桂花查耳酮合酶chs基因的克隆及序列分析
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【摘要】:克隆與桂花(Osmanthus fragrans)花色形成相關(guān)基因查耳酮合酶(Ofchs),并對該基因的序列特征、進(jìn)化關(guān)系進(jìn)行分析,為探究該基因在桂花花色形成中的功能提供理論依據(jù)。以桂花‘丹桂’品種為試材,采用RT-PCR和RACE方法克隆丹桂查耳酮合酶(chalcone synthase,chs)基因c DNA全長。利用NCBI和DNAMAN分析軟件,對該基因進(jìn)行核苷酸序列以及氨基酸序列的分析,利用DNAMAN軟件直接構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,以分析該基因在不同物種間的進(jìn)化關(guān)系。結(jié)果表明:從‘丹桂’花瓣中成功獲得了1個丹桂查耳酮合酶基因c DNA全長,該基因全長為1383 bp,包含48 bp的5′非編碼區(qū)、162 bp的3′非編碼區(qū)和1個長度為1173 bp編碼390個氨基酸的開放閱讀框。序列分析表明,該基因具有Cysl64、His303和Asn3363個活性位點(diǎn)及2個決定底物特異性的苯丙氨酸殘基Phe215、Phe265。該基因也具有查爾酮合酶家族的2條特征多肽序列:RFMMYQQGCFAGGTVLR和GVLFGFGPGL。Blast序列分析顯示,該基因與同屬木犀科的油橄欖相似性達(dá)95%,與其他雙子葉植物的相似性達(dá)72%~76%。克隆出的丹桂chs基因?qū)儆诓闋柾厦讣易?系統(tǒng)進(jìn)化分析表明,該基因聚類具有明顯的種屬特性,桂花與唇形科等植物的chs親緣關(guān)系較近,相似性達(dá)76%以上,符合植物分類學(xué)分類,為今后探究該基因在花色行形成中的作用機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。
【作者單位】: 山東農(nóng)業(yè)大學(xué)林學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: 桂花 查耳酮合酶基因 克隆 序列分析
【基金】:山東省自然科學(xué)基金(ZR2013CQ008)
【分類號】:S685.13
【正文快照】: 0引言花色作為觀賞植物的一個重要性狀,直接影響花卉的觀賞價值和經(jīng)濟(jì)價值,創(chuàng)造具有新奇花色品種一直是遺傳育種工作者的追求[1]。黃金霞等[2-3]選用植物化學(xué)的分析方法,發(fā)現(xiàn)花色的形成與植物內(nèi)一類次級代謝產(chǎn)物類黃酮有關(guān)。在花色形成的過程當(dāng)中,花色素起最主要的作用,是高等
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本文編號:700081
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