GyrB基因在諾卡菌菌種鑒定中的應(yīng)用研究
本文關(guān)鍵詞:GyrB基因在諾卡菌菌種鑒定中的應(yīng)用研究
【摘要】:目的分析研究gyr B基因?qū)τ谥Z卡菌種水平的鑒定能力。方法采用特異性引物對14種41株諾卡菌的gyr B基因進行擴增,并對其產(chǎn)物進行測序。從Gen Bank數(shù)據(jù)庫中下載21株諾卡菌gyr B基因序列,對序列用DNAStar軟件計算其相似性。利用Mega 6.06軟件,采用鄰接法和最大似然法構(gòu)建諾卡菌菌種系統(tǒng)發(fā)育進化樹。結(jié)果以gyr B基因構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育進化樹中,不同諾卡菌種能準確地分離成獨立的分支,且親緣關(guān)系較近的近緣種也能得到有效分離。諾卡菌種gyr B基因種內(nèi)相似性為94.2%~100%,種間相似性約為79.2%~97.6%,平均相似性為86.9%。結(jié)論 gyr B基因序列分析是一種快速、準確、特異性較高的鑒定方法,能將諾卡菌屬的鑒定至種的水平,對于鑒定諾卡菌屬近緣種gyr B基因比16S r DNA更具優(yōu)越性。
【作者單位】: 溫州醫(yī)科大學(xué)檢驗醫(yī)學(xué)院 檢驗醫(yī)學(xué)教育部重點實驗室;中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所傳染病預(yù)防控制國家重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】: 諾卡菌 gyrB基因 鑒定
【基金】:國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃(863計劃)(No.2014AA021404)~~
【分類號】:R440
【正文快照】: 作者單位:1.溫州醫(yī)科大學(xué)檢驗醫(yī)學(xué)院,檢驗醫(yī)學(xué)教育部重點實驗室,溫州325035;2.中國疾病預(yù)防控制中心傳染病預(yù)防控制所,傳染病預(yù)防控制國家重點實驗室,北京102206Corresponding author:LOU Yong-liang,Email:louyongliang2013@163.com諾卡菌(Nocardia,N.),屬于諾卡菌種,是一種
【相似文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前6條
1 孫渭歌;侯雪新;徐帥;孫麗娜;趙利利;張景山;楊海燕;李振軍;;快速鑒定諾卡菌的多重聚合酶鏈反應(yīng)的建立[J];微生物與感染;2014年02期
2 李術(shù)惠;王曉燕;曲本祥;李曉軍;胡志紅;;其他微生物及酸堿前處理對諾卡菌分離培養(yǎng)的影響[J];國際檢驗醫(yī)學(xué)雜志;2013年06期
3 張麗琴;肖九長;李世云;;尿毒癥伴諾卡菌感染1例[J];實驗與檢驗醫(yī)學(xué);2013年04期
4 劉敏,史莉,許敏;血液中檢出星狀諾卡菌兩例報道[J];中華醫(yī)院感染學(xué)雜志;2003年08期
5 張煜禮;侯偉偉;肖倩茹;江漣;劉沙沙;萬海英;;膿液中分離出諾卡菌2例[J];檢驗醫(yī)學(xué)與臨床;2012年24期
6 ;[J];;年期
中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 黃慧;徐凱;王艷勛;張婷婷;姜純國;徐作軍;;肺部諾卡菌感染的胸部CT特點[A];中華醫(yī)學(xué)會呼吸病學(xué)年會——2013第十四次全國呼吸病學(xué)學(xué)術(shù)會議論文匯編[C];2013年
中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條
1 孫渭歌;諾卡菌多重PCR及Real-time PCR檢測方法的建立[D];鄭州大學(xué);2014年
,本文編號:720214
本文鏈接:http://sikaile.net/kejilunwen/jiyingongcheng/720214.html