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干旱和鹽脅迫中大麥實時定量PCR內(nèi)參基因的篩選

發(fā)布時間:2017-08-16 11:36

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【摘要】:為篩選大麥中干旱和鹽脅迫條件下適宜的實時定量PCR內(nèi)參基因,我們對栽培大麥23-19和野生大麥4-3進行了3種不同的脅迫處理:不澆水自然干旱、30%PEG干旱脅迫、0.4 mol/L Na Cl鹽脅迫,用內(nèi)參分析軟件Ge Norm和Norm Finder分析比較了6種常用內(nèi)參基因ubiquitin、a-tubulin 2、Actin、ARF1、EF1a、SAM在不同組織部位的表達穩(wěn)定性,并以篩選到的穩(wěn)定內(nèi)參分析了脅迫誘導(dǎo)表達基因DHN1的表達情況。結(jié)果顯示:篩選內(nèi)參基因時,將所有實驗數(shù)據(jù)綜合在一起分析,未能找到穩(wěn)定表達的內(nèi)參基因及其組合;按根、莖、葉進行內(nèi)參基因的篩選發(fā)現(xiàn)不同的組織部位、在不同的脅迫處理下,穩(wěn)定表達的內(nèi)參基因不完全相同;葉片中內(nèi)參基因的表達穩(wěn)定性最為一致,ubiquitin、Actin和ARF1在3種不同的脅迫處理下均有較為穩(wěn)定的表達。以篩選到的內(nèi)參基因ubiquitin、Actin和ARF1分析DHN1的表達情況,結(jié)果與植物的生長表現(xiàn)吻合。研究結(jié)果表明同時考慮太多的變量組合(如不同脅迫,不同組織)不易篩選到穩(wěn)定表達的內(nèi)參基因,建議在進行實時定量PCR研究之前根據(jù)具體的實驗條件先對內(nèi)參基因進行篩選。葉片適宜作為組織材料、ubiquitin、Actin和ARF1適宜作為內(nèi)參基因組合對干旱和鹽脅迫下野生大麥和栽培大麥進行實時定量PCR研究。
【作者單位】: 南方科技大學(xué)生物系細胞微環(huán)境重點實驗室;中國科學(xué)院西北生態(tài)環(huán)境資源研究院;
【關(guān)鍵詞】大麥 干旱脅迫 鹽脅迫 內(nèi)參基因
【基金】:國家自然科學(xué)基金青年基金(31300235)資助
【分類號】:S512.3
【正文快照】: *通訊作者,maxy@sustc.edu.cnReference Genes Screening for Quantitative Real-Time PCR in Barley underDrought and Salt StressMa Xiaoying1*Jia Fangxing1Zhao Yinglan1Zhao Jiecai21 Shenzhen Key Laboratory of Cell Microenvironment,Department of Biology,Southern

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