng)538中的表達(dá)量顯著高于高抗材料92R137和感病材料銘賢169,并且抗病材料中的基因表達(dá)量高于對(duì)照中表達(dá)量,但在感病材料銘賢169中該基因表達(dá)與對(duì)照差別不大。說明Cht4基因和Cht2基因可能參與了小麥葉部抗條銹菌的防御反應(yīng)。
【關(guān)鍵詞】:西農(nóng)538 幾丁質(zhì)酶 原核表達(dá) 組織表達(dá) 功能分析
【學(xué)位授予單位】:西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:S512.1;Q943.2
【目錄】:
- 摘要5-7
- ABSTRACT7-12
- 第一章 文獻(xiàn)綜述12-20
- 1.1 幾丁質(zhì)酶的酶學(xué)特性12-13
- 1.2 幾丁質(zhì)酶的分布定位13
- 1.3 幾丁質(zhì)酶的分類13-15
- 1.3.1 根據(jù)系統(tǒng)分類法分類13-14
- 1.3.2 基于水解位點(diǎn)分類14
- 1.3.3 根據(jù)等電點(diǎn)分類14
- 1.3.4 根據(jù)催化部位氨基酸序列分類14
- 1.3.5 根據(jù)蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)分類14-15
- 1.4 幾丁質(zhì)酶的生物學(xué)作用15-17
- 1.4.1 參與植物的發(fā)育調(diào)控15-16
- 1.4.2 抑制真菌菌絲生長和孢子萌發(fā)16
- 1.4.3 參與共生固氮16
- 1.4.4 釋放信號(hào)分子16
- 1.4.5 抑制細(xì)菌生長和分裂、蟲類消化和發(fā)育16-17
- 1.5 植物幾丁質(zhì)酶的研究進(jìn)展17-19
- 1.5.1 植物幾丁質(zhì)酶的體外抑菌研究17
- 1.5.2 植物幾丁質(zhì)酶的可誘導(dǎo)性17-18
- 1.5.3 植物幾丁質(zhì)酶的轉(zhuǎn)基因研究18
- 1.5.4 小麥幾丁質(zhì)酶的研究進(jìn)展18-19
- 1.6 本研究的目的及意義19-20
- 第二章 西農(nóng)538幾丁質(zhì)酶基因的克隆及序列分析20-30
- 2.1 實(shí)驗(yàn)材料及其他20-21
- 2.1.1 植物材料20
- 2.1.2 儀器和設(shè)備20
- 2.1.3 試劑和培養(yǎng)基20-21
- 2.2 實(shí)驗(yàn)方法21-23
- 2.2.1 基因組DNA的提取21-22
- 2.2.2 目的基因的擴(kuò)增及回收22
- 2.2.3 目的基因的克隆22-23
- 2.2.4 目的基因的生物信息學(xué)分析23
- 2.3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果與分析23-30
- 2.3.1 幾丁質(zhì)酶基因的克隆23-24
- 2.3.2 核酸序列分析24-25
- 2.3.3 氨基酸序列分析25-27
- 2.3.4 系統(tǒng)進(jìn)化分析27-30
- 第三章 西農(nóng)538幾丁質(zhì)酶基因的原核表達(dá)及目的蛋白的鑒定30-35
- 3.1 實(shí)驗(yàn)材料及其他30-31
- 3.1.1 載體及菌株30
- 3.1.2 儀器和設(shè)備30
- 3.1.3 相關(guān)試劑30-31
- 3.2 實(shí)驗(yàn)方法31-33
- 3.2.1 提取質(zhì)粒31
- 3.2.2 原核表達(dá)載體的構(gòu)建31-32
- 3.2.3 重組質(zhì)粒的誘導(dǎo)表達(dá)32
- 3.2.4 原核表達(dá)產(chǎn)物溶解性鑒定32-33
- 3.2.5 原核表達(dá)產(chǎn)物的純化33
- 3.3 結(jié)果與分析33-35
- 3.3.1 原核載體構(gòu)建及目的蛋白檢測33-34
- 3.3.2 原核表達(dá)產(chǎn)物溶解性鑒定34
- 3.3.3 原核表達(dá)產(chǎn)物的純化34-35
- 第四章 西農(nóng)538幾丁質(zhì)酶基因的組織表達(dá)及功能分析35-41
- 4.1 實(shí)驗(yàn)材料及其他35
- 4.1.1 植物材料35
- 4.1.2 儀器和設(shè)備35
- 4.1.3 相關(guān)試劑(盒)35
- 4.2 試驗(yàn)方法35-38
- 4.2.1 樣品采集35-36
- 4.2.2 RNA提取及RT-PCR36-38
- 4.3 結(jié)果與分析38-41
- 4.3.1 西農(nóng)538幾丁質(zhì)酶基因的組織表達(dá)特性38-39
- 4.3.2 Cht4基因和Cht2基因在條銹菌侵染后的表達(dá)特性39-41
- 第五章 討論與結(jié)論41-44
- 5.1 討論41-43
- 5.1.1 西農(nóng)538幾丁質(zhì)酶基因的克隆及序列分析41
- 5.1.2 西農(nóng)538幾丁質(zhì)酶基因的原核表達(dá)41-42
- 5.1.3 西農(nóng)538幾丁質(zhì)酶基因的組織表達(dá)特性分析42
- 5.1.4 Cht4基因和Cht2基因在條銹菌侵染后表達(dá)特性分析42-43
- 5.2 結(jié)論43-44
- 參考文獻(xiàn)44-49
- 致謝49-50
- 作者簡介50
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