雞miR-17-92基因簇上游調(diào)控區(qū)功能分析
發(fā)布時間:2017-08-11 19:28
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【摘要】:miR-17-92基因簇(miR-17-92 cluster)在細胞增殖、分化、凋亡、動物發(fā)育以及腫瘤發(fā)生等過程中發(fā)揮重要作用。目前,人和小鼠等哺乳動物miR-17-92基因簇的轉(zhuǎn)錄調(diào)控已有深入研究,但該基因簇在雞等鳥類中的轉(zhuǎn)錄調(diào)控研究還未見報道,主要原因在于鳥類miR-17-92基因簇上游的基因組序列都存在一個gap,且該基因簇啟動子的位置和序列也還不清楚。為此,本研究采用染色體步移的方法獲得雞miR-17-92基因簇上游gap區(qū)序列,并采用生物信息學分析和報告基因及截短突變技術(shù)開展該gap區(qū)的功能分析。染色體步移分析發(fā)現(xiàn),雞miR-17-92基因簇上游gap區(qū)全長1704 bp,GC含量達80.11%。生物信息學分析顯示,雞miR-17-92基因簇上游gap區(qū)內(nèi)1段200 bp的序列與人、牛、小鼠等9種動物miR-17-92基因簇上游序列保守性較高,且該區(qū)域為人和小鼠等哺乳動物miR-17-92基因簇宿主基因的核心啟動子區(qū)。將克隆的gap區(qū)序列插入pGL3 basic熒光素酶報告基因載體,構(gòu)建成啟動子熒光素酶報告基因載體pGL3-cMIR17HG(-4228/-2506)。熒光素酶報告基因活性分析表明,p GL3-c MIR17HG(-4228/-2506)報告基因的活性是pGL3 basic空載體活性的417倍,證明所克隆的gap區(qū)片段是雞miR-17-92基因簇宿主基因的啟動子。為進一步分析該啟動子的結(jié)構(gòu)和功能,構(gòu)建gap區(qū)片段的5'端缺失突變(缺失448 bp)和3'端缺失突變(缺失894 bp)的熒光素酶報告基因載體。與pGL3-cMIR17HG(-4228/-2506)相比,5'端和3'端缺失突變分別使啟動子報告基因活性降低19.82%和60.14%。這些數(shù)據(jù)提示,雞miR-17-92基因簇宿主基因啟動子的重要調(diào)控區(qū)位于-3400/-2506。本研究結(jié)果為進一步開展雞miR-17-92基因簇的轉(zhuǎn)錄調(diào)控奠定了基礎(chǔ)。
【作者單位】: 農(nóng)業(yè)部雞遺傳育種重點實驗室;黑龍江省普通高等學校動物遺傳育種與繁殖重點實驗室;東北農(nóng)業(yè)大學動物科學技術(shù)學院;
【關(guān)鍵詞】: 雞 miR--基因簇 啟動子 轉(zhuǎn)錄調(diào)控
【基金】:國家自然科學基金項目(編號:31372299) 農(nóng)業(yè)部產(chǎn)業(yè)體系項目(編號:CARS-42)資助~~
【分類號】:Q78;S831
【正文快照】: 2.黑龍江省普通高等學校動物遺傳育種與繁殖重點實驗室,哈爾濱150030;3.東北農(nóng)業(yè)大學動物科學技術(shù)學院,哈爾濱150030mi R-17-92基因簇(mi R-17-92 cluster)在細胞增殖、分化、凋亡、動物發(fā)育以及腫瘤發(fā)生等過程中發(fā)揮重要作用。目前,人和小鼠等哺乳動物mi R-17-92基因簇的轉(zhuǎn)錄
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本文編號:657911
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