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《華中農業(yè)大學》2006年碩士論文

發(fā)布時間:2016-06-30 22:08

  本文關鍵詞:枳抗逆基因的克隆及功能鑒定,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


《華中農業(yè)大學》 2006年

枳PPF-1同源基因的克隆及表達特性分析

羅海瀾  

【摘要】: 柑橘是我國的主栽果樹之一。以枳(Poncirus trifoliata(L.)Raf.)為遺傳資源培育抗性柑橘新種質是柑橘育種的主要內容之一。PPF-1是與開花、衰老及逆境有關的基因,本研究克隆了枳PPF-1同源基因PtPPF-1,并對其表達特性進行了分析。主要結果如下: 根據豌豆PPF-1、擬南芥ALBINO3的cDNA全長序列比對結果設計引物,通過RT-PCR及3′-RACE擴增得到了枳PPF-1同源基因的cDNA克隆片段(命名PtPPF-1),該基因全長1493bp,編碼一條長452個氨基酸殘基的多肽,理論分子量為125.1kD,等電點為4.92。經蛋白結構預測發(fā)現其含有一個長為36個氨基酸殘基的葉綠體定位信號域和五個跨膜結構域。氨基酸序列比對表明,,PtPPF-1與豌豆PPF-1、擬南芥ALBINO3、水稻PPF-1相似性較高,與衣藻ALB3.2、性原細胞ALB3-1、綠領鞭藻類ALBINO3等同源蛋白相似性相對較低。 系統(tǒng)發(fā)育分析表明,PtPPF-1與豌豆PPF-1親緣關系最近,其次為擬南芥ALBINO3和水稻PPF-1,四者同屬一小族,說明PPF-1基因在進化過程中可能變異較小。 采用半定量RT-PCR對PtPPF-1的表達特性進行了分析。結果表明,PtPPF-1的表達量在枳葉片中最高,頂芽中次之,再次為莖,在根中沒有檢測到表達;而其紅橘(Citrus tangerine Hort.ex Tanaka)的PPF-1同源基因在頂芽、葉片和莖中的表達沒有差別。說明PtPPF-1的表達不僅具有組織特異性,而且種屬間也存在差異。這可能與PtPPF-1基因含有葉綠體定位信號肽有關及枳抗性有關。 對不同植物生長調節(jié)劑處理枳葉中PtPPF-1表達情況進行了分析,結果表明GA_3、IAA、ABA促進了PtPPF-1的表達,KT對PtPPF-1的表達有抑制作用。推測GA_3、IAA、ABA信號通路可能與KT信號通路作用于PtPPF-1的表達存在不同的機制。PtPPF-1可能作為植物生長調節(jié)劑信號因子的一個下游信號元件存在,參與信號傳導。 采用半定量RT-PCR對非生物脅迫(低溫、干旱、鹽)下枳的生理指標及PtPPF-1的表達情況進行了分析。結果表明,這三種脅迫都能誘導PtPPF-1的表達。說明PtPPF-1基因能響應這三種脅迫。SOD、POD活性在三種脅迫中均較高,CAT活性在三種脅迫中處于低水平;脯氨酸含量在三種脅迫中均表現為持續(xù)上升。三種脅迫中尤其是低溫脅迫SOD、POD活性及脯氨酸含量的變化趨勢與PtPPF-1的表達有很大的相似性,推測PtPPF-1基因可能與SOD、POD及脯氨酸之間存在一定的聯系,并可以作為逆境脅迫標志物。

【關鍵詞】:
【學位授予單位】:華中農業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2006
【分類號】:S666
【目錄】:

  • 縮略詞表5-6
  • 摘要6-7
  • Abstracts7-9
  • 1 前言9-21
  • 1.1 問題的提出9-10
  • 1.2 前人研究進展10-20
  • 1.2.1 植物低溫、干旱與鹽脅迫研究現狀10-12
  • 1.2.2 柑橘低溫、干旱和鹽脅迫研究進展12-16
  • 1.2.3 PPF-1基因的研究現狀16-17
  • 1.2.4 植物基因克隆方法17-20
  • 1.3 研究內容、目的與意義20-21
  • 2 材料與方法21-28
  • 2.1 材料與試劑21-22
  • 2.1.1 材料21-22
  • 2.2 試驗方法22-28
  • 2.2.1 總RNA的提取22-23
  • 2.2.2 總RNA定量與完整性檢測23
  • 2.2.3 cDNA第一鏈的合成23
  • 2.2.4 PCR擴增條件23-25
  • 2.2.5 目的片段的回收25
  • 2.2.6 目的片段與載體連接25
  • 2.2.7 CaCl_2法制備感受態(tài)細胞25
  • 2.2.8 目的片段的轉化及克隆鑒定25-26
  • 2.2.9 PtPPF-1在枳和紅橘各組織中表達情況分析26
  • 2.2.10 不同植物生長調節(jié)劑處理對枳葉中PtPPF-1表達情況分析26
  • 2.2.11 低溫、干旱、鹽處理對枳葉片生理指標的影響及PtPPF-1表達情況析26
  • 2.2.12 序列測定26
  • 2.2.13 生物信息學分析26-28
  • 3 結果與分析28-42
  • 3.1 PtPPF-1的克隆28-29
  • 3.1.1 PtPPF-1中間編碼區(qū)的擴增28
  • 3.1.2 PtPPF-1 3′ cDNA末端的擴增28
  • 3.1.3 PtPPF-1 5′ cDNA末端的擴增28-29
  • 3.1.4 PtPPF-1 cDNA全長的擴增29
  • 3.2 PtPPF-1的核酸序列分析29-31
  • 3.3 PtPPF-1的蛋白質序列分析31-34
  • 3.4 PtPPF-1及其同源序列的結構域分析34-35
  • 3.5 PtPPF-1的系統(tǒng)發(fā)育分析35-36
  • 3.6 PtPPF-1在枳殼和紅橘各組織中表達情況分析36-37
  • 3.7 不同植物生長調節(jié)劑處理對枳殼葉中PtPPF-1表達情況分析37
  • 3.8 低溫、干旱、鹽處理對枳葉片生理指標的影響及PtPPF-1表達情況分析37-42
  • 3.8.1 低溫、干旱、鹽處理對枳葉片SOD活性的影響38
  • 3.8.2 低溫、干旱、鹽處理對葉片POD活性的影響38-39
  • 3.8.3 低溫、干旱、鹽處理對葉片CAT活性的影響39
  • 3.8.4 低溫、干旱、鹽處理對葉片脯氨酸含量的影響39-40
  • 3.8.5 低溫、干旱、鹽處理對可溶性蛋白含量的影響40-41
  • 3.8.6 低溫、干旱、鹽處理對枳葉片中PtPPF-1的表達情況分析41-42
  • 4 小結與討論42-45
  • 4.1 PtPPF-1氨基酸序列的特性42
  • 4.2 PtPPF-1在組織中的表達情況分析42
  • 4.3 GA_3、IAA、ABA及KT對PtPPF-1表達的影響42-43
  • 4.4 低溫、干旱、鹽處理對PtPPF-1表達及枳葉片生理指標的影響43-45
  • 4.4.1 低溫、干旱、鹽處理對枳葉片PtPPF-1表達的影響43
  • 4.4.2 低溫、干旱、鹽處理對枳葉片生理指標的影響43-45
  • 參考文獻45-47
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    本文編號:64145

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