本文關(guān)鍵詞：短小芽孢桿菌實時熒光定量PCR分析中內(nèi)參基因的篩選

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【摘要】：為了利用熒光定量PCR方法分析短小芽孢桿菌的基因表達水平,需要首先確定適合該菌株的熒光定量PCR分析內(nèi)參基因。以短小芽孢桿菌的16S rRNA、mecA、cadR、rpoB及sphP共5個基因作為候選內(nèi)參基因,利用實時熒光定量PCR的方法分析這5個候選基因在短小芽孢桿菌發(fā)酵培養(yǎng)不同時間點的表達情況,再用geNorm和NormFinder軟件評估它們的表達穩(wěn)定性。結(jié)果顯示,利用geNorm軟件分析得出16S rRNA和mecA是表達最穩(wěn)定的基因,最適內(nèi)參基因數(shù)為2。NormFindr軟件分析得出mecA為最穩(wěn)定的基因。對短小芽孢桿菌3個功能基因的差異表達分析結(jié)果表明,16S rRNA和mecA都是合適的內(nèi)參基因,而mecA基因由于表達豐度適中,更適合于作為內(nèi)參基因研究結(jié)構(gòu)基因的表達。為了得到更準確的差異表達結(jié)果,也可用兩個基因同時進行校正。
【作者單位】： 四川大學生命科學學院;
【關(guān)鍵詞】： 短小芽孢桿菌 實時熒光定量PCR 內(nèi)參基因 geNorm NormFinder
【基金】：國家高技術(shù)研究發(fā)展計劃(“863”計劃)(2012AA022204)
【分類號】：Q78
【正文快照】： 近年來,實時熒光定量PCR技術(shù)已被廣泛應(yīng)用于不同生物基因表達的絕對定量和相對定量研究,這項技術(shù)因具有高靈敏性、高效性、準確性和重復(fù)性好等特點,已成為分子生物學研究領(lǐng)域基因表達分析的重要方法之一,被大量用于分析基因在不同發(fā)育時期以及經(jīng)過不同處理的樣本間的表達差異

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本文編號：703826