發(fā)布時間：2017-08-23 04:00

  本文關(guān)鍵詞：亞麻纖維素合酶超基因家族的生物信息學(xué)及表達分析

  更多相關(guān)文章： 亞麻 纖維素合酶 CesA/Csls 基因家族 表達分析

【摘要】：【目的】全基因組水平鑒定亞麻纖維素合酶超家族基因Ces A/Csls,并對基因的進化、基因結(jié)構(gòu)及組織表達特性等進行分析,為亞麻纖維發(fā)育的機理研究奠定基礎(chǔ)�！痉椒ā坷肞hytozome基因組數(shù)據(jù)庫,通過生物信息學(xué)手段,鑒定亞麻纖維素合酶超基因家族成員,并進行蛋白理化特性分析;利用MEGA 5.0、GSDS、MEME等軟件構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,并進行基因結(jié)構(gòu)、蛋白保守基序分析;根據(jù)RNA-Seq數(shù)據(jù)對Ces A/Csls進行表達分析�！窘Y(jié)果】系統(tǒng)分析鑒定了45個亞麻Ces A/Csls超家族基因,該家族基因在scaffolds上是分散分布的,沒有明顯的成簇現(xiàn)象。Ces A/Csls蛋白主要分布于質(zhì)膜上,氨基酸數(shù)目為409—1 167,分子量為47 401.1—130 578.3,等電點分布在5.43—9.08。Ces A/Csl蛋白均含有跨膜結(jié)構(gòu)域,數(shù)目為2—8。根據(jù)系統(tǒng)進化分析將其分成Ces A與Csl兩類,細(xì)分為Ces A、Csl A、Csl B、Csl C、Csl D、Csl E、Csl G共7組。基因結(jié)構(gòu)分析顯示,亞麻Ces A/Csls基因的長度在2.1—6.8 kb,外顯子數(shù)量在2—14。保守基序分析表明,不同組間Motif組成有一定的差異,Motif 1、Motif 2、Motif 3、Motif 4、Motif 12在Ces A、Csl B、Csl D、Csl E、Csl G組蛋白中均有分布,Motif 18、Motif 20在Csl A、Csl C組蛋白中均有分布,而Motif 13、Motif 14、Motif 15、Motif 19的分布則表現(xiàn)出一定的組間特異性。表達譜分析結(jié)果表明,Ces A/Csls家族成員在不同發(fā)育階段表達模式不同,部分Ces A/Csls可被Na Cl、BR和Brz誘導(dǎo)上調(diào)或下調(diào)表達,預(yù)示Ces A/Csls功能的多樣性以及在植物發(fā)育過程中扮演著不同角色。【結(jié)論】鑒定出45個亞麻Ces A/Csls家族基因成員,分屬于兩類,7組,分布于scaffolds上,基因結(jié)構(gòu)和蛋白基序具有組間多樣性和組內(nèi)保守性。不同的基因在不同發(fā)育階段具有一定的時空特異性。Ces A/Csls中部分基因響應(yīng)激素BR、Brz及Na Cl脅迫。
【作者單位】： 黑龍江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院經(jīng)濟作物研究所;黑龍江省科學(xué)院自然與生態(tài)研究所;黑龍江省農(nóng)業(yè)科學(xué)院作物育種研究所;
【關(guān)鍵詞】： 亞麻 纖維素合酶 CesA/Csls 基因家族 表達分析
【基金】：國家博士后面上項目(2014M560275) 黑龍江省博士后項目(LBH-Z13181) 哈爾濱市科技局創(chuàng)新人才項目(2013RFQYJ162) 國家麻類產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系(CARS-19-S03)
【分類號】：S563.2
【正文快照】： 0引言【研究意義】纖維素、半纖維素是地球上最豐富和重要的可再生資源。纖維素是由D-葡萄糖通過β-1,4糖苷鍵連接而成的一種線性葡聚糖,而半纖維素主要包含木聚糖、葡甘露聚糖和半乳葡甘露聚糖等,它們共同組成了細(xì)胞壁的主要骨架結(jié)構(gòu)。深入研究纖維植物中纖維素的生物合成過

