本文關鍵詞：兩株2.1d新基因亞型豬瘟病毒的全基因組序列分析及其基因亞型分子特征

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【摘要】：為研究豬瘟病毒(CSFV)2.1d新基因亞型的基因組特征,本研究根據(jù)Gen Bank中登錄的Zj0801株CSFV全基因組序列設計合成6對引物,通過RT-PCR方法對2014年分離自山東的兩株2.1d亞型CSFV(SDSG1410和SDLS1410)進行全基因組測序,兩株CSFV全長均為12 296 nt。全基因組遺傳演化分析表明這兩個分離株位于一個獨立分支中,屬于2.1d亞型,與E2基因分型結(jié)果一致。核苷酸和推導氨基酸同源性分析顯示,分離株全基因組同源性與參考株相比差異較大,與Zj0801株的全基因組同源性最高為97.3%~97.5%,而與1.1亞型的Shimen和HCLV株的同源性僅為85.0%~85.1%和84.3%~84.4%;部分基因和非翻譯區(qū)變異較大,如N~(pro)、C、E2、NS2、NS5A和3'UTR。對全基因組氨基酸序列分析,結(jié)果顯示2.1d亞型CSFV在V~(640)、K~(992)、A~(1020)、M~(1090)、R~(1395)和D~(2374) 6處氨基酸上具有共同的分子特征。以上研究結(jié)果增加了CSFV 2.1d新基因亞型的分型依據(jù)。
【作者單位】： 長江大學生命科學學院;中國農(nóng)業(yè)科學院哈爾濱獸醫(yī)研究所獸醫(yī)生物技術國家重點實驗室;
【關鍵詞】： 豬瘟病毒 .d亞型 分子特征
【基金】：國家自然科學基金(31001050/C1803)
【分類號】：S852.65
【正文快照】： 豬瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV)是引起豬瘟的病原,豬瘟是威脅我國養(yǎng)豬業(yè)的重要疫病,被OIE列入須通報的動物傳染病[1]。CSFV屬于黃病毒科瘟病毒屬成員,為單鏈RNA病毒。全長約為12 300 nt,其5'端和3'端非編碼區(qū)(UTR)之間是一個大的開放閱讀框(ORF),編碼一個由3 898

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1 祁小樂;高立;秦立廷;鄧小蕓;吳關;張禮洲;余飛;任憲剛;高玉龍;高宏雷;王永強;王笑梅;;一株雞傳染性法氏囊病病毒基因組測序及其分子特征(英文)[J];Agricultural Science & Technology;2011年12期

2 楊霖;何秀苗;yそ鴆，

本文編號：697528