本文關(guān)鍵詞：番茄SlMAPK9-2基因分離及表達(dá)分析

  更多相關(guān)文章： 番茄 促分裂原活化蛋白激酶 Sl MAPK- 生物信息學(xué)分析 表達(dá)分析

【摘要】：促分裂原活化蛋白激酶(MAPK)信號途徑在植物生長發(fā)育以及多種逆境脅迫響應(yīng)和激素調(diào)控過程中發(fā)揮著至關(guān)重要的作用。為了研究MAPK基因的結(jié)構(gòu)和功能,利用生物信息學(xué)分析以及PCR擴(kuò)增方法從番茄中分離了1個(gè)新的MAPK基因,克隆其c DNA全長序列,命名為Sl MAPK9-2;利用NCBI數(shù)據(jù)庫Blast P工具和在線軟件MEME分析發(fā)現(xiàn)其具有MAPK保守的結(jié)構(gòu)域和保守基序。系統(tǒng)進(jìn)化樹分析顯示Sl MAPK9-2屬于D組MAPK,與茄科植物馬鈴薯和煙草MAPK9位于同一進(jìn)化樹分支。利用數(shù)據(jù)庫PGDD分析發(fā)現(xiàn),Sl MAPK9-2與Sl MAPK16以及Pm MAPK9之間發(fā)生了大片段復(fù)制事件,且2個(gè)基因?qū)Φ腒a/Ks均小于1,說明經(jīng)歷了達(dá)爾文純化選擇。實(shí)時(shí)熒光定量PCR分析發(fā)現(xiàn),Sl MAPK9-2在不同組織器官中均有表達(dá),在開放花中表達(dá)量最高。非生物逆境(高溫和鹽脅迫)和外源激素(脫落酸和水楊酸)處理可以顯著改變Sl MAPK9-2的表達(dá)水平。啟動(dòng)子預(yù)測分析也發(fā)現(xiàn),Sl MAPK9-2啟動(dòng)子區(qū)含有大量響應(yīng)病原菌、激素、高溫及脫水的順式作用元件。綜上,Sl MAPK9-2可能在番茄逆境脅迫應(yīng)答中發(fā)揮重要調(diào)控作用。本研究為進(jìn)一步探索Sl MAPK9-2的生物學(xué)功能及作用機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。
【作者單位】： 浙江大學(xué)農(nóng)業(yè)與生物技術(shù)學(xué)院園藝系;
【關(guān)鍵詞】： 番茄 促分裂原活化蛋白激酶 Sl MAPK- 生物信息學(xué)分析 表達(dá)分析
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31471878) 浙江省重點(diǎn)科技創(chuàng)新團(tuán)隊(duì)項(xiàng)目(2013TD05)
【分類號】：S641.2;Q943.2
【正文快照】： 促分裂原活化蛋白激酶(mitogen-activitatedprotein kinase,MAPK),又稱絲裂原活化蛋白激酶,是普遍存在于真核生物中的一類絲氨酸(Ser)/蘇氨酸(Thr)蛋白質(zhì)激酶。MAPK級聯(lián)反應(yīng)信號系統(tǒng)在進(jìn)化中高度保守,由促分裂原活化蛋白激酶激酶激酶(MAPKKK)、促分裂原活化蛋白激酶激酶(MAPKK

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 陳曉華;蔡國平;;人致肺纖維化相關(guān)因子的克隆和生物信息學(xué)分析[J];生物化學(xué)與生物物理進(jìn)展;2006年07期

2 王銳;趙躍;張永云;李衛(wèi)真;王淑燕;霍海龍;劉麗仙;苗永旺;霍金龍;;豬胰島素樣生長因子-Ⅰ的克隆及生物信息學(xué)分析[J];西南農(nóng)業(yè)學(xué)報(bào);2014年02期

3 譚從娥;王米渠;馮文哲;徐全壹;;生物信息學(xué)分析寒證海量數(shù)據(jù)的探索[J];中華中醫(yī)藥學(xué)刊;2008年12期

4 程勇前;成軍;劉妍;王琳;徐東平;鐘彥偉;曲建慧;趙平;;鈣離子調(diào)節(jié)親環(huán)素配體及其不同剪接體的克隆及生物信息學(xué)分析[J];醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報(bào);2008年05期

5 盧雪梅;金小寶;朱家勇;沈娟;梅寒芳;馬艷;肖明珠;褚夫江;;人溶菌酶基因的克隆和生物信息學(xué)分析[J];生物技術(shù);2010年06期

6 牛偉濤;;家蠶中一未知基因的生物信息學(xué)分析[J];邢臺(tái)學(xué)院學(xué)報(bào);2011年02期

7 胡甘雨;司風(fēng)玲;車燕飛;張玉娟;陳斌;;蔥蠅過氧化氫酶基因的克隆及生物信息學(xué)分析[J];西南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)版);2014年01期

8 楊向東,王仁,劉俊文,唐蔚青,李紅霞,王抒;一個(gè)新的人突觸相關(guān)蛋白基因的生物信息學(xué)分析[J];中國動(dòng)脈硬化雜志;2004年01期

9 張艷宇,馬平,陸一鳴,呂麗萍,姜升陽,周錫鵬,孫樹漢,許金波;尖吻蝮蛇類凝血酶基因的克隆及生物信息學(xué)分析[J];中國實(shí)驗(yàn)血液學(xué)雜志;2005年04期