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中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 徐麗珍;;亞麻種質(zhì)資源創(chuàng)新的途徑[J];黑龍江農(nóng)業(yè)科學(xué);2006年04期

2 李科;岳粉琴;李志軍;;亞麻新品種9679-2-1-1的選育[J];中國種業(yè);2006年08期

3 何學(xué)芹;宋云飛;張朝鐘;曾林;賈學(xué)恩;楊衛(wèi)國;;纖維亞麻品種篩選試驗研究[J];中國麻業(yè)科學(xué);2006年06期

4 孫進昌;;亞麻新品種通過登記[J];農(nóng)村百事通;2007年10期

5 夏尊民;;我國纖維用亞麻育種研究現(xiàn)狀與發(fā)展[J];中國麻業(yè)科學(xué);2007年03期

6 吳玉娥;楊學(xué);趙念力;楊帆;張睿;;俄羅斯全俄亞麻研究所考察報告[J];中國麻業(yè)科學(xué);2008年06期

7 吳廣文;;關(guān)于波蘭亞麻的考察報告[J];黑龍江農(nóng)業(yè)科學(xué);2008年01期

8 徐麗珍;;黑亞系列亞麻品種的選育及應(yīng)用[J];中國麻業(yè)科學(xué);2008年04期

9 魏國江;;黑龍江省纖維用亞麻育種的幾點建議[J];黑龍江紡織;2009年01期

10 李愛榮;;油用亞麻品種比較試驗及分析評價[J];中國麻業(yè)科學(xué);2011年03期

中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條

1 關(guān)鳳芝;;利用分子輔助技術(shù)建立亞麻核心種質(zhì)庫研究[A];2010中國作物學(xué)會學(xué)術(shù)年會論文摘要集[C];2010年

2 王玉富;;我國亞麻生物技術(shù)的研究現(xiàn)狀及發(fā)展[A];2004’中國作物學(xué)會學(xué)術(shù)年會會議資料[C];2004年

中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前6條

1 ;黑龍江省利用新技術(shù)培育亞麻品種[N];中華合作時報;2000年

2 記者 周伶;種植亞麻選良種 輪作防病又高產(chǎn)[N];新疆科技報(漢);2010年

3 杜彬　姜洪濤;三省專家匯聚尾山研討亞麻新品種[N];農(nóng)民日報;2009年

4 牟定縣種子管理站 楊杰雄;亞麻優(yōu)良品種——阿里亞娜[N];云南科技報;2001年

5 記者 周伶;高產(chǎn)優(yōu)質(zhì)纖用亞麻新品種選育成功[N];新疆科技報(漢);2010年

6 張秀芝 記者 金龍;建成省內(nèi)最大優(yōu)質(zhì)亞麻種子繁育基地[N];黑龍江日報;2004年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前9條

1 韓承偉;大慶地區(qū)不同亞麻品種的性狀研究[D];中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院;2013年

2 宋鑫玲;亞麻資源抗旱性鑒定及對干旱脅迫生理反應(yīng)的研究[D];黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué);2015年

3 周亞東;黑龍江省油用亞麻產(chǎn)量品質(zhì)形成特點研究[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2010年

4 常潔;理化誘變對三種亞麻生理生化特性的影響[D];新疆大學(xué);2010年

5 何東鋒;亞麻RAPD和微衛(wèi)星標(biāo)記開發(fā)與遺傳多樣性分析[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2009年

6 高鳳云;亞麻顯性核不育基因RAPD標(biāo)記及特異片斷序列分析[D];內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué);2006年

7 鄧倩;EMS誘變3個纖維亞麻品種下胚軸段耐鹽突變體的離體篩選[D];新疆大學(xué);2013年

8 李翔;OsCesA4過表達和三個木質(zhì)素合成相關(guān)酶基因RNAi的亞麻轉(zhuǎn)基因研究[D];湖南農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

9 姜碩;基于SRAP的亞麻（Linum usitatissimum）連鎖圖譜及QTL研究[D];東北農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年

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本文編號：722822