本文關(guān)鍵詞：兩株2.1d新基因亞型豬瘟病毒的全基因組序列分析及其基因亞型分子特征

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【摘要】：為研究豬瘟病毒(CSFV)2.1d新基因亞型的基因組特征,本研究根據(jù)Gen Bank中登錄的Zj0801株CSFV全基因組序列設(shè)計(jì)合成6對(duì)引物,通過(guò)RT-PCR方法對(duì)2014年分離自山東的兩株2.1d亞型CSFV(SDSG1410和SDLS1410)進(jìn)行全基因組測(cè)序,兩株CSFV全長(zhǎng)均為12 296 nt。全基因組遺傳演化分析表明這兩個(gè)分離株位于一個(gè)獨(dú)立分支中,屬于2.1d亞型,與E2基因分型結(jié)果一致。核苷酸和推導(dǎo)氨基酸同源性分析顯示,分離株全基因組同源性與參考株相比差異較大,與Zj0801株的全基因組同源性最高為97.3%~97.5%,而與1.1亞型的Shimen和HCLV株的同源性僅為85.0%~85.1%和84.3%~84.4%;部分基因和非翻譯區(qū)變異較大,如N~(pro)、C、E2、NS2、NS5A和3'UTR。對(duì)全基因組氨基酸序列分析,結(jié)果顯示2.1d亞型CSFV在V~(640)、K~(992)、A~(1020)、M~(1090)、R~(1395)和D~(2374) 6處氨基酸上具有共同的分子特征。以上研究結(jié)果增加了CSFV 2.1d新基因亞型的分型依據(jù)。
【作者單位】： 長(zhǎng)江大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;中國(guó)農(nóng)業(yè)科學(xué)院哈爾濱獸醫(yī)研究所獸醫(yī)生物技術(shù)國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;
【關(guān)鍵詞】： 豬瘟病毒 .d亞型 分子特征
【基金】：國(guó)家自然科學(xué)基金(31001050/C1803)
【分類號(hào)】：S852.65
【正文快照】： 豬瘟病毒(Classical swine fever virus,CSFV)是引起豬瘟的病原,豬瘟是威脅我國(guó)養(yǎng)豬業(yè)的重要疫病,被OIE列入須通報(bào)的動(dòng)物傳染病[1]。CSFV屬于黃病毒科瘟病毒屬成員,為單鏈RNA病毒。全長(zhǎng)約為12 300 nt,其5'端和3'端非編碼區(qū)(UTR)之間是一個(gè)大的開(kāi)放閱讀框(ORF),編碼一個(gè)由3 898

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1 祁小樂(lè);高立;秦立廷;鄧小蕓;吳關(guān);張禮洲;余飛;任憲剛;高玉龍;高宏雷;王永強(qiáng);王笑梅;;一株雞傳染性法氏囊病病毒基因組測(cè)序及其分子特征(英文)[J];Agricultural Science & Technology;2011年12期

2 楊霖;何秀苗;yそ鴆，

本文編號(hào)：697528