10 張孝勇;崔光彬;杜滂;馬克軍;王亞蓉;韓葦;顏真;張英起;魏經(jīng)國;;兔大電導(dǎo)鈣敏感性鉀離子通道β亞基的克隆及生物信息學(xué)分析[J];第四軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào);2007年09期

中國重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 唐愛發(fā);余振東;桂耀庭;郭新;李賢新;周錦堂;朱輝;蔡志明;;SPACA4基因在人和小鼠的表達(dá)及其生物信息學(xué)分析[A];遺傳學(xué)進(jìn)步與人口健康高峰論壇論文集[C];2007年

2 劉惠君;譚宇蓉;劉持;向陽;屈飛;秦曉群;;BRS-3相互作用新基因的生物信息學(xué)分析及功能研究[A];湖南省生理科學(xué)會(huì)2008年度學(xué)術(shù)年會(huì)論文摘要匯編[C];2008年

3 黃浩;陸啟軒;陳臨溪;楊莉;毛小環(huán);李蘭芳;秦旭平;曹建剛;;APJ受體的生物信息學(xué)分析[A];全國第十二屆生化與分子藥理學(xué)學(xué)術(shù)會(huì)議論文集[C];2011年

4 陳大清;吳功慶;李亞男;;淹水脅迫下薏苡根系adh基因的克隆及其生物信息學(xué)分析[A];2005'海峽兩岸植物生理與分子生物學(xué)教學(xué)研討會(huì)論文集[C];2005年

5 田琪琳;施定基;賈曉會(huì);王曉燕;黃希文;何培民;;真核藻PEPC的生物信息學(xué)分析[A];中國藻類學(xué)會(huì)第八次會(huì)員代表大會(huì)暨第十六次學(xué)術(shù)討論會(huì)論文摘要集[C];2011年

6 易樂飛;閻斌倫;王萍;滕亞娟;周向紅;;條斑紫菜HSP70基因克隆與生物信息學(xué)分析[A];慶祝中國藻類學(xué)會(huì)成立30周年暨第十五次學(xué)術(shù)討論會(huì)摘要集[C];2009年

7 張?zhí)?李祥龍;周榮艷;李蘭會(huì);任玉紅;趙駐軍;;不同物種Oct-1基因編碼區(qū)生物信息學(xué)分析[A];中國畜牧獸醫(yī)學(xué)會(huì)養(yǎng)羊?qū)W分會(huì)2012年全國養(yǎng)羊生產(chǎn)與學(xué)術(shù)研討會(huì)議論文集[C];2012年

8 楊波;盧學(xué)春;遲小華;韓為東;于力;樓方定;;基于生物信息學(xué)分析人類LRP16基因功能初步研究[A];第12屆全國實(shí)驗(yàn)血液學(xué)會(huì)議論文摘要[C];2009年

9 王芳;李凱彬;劉坡;劉春;吳淑勤;;劍尾魚補(bǔ)體基因C3全長cDNA克隆與生物信息學(xué)分析[A];第九屆中國實(shí)驗(yàn)動(dòng)物科學(xué)年會(huì)（2010新疆）論文集[C];2010年

10 周文靈;楊麗霞;李玲;;野葛UDP-葡糖基轉(zhuǎn)移酶基因克隆與生物信息學(xué)分析[A];廣東省植物學(xué)會(huì)第十七期學(xué)術(shù)研討會(huì)論文集[C];2008年

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前4條

1 陳蕾;原始蛋白酶結(jié)構(gòu)功能的生物信息學(xué)分析及化學(xué)基礎(chǔ)[D];山東師范大學(xué);2009年

2 蘇志熙;幾種哺乳動(dòng)物表達(dá)序列標(biāo)簽（EST）生物信息學(xué)分析[D];浙江大學(xué);2006年

3 趙佳媛;靈長類二氧化碳感知通路相關(guān)基因的進(jìn)化及生物信息學(xué)分析[D];復(fù)旦大學(xué);2010年

4 馬永平;含質(zhì)粒人兩歧雙歧桿菌的分離、質(zhì)粒測序和生物信息學(xué)分析[D];重慶醫(yī)科大學(xué);2005年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 楊蓓;豬TTV1-ORF1和TTV2-ORF1基因的克隆、表達(dá)及生物信息學(xué)分析[D];石河子大學(xué);2015年

2 曹峰;小鼠胚胎干細(xì)胞核心轉(zhuǎn)錄因子調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的生物信息學(xué)分析[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2008年

3 王翊;CEM15基因的生物信息學(xué)分析[D];電子科技大學(xué);2005年

4 王芳;一個(gè)家蠅未知功能基因的克隆及其生物信息學(xué)分析[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2011年

5 王林;腸三葉因子受體的分離、鑒定及其生物信息學(xué)分析[D];第三軍醫(yī)大學(xué);2009年

6 王斌;C-反應(yīng)蛋白在脲變性過程中的折疊及其生物信息學(xué)分析[D];蘭州大學(xué);2012年

7 呂素芳;交鏈孢菌基因p42A的原核表達(dá)、純化及生物信息學(xué)分析[D];安徽農(nóng)業(yè)大學(xué);2006年

8 夏飛虹;Reticulon 3與Fibulin 5的生物信息學(xué)分析及相互作用[D];中南大學(xué);2013年

9 馬倩;蛋白質(zhì)泛素化的生物信息學(xué)分析[D];中國科學(xué)技術(shù)大學(xué);2011年

10 謝冰心;擬南芥SPO11基因的生物信息學(xué)分析[D];鄭州大學(xué);2014年

，

本文編號：681372