本文關(guān)鍵詞：兩種不同生境植物棉花與雪蓮CDPK1基因的克隆及生物信息學(xué)分析

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【摘要】：為了研究兩種不同生境植物鈣依賴性蛋白激酶基因1(CDPK1)的差異,分別從冷敏感作物陸地棉和高耐寒植物天山雪蓮中克隆得到GhCDPK1和SikCDPK1基因。通過生物信息學(xué)分析發(fā)現(xiàn),GhCDPK1和SikCDPK1的開放閱讀框長度分別為1 764 bp和1 716 bp,各編碼587和571個氨基酸。蛋白質(zhì)表現(xiàn)為弱酸性,且不穩(wěn)定,親水;二級結(jié)構(gòu)中以無規(guī)則卷曲和α-螺旋為主,三級結(jié)構(gòu)同源建模成功;無跨膜結(jié)構(gòu)域和信號肽,有多個磷酸化位點,但數(shù)量存在差異;均具有典型的CDPK保守結(jié)構(gòu)域。GhCDPK1和SikCDPK1氨基酸序列同源性為79.9%,二者明顯的區(qū)別在于GhCDPK1含有4個EF-hand基序,但SikCDPK1只存在2個EF-hand基序。進化分析結(jié)果表明,GhCDPK1與可可CDPK1親緣關(guān)系最近,SikCDPK1與菊花CDPK2親緣關(guān)系最近。
【作者單位】： 石河子大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院農(nóng)業(yè)生物技術(shù)重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】： 鈣依賴性蛋白激酶(CDPK) 生物信息學(xué) 序列分析 結(jié)構(gòu)預(yù)測
【基金】：新疆生產(chǎn)建設(shè)兵團項目(2014CC005) 國家自然科學(xué)基金項目(31360053) 石河子大學(xué)育種專項(gxjs2014-yz04)
【分類號】：Q943.2
【正文快照】： 極端溫度、干旱和土地鹽漬化等逆境嚴重影響學(xué)院棉花研究所提供,天山雪蓮(Sasussured involu-農(nóng)作物的生長、發(fā)育和產(chǎn)量。研究作物抗性分子機crata Kar.et Kir)無菌苗由石河子大學(xué)農(nóng)業(yè)生物技理,提高作物對逆境的適應(yīng)性是提高農(nóng)作物產(chǎn)量與術(shù)重點實驗室保存。品質(zhì)的基礎(chǔ)。外界刺

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